SNCAIP

SNCAIP
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2KES
Ідентифікатори
Символи	SNCAIP, SYPH1, Sph1, synuclein alpha interacting protein
Зовнішні ІД	OMIM: 603779 MGI: 1915097 HomoloGene: 3987 GeneCards: SNCAIP
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948 protein binding; • ubiquitin protein ligase binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • neuronal cell body; • presynaptic membrane; • Синаптичні бульбашки; • Нуклеоплазма; • cytoplasmic ribonucleoprotein granule;
Біологічний процес	• cellular protein metabolic process; • regulation of inclusion body assembly; • dopamine metabolic process; • cell death; • regulation of neurotransmitter secretion;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	9627
	67847
	ENSG00000064692
	ENSMUSG00000024534
	Q9Y6H5
	Q99ME3
NM_001242935; NM_001308100; NM_001308105; NM_001308106; NM_001308107;
	NM_001308108; NM_001308109; NM_005460
	NM_001199151; NM_001199153; NM_001199154; NM_026408
NP_001229864; NP_001295029; NP_001295034; NP_001295035; NP_001295036;
	NP_001295037; NP_001295038; NP_005451
	NP_001186080; NP_001186082; NP_001186083; NP_080684
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SNCAIP (англ. Synuclein alpha interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 919 амінокислот, а молекулярна маса — 100 409[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEAPEYLDLD	EIDFSDDISY	SVTSLKTIPE	LCRRCDTQNE	DRSVSSSSWN
CGISTLITNT	QKPTGIADVY	SKFRPVKRVS	PLKHQPETLE	NNESDDQKNQ
KVVEYQKGGE	SDLGPQPQEL	GPGDGVGGPP	GKSSEPSTSL	GELEHYDLDM
DEILDVPYIK	SSQQLASFTK	VTSEKRILGL	CTTINGLSGK	ACSTGSSESS
SSNMAPFCVL	SPVKSPHLRK	ASAVIHDQHK	LSTEETEISP	PLVKCGSAYE
PENQSKDFLN	KTFSDPHGRK	VEKTTPDCQL	RAFHLQSSAA	ESKPEEQVSG
LNRTSSQGPE	ERSEYLKKVK	SILNIVKEGQ	ISLLPHLAAD	NLDKIHDENG
NNLLHIAASQ	GHAECLQHLT	SLMGEDCLNE	RNTEKLTPAG	LAIKNGQLEC
VRWMVSETEA	IAELSCSKDF	PSLIHYAGCY	GQEKILLWLL	QFMQEQGISL
DEVDQDGNSA	VHVASQHGYL	GCIQTLVEYG	ANVTMQNHAG	EKPSQSAERQ
GHTLCSRYLV	VVETCMSLAS	QVVKLTKQLK	EQTVERVTLQ	NQLQQFLEAQ
KSEGKSLPSS	PSSPSSPASR	KSQWKSPDAD	DDSVAKSKPG	VQEGIQVLGS
LSASSRARPK	AKDEDSDKIL	RQLLGKEISE	NVCTQEKLSL	EFQDAQASSR
NSKKIPLEKR	ELKLARLRQL	MQRSLSESDT	DSNNSEDPKT	TPVRKADRPR
PQPIVESVES	MDSAESLHLM	IKKHTLASGG	RRFPFSIKAS	KSLDGHSPSP
TSESSEPDLE	SQYPGSGSIP	PNQPSGDPQQ	PSPDSTAAQK	VATSPKSALK
SPSSKRRTSQ	NLKLRVTFEE	PVVQMEQPSL	ELNGEKDKDK	GRTLQRTSTS
NESGDQLKRP	FGAFRSIMET	LSGNQNNNNN	YQAANQLKTS	TLPLTSLGRK
TDAKGNPASS	ASKGKNKAA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Myhre R., Klungland H., Farrer M.J., Aasly J.O. (2008). Genetic association study of synphilin-1 in idiopathic Parkinson's disease.. BMC Med. Genet. 9: 19 — 19. PubMed DOI:10.1186/1471-2350-9-19

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11139 (англ.). Процитовано 5 вересня 2017.
UniProt, Q9Y6H5 (англ.). Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 5

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11139 (англ.). Процитовано 5 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9Y6H5 (англ.). Процитовано 5 вересня 2017.