RCAN1

RCAN1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1WEY
Ідентифікатори
Символи	RCAN1, ADAPT78, CSP1, DSC1, DSCR1, MCIP1, RCN1, regulator of calcineurin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602917 MGI: 1890564 HomoloGene: 3251 GeneCards: RCAN1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • DNA binding; • GO:0001948 protein binding; • calcium-dependent protein serine/threonine phosphatase regulator activity; • identical protein binding; • nucleic acid binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• regulation of calcineurin-NFAT signaling cascade; • central nervous system development; • calcineurin-NFAT signaling cascade; • кровообіг; • Сигнальна трансдукція; • calcium-mediated signaling; • regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of phosphoprotein phosphatase activity; • negative regulation of calcineurin-NFAT signaling cascade;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	1827
	54720
	ENSG00000159200
	ENSMUSG00000022951
	P53805
	Q9JHG6
NM_001285389; NM_001285391; NM_001285392; NM_001285393; NM_004414;
	NM_203417; NM_203418; NM_001331016
	NM_001081549; NM_019466
NP_001272318; NP_001272320; NP_001272321; NP_001272322; NP_001317945;
	NP_004405; NP_981962; NP_981963
	NP_001075018; NP_062339
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RCAN1 (англ. Regulator of calcineurin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 252 амінокислот, а молекулярна маса — 28 079[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEDGVAGPQL	GAAAEAAEAA	EARARPGVTL	RPFAPLSGAA	EADEGGGDWS
FIDCEMEEVD	LQDLPSATIA	CHLDPRVFVD	GLCRAKFESL	FRTYDKDITF
QYFKSFKRVR	INFSNPFSAA	DARLQLHKTE	FLGKEMKLYF	AQTLHIGSSH
LAPPNPDKQF	LISPPASPPV	GWKQVEDATP	VINYDLLYAI	SKLGPGEKYE
LHAATDTTPS	VVVHVCESDQ	EKEEEEEMER	MRRPKPKIIQ	TRRPEYTPIH
LS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

Fuentes J.-J., Pritchard M.A., Estivill X. (1997). Genomic organization, alternative splicing, and expression patterns of the DSCR1 (Down syndrome candidate region 1) gene.. Genomics 44: 358 — 361. PubMed DOI:10.1006/geno.1997.4866
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Cho Y.J., Abe M., Kim S.Y., Sato Y. (2005). Raf-1 is a binding partner of DSCR1.. Arch. Biochem. Biophys. 439: 121 — 128. PubMed DOI:10.1016/j.abb.2005.05.002

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3040 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, P53805 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 21

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3040 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P53805 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.