TGFA

TGFA
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1GK5, 1MOX, 1YUF, 1YUG, 2TGF, 3E50, 3TGF, 4TGF
Ідентифікатори
Символи	TGFA, TFGA, transforming growth factor alpha, Transforming growth factor - α
Зовнішні ІД	OMIM: 190170 MGI: 98724 HomoloGene: 2431 GeneCards: TGFA
Онтологія гена
Молекулярна функція	• epidermal growth factor receptor binding; • GO:0001948 protein binding; • growth factor activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • extracellular region; • cell surface; • basolateral plasma membrane; • perinuclear region of cytoplasm; • ER to Golgi transport vesicle membrane; • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • Golgi membrane; • extracellular space; • clathrin-coated vesicle membrane;
Біологічний процес	• positive regulation of epidermal growth factor-activated receptor activity; • positive regulation of epithelial cell proliferation; • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport; • COPII vesicle coating; • проліферація; • positive regulation of mitotic nuclear division; • positive regulation of cell division; • regulation of transcription by RNA polymerase II; • epidermal growth factor receptor signaling pathway; • positive regulation of cell population proliferation; • MAPK cascade; • Сигнальна трансдукція; • negative regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway; • positive regulation of protein kinase B signaling; • membrane organization; • GO:0007243 intracellular signal transduction;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	7039
	21802
	ENSG00000163235
	ENSMUSG00000029999
	P01135
	P48030
	NM_001099691; NM_001308158; NM_001308159; NM_003236
	NM_031199
	NP_001093161; NP_001295087; NP_001295088; NP_003227
	NP_112476
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TGFA (англ. Transforming growth factor alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 160 амінокислот, а молекулярна маса — 17 006[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVPSAGQLAL	FALGIVLAAC	QALENSTSPL	SADPPVAAAV	VSHFNDCPDS
HTQFCFHGTC	RFLVQEDKPA	CVCHSGYVGA	RCEHADLLAV	VAASQKKQAI
TALVVVSIVA	LAVLIITCVL	IHCCQVRKHC	EWCRALICRH	EKPSALLKGR
TACCHSETVV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до факторів росту, мітогенів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

Derynck R., Roberts A.B., Winkler M.E., Chen E.Y., Goeddel D.V. (1984). Human transforming growth factor-alpha: precursor structure and expression in E. coli.. Cell 38: 287 — 297. PubMed DOI:10.1016/0092-8674(84)90550-6
Jakowlew S.B., Kondaiah P., Dillard P.J., Sporn M.B., Roberts A.B. (1988). A novel low molecular weight ribonucleic acid (RNA) related to transforming growth factor alpha messenger RNA.. Mol. Endocrinol. 2: 1056 — 1063. PubMed DOI:10.1210/mend-2-11-1056
Qian J.F., Lazar-Wesley E., Breugnot C., May E. (1993). Human transforming growth factor alpha: sequence analysis of the 4.5-kb and 1.6-kb mRNA species.. Gene 132: 291 — 296. PubMed DOI:10.1016/0378-1119(93)90210-T
Xu X., Liao J., Creek K.E., Pirisi L. (1999). Human keratinocytes and tumor-derived cell lines express alternatively spliced forms of transforming growth factor-alpha mRNA, encoding precursors lacking carboxyl-terminal valine residues.. Oncogene 18: 5554 — 5562. PubMed DOI:10.1038/sj.onc.1203091
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Jakobovits E.B., Schlokat U., Vannice J.L., Derynck R., Levinson A.D. (1988). The human transforming growth factor alpha promoter directs transcription initiation from a single site in the absence of a TATA sequence.. Mol. Cell. Biol. 8: 5549 — 5554. PubMed DOI:10.1128/MCB.8.12.5549

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11765 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
UniProt, P01135 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11765 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P01135 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.