SPINK5

SPINK5
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1H0Z, 1HDL, 1UUC, 1UVF, 1UVG
Ідентифікатори
Символи	SPINK5, LEKTI, LETKI, NETS, NS, VAKTI, serine peptidase inhibitor, Kazal type 5, serine peptidase inhibitor Kazal type 5
Зовнішні ІД	OMIM: 605010 MGI: 1919682 HomoloGene: 4987 GeneCards: SPINK5
Пов'язані генетичні захворювання
	Netherton syndrome[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptidase inhibitor activity; • serine-type endopeptidase inhibitor activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • endoplasmic reticulum membrane; • cell cortex; • Ендоплазматичний ретикулум; • perinuclear region of cytoplasm; • epidermal lamellar body; • extracellular region; • внутрішньоклітинна мембранна органела;
Біологічний процес	• epidermal cell differentiation; • negative regulation of proteolysis; • negative regulation of serine-type peptidase activity; • negative regulation of peptidase activity; • epithelial cell differentiation; • hair cell differentiation; • extracellular matrix organization; • negative regulation of antibacterial peptide production; • negative regulation of immune response; • regulation of cell adhesion; • negative regulation of angiogenesis; • negative regulation of serine-type endopeptidase activity; • regulation of T cell differentiation; • cornification; • regulation of timing of anagen;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	11005
	72432
	ENSG00000133710
	ENSMUSG00000055561
	Q9NQ38
	Q148R4
	NM_001127698; NM_001127699; NM_006846
	NM_001081180
	NP_001121170; NP_001121171; NP_006837
	NP_001074649
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SPINK5 (англ. Serine peptidase inhibitor, Kazal type 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 064 амінокислот, а молекулярна маса — 120 714[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKIATVSVLL	PLALCLIQDA	ASKNEDQEMC	HEFQAFMKNG	KLFCPQDKKF
FQSLDGIMFI	NKCATCKMIL	EKEAKSQKRA	RHLARAPKAT	APTELNCDDF
KKGERDGDFI	CPDYYEAVCG	TDGKTYDNRC	ALCAENAKTG	SQIGVKSEGE
CKSSNPEQDV	CSAFRPFVRD	GRLGCTREND	PVLGPDGKTH	GNKCAMCAEL
FLKEAENAKR	EGETRIRRNA	EKDFCKEYEK	QVRNGRLFCT	RESDPVRGPD
GRMHGNKCAL	CAEIFKQRFS	EENSKTDQNL	GKAEEKTKVK	REIVKLCSQY
QNQAKNGILF	CTRENDPIRG	PDGKMHGNLC	SMCQAYFQAE	NEEKKKAEAR
ARNKRESGKA	TSYAELCSEY	RKLVRNGKLA	CTRENDPIQG	PDGKVHGNTC
SMCEVFFQAE	EEEKKKKEGK	SRNKRQSKST	ASFEELCSEY	RKSRKNGRLF
CTRENDPIQG	PDGKMHGNTC	SMCEAFFQQE	ERARAKAKRE	AAKEICSEFR
DQVRNGTLIC	TREHNPVRGP	DGKMHGNKCA	MCASVFKLEE	EEKKNDKEEK
GKVEAEKVKR	EAVQELCSEY	RHYVRNGRLP	CTRENDPIEG	LDGKIHGNTC
SMCEAFFQQE	AKEKERAEPR	AKVKREAEKE	TCDEFRRLLQ	NGKLFCTREN
DPVRGPDGKT	HGNKCAMCKA	VFQKENEERK	RKEEEDQRNA	AGHGSSGGGG
GNTQDECAEY	REQMKNGRLS	CTRESDPVRD	ADGKSYNNQC	TMCKAKLERE
AERKNEYSRS	RSNGTGSESG	KDTCDEFRSQ	MKNGKLICTR	ESDPVRGPDG
KTHGNKCTMC	KEKLEREAAE	KKKKEDEDRS	NTGERSNTGE	RSNDKEDLCR
EFRSMQRNGK	LICTRENNPV	RGPYGKMHIN	KCAMCQSIFD	REANERKKKD
EEKSSSKPSN	NAKDECSEFR	NYIRNNELIC	PRENDPVHGA	DGKFYTNKCY
MCRAVFLTEA	LERAKLQEKP	SHVRASQEED	SPDSFSSLDS	EMCKDYRVLP
RIGYLCPKDL	KPVCGDDGQT	YNNPCMLCHE	NLIRQTNTHI	RSTGKCEESS
TPGTTAASMP	PSDE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів протеаз, інгібіторів серинових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Секретований назовні.

Література

Ahmed A., Kandola P., Ziada G., Parenteau N. (2001). Purification and partial amino acid sequence of proteins from human epidermal keratinocyte conditioned medium.. J. Protein Chem. 20: 273 — 278. PubMed DOI:10.1023/A:1010902815953
Lauber T., Schulz A., Schweimer K., Adermann K., Marx U.C. (2003). Homologous proteins with different folds: the three-dimensional structures of domains 1 and 6 of the multiple Kazal-type inhibitor LEKTI.. J. Mol. Biol. 328: 205 — 219. PubMed DOI:10.1016/S0022-2836(03)00245-6

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з SPINK5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15464 (англ.). Процитовано 5 вересня 2017.
UniProt, Q9NQ38 (англ.). Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 5

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з SPINK5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15464 (англ.). Процитовано 5 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q9NQ38 (англ.). Процитовано 5 вересня 2017.