SELP

SELP
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1FSB, 1G1Q, 1G1R, 1G1S, 1HES
Ідентифікатори
Символи	SELP, CD62, CD62P, GMP140, GRMP, LECAM3, PADGEM, PSEL, selectin P
Зовнішні ІД	OMIM: 173610 MGI: 98280 HomoloGene: 2260 GeneCards: SELP
Онтологія гена
Молекулярна функція	• heparin binding; • oligosaccharide binding; • lipopolysaccharide binding; • calcium-dependent protein binding; • glycosphingolipid binding; • fucose binding; • carbohydrate binding; • sialic acid binding; • GO:0001948 protein binding; • calcium ion binding; • зв'язування з іоном металу;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • platelet alpha granule membrane; • platelet dense granule membrane; • external side of plasma membrane; • extracellular space; • integral component of plasma membrane; • клітинна мембрана;
Біологічний процес	• leukocyte cell-cell adhesion; • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; • positive regulation of leukocyte migration; • platelet degranulation; • regulation of integrin activation; • Адгезія клітин; • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium; • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling; • inflammatory response; • calcium-mediated signaling using intracellular calcium source; • positive regulation of platelet activation; • leukocyte migration; • response to lipopolysaccharide; • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; • leukocyte tethering or rolling;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6403
	20344
	ENSG00000174175
	ENSMUSG00000026580
	P16109
	Q01102
	NM_003005
	NM_011347
	NP_002996; NP_002996.2
	NP_035477
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SELP (англ. Selectin P) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 830 амінокислот, а молекулярна маса — 90 834[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MANCQIAILY	QRFQRVVFGI	SQLLCFSALI	SELTNQKEVA	AWTYHYSTKA
YSWNISRKYC	QNRYTDLVAI	QNKNEIDYLN	KVLPYYSSYY	WIGIRKNNKT
WTWVGTKKAL	TNEAENWADN	EPNNKRNNED	CVEIYIKSPS	APGKWNDEHC
LKKKHALCYT	ASCQDMSCSK	QGECLETIGN	YTCSCYPGFY	GPECEYVREC
GELELPQHVL	MNCSHPLGNF	SFNSQCSFHC	TDGYQVNGPS	KLECLASGIW
TNKPPQCLAA	QCPPLKIPER	GNMTCLHSAK	AFQHQSSCSF	SCEEGFALVG
PEVVQCTASG	VWTAPAPVCK	AVQCQHLEAP	SEGTMDCVHP	LTAFAYGSSC
KFECQPGYRV	RGLDMLRCID	SGHWSAPLPT	CEAISCEPLE	SPVHGSMDCS
PSLRAFQYDT	NCSFRCAEGF	MLRGADIVRC	DNLGQWTAPA	PVCQALQCQD
LPVPNEARVN	CSHPFGAFRY	QSVCSFTCNE	GLLLVGASVL	QCLATGNWNS
VPPECQAIPC	TPLLSPQNGT	MTCVQPLGSS	SYKSTCQFIC	DEGYSLSGPE
RLDCTRSGRW	TDSPPMCEAI	KCPELFAPEQ	GSLDCSDTRG	EFNVGSTCHF
SCDNGFKLEG	PNNVECTTSG	RWSATPPTCK	GIASLPTPGL	QCPALTTPGQ
GTMYCRHHPG	TFGFNTTCYF	GCNAGFTLIG	DSTLSCRPSG	QWTAVTPACR
AVKCSELHVN	KPIAMNCSNL	WGNFSYGSIC	SFHCLEGQLL	NGSAQTACQE
NGHWSTTVPT	CQAGPLTIQE	ALTYFGGAVA	STIGLIMGGT	LLALLRKRFR
QKDDGKCPLN	PHSHLGTYGV	FTNAAFDPSP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з лектинами. Локалізований у мембрані.

Література

Johnston G.I., Cook R.G., McEver R.P. (1989). Cloning of GMP-140, a granule membrane protein of platelets and endothelium: sequence similarity to proteins involved in cell adhesion and inflammation.. Cell 56: 1033 — 1044. PubMed DOI:10.1016/0092-8674(89)90636-3
Pouyani T., Seed B. (1995). PSGL-1 recognition of P-selectin is controlled by a tyrosine sulfation consensus at the PSGL-1 amino terminus.. Cell 83: 333 — 343. PubMed DOI:10.1016/0092-8674(95)90174-4
Wilkins P.P., Moore K.L., McEver R.P., Cummings R.D. (1995). Tyrosine sulfation of P-selectin glycoprotein ligand-1 is required for high affinity binding to P-selectin.. J. Biol. Chem. 270: 22677 — 22680. PubMed DOI:10.1074/jbc.270.39.22677
Florian V., Schlueter T., Bohnensack R. (2001). A new member of the sorting nexin family interacts with the C-terminus of P-selectin.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 281: 1045 — 1050. PubMed DOI:10.1006/bbrc.2001.4467
Lewandrowski U., Moebius J., Walter U., Sickmann A. (2006). Elucidation of N-glycosylation sites on human platelet proteins: a glycoproteomic approach.. Mol. Cell. Proteomics 5: 226 — 233. PubMed DOI:10.1074/mcp.M500324-MCP200
Kerr S.C., Fieger C.B., Snapp K.R., Rosen S.D. (2008). Endoglycan, a member of the CD34 family of sialomucins, is a ligand for the vascular selectins.. J. Immunol. 181: 1480 — 1490. PubMed DOI:10.4049/jimmunol.181.2.1480

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10721 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.
UniProt, P16109 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10721 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P16109 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.