S100A4

S100A4
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1M31, 2LNK, 2MRD, 2Q91, 3C1V, 3CGA, 3KO0, 3M0W, 3ZWH, 4CFQ, 4CFR, 4ETO, 4HSZ
Ідентифікатори
Символи	S100A4, 18A2, 42A, CAPL, FSP1, MTS1, P9KA, PEL98, S100 calcium binding protein A4
Зовнішні ІД	OMIM: 114210 MGI: 1330282 HomoloGene: 7924 GeneCards: S100A4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • actin binding; • GO:0001948 protein binding; • calcium-dependent protein binding; • зв'язування з іоном металу; • RAGE receptor binding; • RNA binding; • transition metal ion binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• perinuclear region of cytoplasm; • neuron projection; • Екзосома; • клітинне ядро; • extracellular space; • extracellular region; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • Епітеліально-мезенхімальний перехід;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6275
	20198
	ENSG00000196154
	ENSMUSG00000001020
	P26447
	P07091
	NM_019554; NM_002961
	NM_011311
	NP_002952; NP_062427
	NP_035441
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

S100A4 (англ. S100 calcium binding protein A4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 101 амінокислот, а молекулярна маса — 11 729[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MACPLEKALD	VMVSTFHKYS	GKEGDKFKLN	KSELKELLTR	ELPSFLGKRT
DEAAFQKLMS	NLDSNRDNEV	DFQEYCVFLS	CIAMMCNEFF	EGFPDKQPRK
K

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію.

Література

Engelkamp D., Schaefer B.W., Erne P., Heizmann C.W. (1992). S100 alpha, CAPL, and CACY: molecular cloning and expression analysis of three calcium-binding proteins from human heart.. Biochemistry 31: 10258 — 10264. PubMed DOI:10.1021/bi00157a012
Engelkamp D., Schaefer B.W., Mattei M.-G., Erne P., Heizmann C.W. (1993). Six S100 genes are clustered on human chromosome 1q21: identification of two genes coding for the two previously unreported calcium-binding proteins S100D and S100E.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 6547 — 6551. PubMed DOI:10.1073/pnas.90.14.6547
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Tomida Y., Terasawa M., Kobayashi R., Hidaka H. (1992). Calcyclin and calvasculin exist in human platelets.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 189: 1310 — 1316. PubMed DOI:10.1016/0006-291X(92)90216-8

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10494 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.
UniProt, P26447 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10494 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P26447 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.