SEMA7A

SEMA7A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3NVQ
Ідентифікатори
Символи	SEMA7A, CD108, CDw108, H-SEMA-K1, H-Sema-L, JMH, SEMAK1, SEMAL, semaphorin 7A (John Milton Hagen blood group)
Зовнішні ІД	OMIM: 607961 MGI: 1306826 HomoloGene: 2678 GeneCards: SEMA7A
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948 protein binding; • integrin binding; • neuropilin binding; • semaphorin receptor binding; • chemorepellent activity;
Клітинна компонента	• мембрана; • клітинна мембрана; • anchored component of membrane; • extracellular space; • external side of plasma membrane; • integral component of plasma membrane; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• Диференціація клітин; • positive regulation of protein phosphorylation; • нейробіологія розвитку; • multicellular organism development; • osteoblast differentiation; • Імунна відповідь; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • axon extension; • olfactory lobe development; • integrin-mediated signaling pathway; • positive regulation of axon extension; • inflammatory response; • neuron projection development; • regulation of inflammatory response; • negative chemotaxis; • positive regulation of macrophage cytokine production; • neural crest cell migration; • positive regulation of cell migration; • negative regulation of axon extension involved in axon guidance; • semaphorin-plexin signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	8482
	20361
	ENSG00000138623; ENSG00000288455
	ENSMUSG00000038264
	O75326
	Q9QUR8
	NM_003612; NM_001146029; NM_001146030
	NM_011352
	NP_001139501; NP_001139502; NP_003603
	NP_035482
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SEMA7A (англ. Semaphorin 7A (John Milton Hagen blood group)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 666 амінокислот, а молекулярна маса — 74 824[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTPPPPGRAA	PSAPRARVPG	PPARLGLPLR	LRLLLLLWAA	AASAQGHLRS
GPRIFAVWKG	HVGQDRVDFG	QTEPHTVLFH	EPGSSSVWVG	GRGKVYLFDF
PEGKNASVRT	VNIGSTKGSC	LDKRDCENYI	TLLERRSEGL	LACGTNARHP
SCWNLVNGTV	VPLGEMRGYA	PFSPDENSLV	LFEGDEVYST	IRKQEYNGKI
PRFRRIRGES	ELYTSDTVMQ	NPQFIKATIV	HQDQAYDDKI	YYFFREDNPD
KNPEAPLNVS	RVAQLCRGDQ	GGESSLSVSK	WNTFLKAMLV	CSDAATNKNF
NRLQDVFLLP	DPSGQWRDTR	VYGVFSNPWN	YSAVCVYSLG	DIDKVFRTSS
LKGYHSSLPN	PRPGKCLPDQ	QPIPTETFQV	ADRHPEVAQR	VEPMGPLKTP
LFHSKYHYQK	VAVHRMQASH	GETFHVLYLT	TDRGTIHKVV	EPGEQEHSFA
FNIMEIQPFR	RAAAIQTMSL	DAERRKLYVS	SQWEVSQVPL	DLCEVYGGGC
HGCLMSRDPY	CGWDQGRCIS	IYSSERSVLQ	SINPAEPHKE	CPNPKPDKAP
LQKVSLAPNS	RYYLSCPMES	RHATYSWRHK	ENVEQSCEPG	HQSPNCILFI
ENLTAQQYGH	YFCEAQEGSY	FREAQHWQLL	PEDGIMAEHL	LGHACALAAS
LWLGVLPTLT	LGLLVH

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як запальна відповідь, диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Pasterkamp R.J., Peschon J.J., Spriggs M.K., Kolodkin A.L. (2003). Semaphorin 7A promotes axon outgrowth through integrins and MAPKs.. Nature 424: 398 — 405. PubMed DOI:10.1038/nature01790
Scott G.A., McClelland L.A., Fricke A.F. (2008). Semaphorin 7a promotes spreading and dendricity in human melanocytes through beta1-integrins.. J. Invest. Dermatol. 128: 151 — 161. PubMed DOI:10.1038/sj.jid.5700974
Richard M., St-Laurent J., Perreault J., Long A., St-Louis M. (2011). A new SEMA7A variant found in Native Americans with alloantibody.. Vox Sang. 100: 322 — 326. PubMed DOI:10.1111/j.1423-0410.2010.01413.x
Angelisova P., Drbal K., Cerny J., Hilgert I., Horejsi V. (1999). Characterization of the human leukocyte GPI-anchored glycoprotein CDw108 and its relation to other similar molecules.. Immunobiology 200: 234 — 245. PubMed

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10741 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, O75326 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 15

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10741 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O75326 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.