RAB7A

RAB7A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1T91, 1YHN, 3LAW
Ідентифікатори
Символи	RAB7A, PRO2706, RAB7, member RAS oncogene family, CMT2B
Зовнішні ІД	OMIM: 602298 MGI: 105068 HomoloGene: 3408 GeneCards: RAB7A
Пов'язані генетичні захворювання
	Charcot-Marie-Tooth disease type 2B[1]
Реагує на сполуку
	Viroporin 3a [SARS-CoV-2][2]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • GTP binding; • GO:0001948 protein binding; • retromer complex binding; • GO:0006184 GTPase activity; • GDP binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • phagophore assembly site membrane; • ендосома; • phagocytic vesicle membrane; • комплекс Ґольджі; • late endosome; • мембрана; • late endosome membrane; • extrinsic component of lysosome membrane; • lipid droplet; • melanosome membrane; • retromer complex; • lysosomal membrane; • autophagosome membrane; • phagocytic vesicle; • Лізосома; • Екзосома; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • гіалоплазма; • клітинна мембрана; • endosome membrane; • secretory granule membrane; • terminal bouton; • alveolar lamellar body; • vacuolar membrane; • внутрішньоклітинний;
Біологічний процес	• protein to membrane docking; • protein targeting to lysosome; • lipophagy; • viral release from host cell; • positive regulation of protein catabolic process; • phagosome-lysosome fusion; • Ендоцитоз; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II; • lipid metabolism; • endosome to lysosome transport; • phagosome acidification; • Автофагія; • lipid catabolic process; • phagosome maturation; • early endosome to late endosome transport; • retrograde transport, endosome to Golgi; • protein transport; • positive regulation of exosomal secretion; • epidermal growth factor catabolic process; • positive regulation of viral process; • neutrophil degranulation; • negative regulation of exosomal secretion; • negative regulation of intralumenal vesicle formation; • autophagosome assembly; • bone resorption; • транспорт; • intracellular protein transport; • Rab protein signal transduction; • small GTPase mediated signal transduction;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	7879
	19349
	ENSG00000075785
	ENSMUSG00000079477
	P51149
	P51150
	NM_004637
	NM_001293652; NM_001293653; NM_001293654; NM_001293655; NM_009005
	NP_004628
	NP_001280581; NP_001280582; NP_001280583; NP_001280584; NP_033031
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RAB7A (англ. RAB7A, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 207 амінокислот, а молекулярна маса — 23 490[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTSRKKVLLK	VIILGDSGVG	KTSLMNQYVN	KKFSNQYKAT	IGADFLTKEV
MVDDRLVTMQ	IWDTAGQERF	QSLGVAFYRG	ADCCVLVFDV	TAPNTFKTLD
SWRDEFLIQA	SPRDPENFPF	VVLGNKIDLE	NRQVATKRAQ	AWCYSKNNIP
YFETSAKEAI	NVEQAFQTIA	RNALKQETEV	ELYNEFPEPI	KLDKNDRAKA
SAESCSC

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як метаболізм ліпідів, транспорт, транспорт білків, деградація ліпідів, автофагія. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у мембрані, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, ліпідних краплях, ендосомах.

Література

Vitelli R., Chiariello M., Lattero D., Bruni C.B., Bucci C. (1996). Molecular cloning and expression analysis of the human Rab7 GTP-ase complementary deoxyribonucleic acid.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 229: 887 — 890. PubMed DOI:10.1006/bbrc.1996.1897
Davies J.P., Cotter P.D., Ioannou Y.A. (1997). Cloning and mapping of human Rab7 and Rab9 cDNA sequences and identification of a Rab9 pseudogene.. Genomics 41: 131 — 134. PubMed DOI:10.1006/geno.1997.4644
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Cantalupo G., Alifano P., Roberti V., Bruni C.B., Bucci C. (2001). Rab-interacting lysosomal protein (RILP): the Rab7 effector required for transport to lysosomes.. EMBO J. 20: 683 — 693. PubMed DOI:10.1093/emboj/20.4.683
Harrison R.E., Bucci C., Vieira O.V., Schroer T.A., Grinstein S. (2003). Phagosomes fuse with late endosomes and/or lysosomes by extension of membrane protrusions along microtubules: role of Rab7 and RILP.. Mol. Cell. Biol. 23: 6494 — 6506. PubMed DOI:10.1128/MCB.23.18.6494-6506.2003
Stein M.P., Feng Y., Cooper K.L., Welford A.M., Wandinger-Ness A. (2003). Human VPS34 and p150 are Rab7 interacting partners.. Traffic 4: 754 — 771. PubMed DOI:10.1034/j.1600-0854.2003.00133.x

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з RAB7A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Сполуки, які фізично взаємодіють з RAB7A, member RAS oncogene family переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9788 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.
UniProt, P51149 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

Хромосома 3

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з RAB7A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з RAB7A, member RAS oncogene family переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9788 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.

[UniProt-6] UniProt, P51149 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.