S100A7

S100A7
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1PSR, 2PSR, 2WND, 2WOR, 2WOS, 3PSR, 4AQJ
Ідентифікатори
Символи	S100A7, PSOR1, S100A7c, S100 calcium binding protein A7
Зовнішні ІД	OMIM: 600353 HomoloGene: 48150 GeneCards: S100A7
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • zinc ion binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948 protein binding; • RAGE receptor binding; • transition metal ion binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • focal adhesion; • extracellular region; • ендоплазматичний ретикулум; • клітинне ядро; • azurophil granule lumen; • extracellular space; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• response to reactive oxygen species; • positive regulation of monocyte chemotaxis; • keratinocyte differentiation; • positive regulation of granulocyte chemotaxis; • sequestering of metal ion; • response to lipopolysaccharide; • positive regulation of T cell chemotaxis; • Ангіогенез; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • epidermis development; • Вроджений імунітет; • antimicrobial humoral response; • neutrophil degranulation; • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6278
	н/д
	ENSG00000143556
	н/д
	P31151
	н/д
	NM_002963
	н/д
	NP_002954
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей

S100A7 (англ. S100 calcium binding protein A7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 101 амінокислот, а молекулярна маса — 11 471[3].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSNTQAERSI	IGMIDMFHKY	TRRDDKIEKP	SLLTMMKENF	PNFLSACDKK
GTNYLADVFE	KKDKNEDKKI	DFSEFLSLLG	DIATDYHKQS	HGAAPCSGGS
Q

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Kulski J.K., Lim C.P., Dunn D.S., Bellgard M. (2003). Genomic and phylogenetic analysis of the S100A7 (psoriasin) gene duplications within the region of the S100 gene cluster on human chromosome 1q21.. J. Mol. Evol. 56: 397 — 406. PubMed DOI:10.1007/s00239-002-2410-5
Brodersen D.E., Nyborg J., Kjeldgaard M. (1999). Zinc-binding site of an S100 protein revealed. Two crystal structures of Ca2+-bound human psoriasin (S100A7) in the Zn2+-loaded and Zn2+-free states.. Biochemistry 38: 1695 — 1704. PubMed DOI:10.1021/bi982483d

Примітки

Human PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10497 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.
UniProt, P31151 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[HGNC-2] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10497 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

[UniProt-3] UniProt, P31151 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.