TNC

TNC (англ. Tenascin C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 201 амінокислот, а молекулярна маса — 240 853[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGAMTQLLAGVFLAFLALATEGGVLKKVIRHKRQSGVNATLPEENQPVVF
NHVYNIKLPVGSQCSVDLESASGEKDLAPPSEPSESFQEHTVDGENQIVF
THRINIPRRACGCAAAPDVKELLSRLEELENLVSSLREQCTAGAGCCLQP
ATGRLDTRPFCSGRGNFSTEGCGCVCEPGWKGPNCSEPECPGNCHLRGRC
IDGQCICDDGFTGEDCSQLACPSDCNDQGKCVNGVCICFEGYAGADCSRE
ICPVPCSEEHGTCVDGLCVCHDGFAGDDCNKPLCLNNCYNRGRCVENECV
CDEGFTGEDCSELICPNDCFDRGRCINGTCYCEEGFTGEDCGKPTCPHAC
HTQGRCEEGQCVCDEGFAGVDCSEKRCPADCHNRGRCVDGRCECDDGFTG
ADCGELKCPNGCSGHGRCVNGQCVCDEGYTGEDCSQLRCPNDCHSRGRCV
EGKCVCEQGFKGYDCSDMSCPNDCHQHGRCVNGMCVCDDGYTGEDCRDRQ
CPRDCSNRGLCVDGQCVCEDGFTGPDCAELSCPNDCHGQGRCVNGQCVCH
EGFMGKDCKEQRCPSDCHGQGRCVDGQCICHEGFTGLDCGQHSCPSDCNN
LGQCVSGRCICNEGYSGEDCSEVSPPKDLVVTEVTEETVNLAWDNEMRVT
EYLVVYTPTHEGGLEMQFRVPGDQTSTIIQELEPGVEYFIRVFAILENKK
SIPVSARVATYLPAPEGLKFKSIKETSVEVEWDPLDIAFETWEIIFRNMN
KEDEGEITKSLRRPETSYRQTGLAPGQEYEISLHIVKNNTRGPGLKRVTT
TRLDAPSQIEVKDVTDTTALITWFKPLAEIDGIELTYGIKDVPGDRTTID
LTEDENQYSIGNLKPDTEYEVSLISRRGDMSSNPAKETFTTGLDAPRNLR
RVSQTDNSITLEWRNGKAAIDSYRIKYAPISGGDHAEVDVPKSQQATTKT
TLTGLRPGTEYGIGVSAVKEDKESNPATINAATELDTPKDLQVSETAETS
LTLLWKTPLAKFDRYRLNYSLPTGQWVGVQLPRNTTSYVLRGLEPGQEYN
VLLTAEKGRHKSKPARVKASTEQAPELENLTVTEVGWDGLRLNWTAADQA
YEHFIIQVQEANKVEAARNLTVPGSLRAVDIPGLKAATPYTVSIYGVIQG
YRTPVLSAEASTGETPNLGEVVVAEVGWDALKLNWTAPEGAYEYFFIQVQ
EADTVEAAQNLTVPGGLRSTDLPGLKAATHYTITIRGVTQDFSTTPLSVE
VLTEEVPDMGNLTVTEVSWDALRLNWTTPDGTYDQFTIQVQEADQVEEAH
NLTVPGSLRSMEIPGLRAGTPYTVTLHGEVRGHSTRPLAVEVVTEDLPQL
GDLAVSEVGWDGLRLNWTAADNAYEHFVIQVQEVNKVEAAQNLTLPGSLR
AVDIPGLEAATPYRVSIYGVIRGYRTPVLSAEASTAKEPEIGNLNVSDIT
PESFNLSWMATDGIFETFTIEIIDSNRLLETVEYNISGAERTAHISGLPP
STDFIVYLSGLAPSIRTKTISATATTEALPLLENLTISDINPYGFTVSWM
ASENAFDSFLVTVVDSGKLLDPQEFTLSGTQRKLELRGLITGIGYEVMVS
GFTQGHQTKPLRAEIVTEAEPEVDNLLVSDATPDGFRLSWTADEGVFDNF
VLKIRDTKKQSEPLEITLLAPERTRDITGLREATEYEIELYGISKGRRSQ
TVSAIATTAMGSPKEVIFSDITENSATVSWRAPTAQVESFRITYVPITGG
TPSMVTVDGTKTQTRLVKLIPGVEYLVSIIAMKGFEESEPVSGSFTTALD
GPSGLVTANITDSEALARWQPAIATVDSYVISYTGEKVPEITRTVSGNTV
EYALTDLEPATEYTLRIFAEKGPQKSSTITAKFTTDLDSPRDLTATEVQS
ETALLTWRPPRASVTGYLLVYESVDGTVKEVIVGPDTTSYSLADLSPSTH
YTAKIQALNGPLRSNMIQTIFTTIGLLYPFPKDCSQAMLNGDTTSGLYTI
YLNGDKAEALEVFCDMTSDGGGWIVFLRRKNGRENFYQNWKAYAAGFGDR
REEFWLGLDNLNKITAQGQYELRVDLRDHGETAFAVYDKFSVGDAKTRYK
LKVEGYSGTAGDSMAYHNGRSFSTFDKDTDSAITNCALSYKGAFWYRNCH
RVNLMGRYGDNNHSQGVNWFHWKGHEHSIQFAEMKLRPSNFRNLEGRRKR
A
TNC
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи TNC, 150-225, DFNA56, GMEM, GP, HXB, JI, TN, TN-C, Tenascin C
Зовнішні ІД OMIM: 187380 MGI: 101922 HomoloGene: 55636 GeneCards: TNC
Пов'язані генетичні захворювання
рак простати, autosomal dominant nonsyndromic deafness 56[1]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3371
21923
Ensembl
ENSG00000041982
ENSMUSG00000028364
UniProt
P24821
Q80YX1
RefSeq (мРНК)
NM_002160
NM_011607
NM_001369211
NM_001369212
NM_001369213
NM_001369214
RefSeq (білок)
NP_002151
NP_035737
NP_001356140
NP_001356141
NP_001356142
NP_001356143
Локус (UCSC) Хр. 9: 115.02 – 115.12 Mb Хр. 4: 63.96 – 64.05 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

