SPARCL1

SPARCL1
Ідентифікатори
Символи	SPARCL1, MAST 9, MAST9, PIG33, SC1, SPARC like 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606041 MGI: 108110 HomoloGene: 3438 GeneCards: SPARCL1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу; • calcium ion binding; • collagen binding; • extracellular matrix binding; • GO:0001948 protein binding;
Клітинна компонента	• Екзосома; • extracellular space; • endoplasmic reticulum lumen; • extracellular region; • collagen-containing extracellular matrix; • glutamatergic synapse;
Біологічний процес	• Сигнальна трансдукція; • anatomical structure development; • посттрансляційна модифікація; • cellular protein metabolic process; • synaptic membrane adhesion;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	8404
	13602
	ENSG00000152583
	ENSMUSG00000029309
	Q14515
	P70663
	NM_004684; NM_001128310; NM_001291976; NM_001291977
	NM_010097; NM_001359014; NM_001359016
	NP_001121782; NP_001278905; NP_001278906; NP_004675
	NP_034227; NP_001345943; NP_001345945
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SPARCL1 (англ. SPARC like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 664 амінокислот, а молекулярна маса — 75 208[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKTGLFFLCL	LGTAAAIPTN	ARLLSDHSKP	TAETVAPDNT	AIPSLRAEAE
ENEKETAVST	EDDSHHKAEK	SSVLKSKEES	HEQSAEQGKS	SSQELGLKDQ
EDSDGHLSVN	LEYAPTEGTL	DIKEDMSEPQ	EKKLSENTDF	LAPGVSSFTD
SNQQESITKR	EENQEQPRNY	SHHQLNRSSK	HSQGLRDQGN	QEQDPNISNG
EEEEEKEPGE	VGTHNDNQER	KTELPREHAN	SKQEEDNTQS	DDILEESDQP
TQVSKMQEDE	FDQGNQEQED	NSNAEMEEEN	ASNVNKHIQE	TEWQSQEGKT
GLEAISNHKE	TEEKTVSEAL	LMEPTDDGNT	TPRNHGVDDD	GDDDGDDGGT
DGPRHSASDD	YFIPSQAFLE	AERAQSIAYH	LKIEEQREKV	HENENIGTTE
PGEHQEAKKA	ENSSNEEETS	SEGNMRVHAV	DSCMSFQCKR	GHICKADQQG
KPHCVCQDPV	TCPPTKPLDQ	VCGTDNQTYA	SSCHLFATKC	RLEGTKKGHQ
LQLDYFGACK	SIPTCTDFEV	IQFPLRMRDW	LKNILMQLYE	ANSEHAGYLN
EKQRNKVKKI	YLDEKRLLAG	DHPIDLLLRD	FKKNYHMYVY	PVHWQFSELD
QHPMDRVLTH	SELAPLRASL	VPMEHCITRF	FEECDPNKDK	HITLKEWGHC
FGIKEEDIDE	NLLF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

Girard J.-P., Springer T.A. (1995). Cloning from purified high endothelial venule cells of hevin, a close relative of the antiadhesive extracellular matrix protein SPARC.. Immunity 2: 113 — 123. PubMed DOI:10.1016/1074-7613(95)90083-7
Halim A., Ruetschi U., Larson G., Nilsson J. (2013). LC-MS/MS characterization of O-glycosylation sites and glycan structures of human cerebrospinal fluid glycoproteins.. J. Proteome Res. 12: 573 — 584. PubMed DOI:10.1021/pr300963h

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11220 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
UniProt, Q14515 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11220 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q14515 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.