  • Glumoff V., Savontaus M., Vehanen J., Vuorio E. (1994). Analysis of aggrecan and tenascin gene expression in mouse skeletal tissues by northern and in situ hybridization using species specific cDNA probes.. Biochim. Biophys. Acta 1219: 613 — 622. PubMed DOI:10.1016/0167-4781(94)90220-8
  • Gulcher J.R., Nies D.E., Marton L.S., Stefansson K. (1989). An alternatively spliced region of the human hexabrachion contains a repeat of potential N-glycosylation sites.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86: 1588 — 1592. PubMed DOI:10.1073/pnas.86.5.1588
  • Burg M.A., Tillet E., Timpl R., Stallcup W.B. (1996). Binding of the NG2 proteoglycan to type VI collagen and other extracellular matrix molecules.. J. Biol. Chem. 271: 26110 — 26116. PubMed DOI:10.1074/jbc.271.42.26110
  • Picariello G., Ferranti P., Mamone G., Roepstorff P., Addeo F. (2008). Identification of N-linked glycoproteins in human milk by hydrophilic interaction liquid chromatography and mass spectrometry.. Proteomics 8: 3833 — 3847. PubMed DOI:10.1002/pmic.200701057
  • Leahy D.J., Hendrickson W.A., Aukhil I., Erickson H.P. (1992). Structure of a fibronectin type III domain from tenascin phased by MAD analysis of the selenomethionyl protein.. Science 258: 987 — 991. PubMed DOI:10.1126/science.1279805
  • Nies D.E., Hemesath T.J., Kim J.H., Gulcher J.R., Stefansson K. (1991). The complete cDNA sequence of human hexabrachion (Tenascin). A multidomain protein containing unique epidermal growth factor repeats.. J. Biol. Chem. 266: 2818 — 2823. PubMed

Примітки

Див. також

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.