TNC

TNC
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1TEN, 2RB8, 2RBL
Ідентифікатори
Символи	TNC, 150-225, DFNA56, GMEM, GP, HXB, JI, TN, TN-C, Tenascin C
Зовнішні ІД	OMIM: 187380 MGI: 101922 HomoloGene: 55636 GeneCards: TNC
Пов'язані генетичні захворювання
	рак простати, autosomal dominant nonsyndromic deafness 56[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• syndecan binding; • extracellular matrix structural constituent; • GO:0001948 protein binding;
Клітинна компонента	• interstitial matrix; • мембрана; • focal adhesion; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • Базальна мембрана; • extracellular space; • endoplasmic reticulum lumen; • extracellular region; • collagen-containing extracellular matrix; • perisynaptic extracellular matrix;
Біологічний процес	• cellular response to retinoic acid; • negative regulation of cell adhesion; • bud outgrowth involved in lung branching; • mesenchymal-epithelial cell signaling involved in prostate gland development; • response to fibroblast growth factor; • response to mechanical stimulus; • extracellular matrix organization; • Загоєння ран; • cellular response to vitamin D; • odontogenesis of dentin-containing tooth; • positive regulation of gene expression; • Адгезія клітин; • prostate gland epithelium morphogenesis; • cellular response to prostaglandin D stimulus; • regulation of cell population proliferation; • neuromuscular junction development; • response to wounding; • peripheral nervous system axon regeneration; • osteoblast differentiation; • positive regulation of cell population proliferation; • response to ethanol; • neuron projection development; • посттрансляційна модифікація; • cellular protein metabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3371
	21923
	ENSG00000041982
	ENSMUSG00000028364
	P24821
	Q80YX1
	NM_002160
	NM_011607; NM_001369211; NM_001369212; NM_001369213; NM_001369214
	NP_002151
	NP_035737; NP_001356140; NP_001356141; NP_001356142; NP_001356143
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TNC (англ. Tenascin C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 201 амінокислот, а молекулярна маса — 240 853[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGAMTQLLAG	VFLAFLALAT	EGGVLKKVIR	HKRQSGVNAT	LPEENQPVVF
NHVYNIKLPV	GSQCSVDLES	ASGEKDLAPP	SEPSESFQEH	TVDGENQIVF
THRINIPRRA	CGCAAAPDVK	ELLSRLEELE	NLVSSLREQC	TAGAGCCLQP
ATGRLDTRPF	CSGRGNFSTE	GCGCVCEPGW	KGPNCSEPEC	PGNCHLRGRC
IDGQCICDDG	FTGEDCSQLA	CPSDCNDQGK	CVNGVCICFE	GYAGADCSRE
ICPVPCSEEH	GTCVDGLCVC	HDGFAGDDCN	KPLCLNNCYN	RGRCVENECV
CDEGFTGEDC	SELICPNDCF	DRGRCINGTC	YCEEGFTGED	CGKPTCPHAC
HTQGRCEEGQ	CVCDEGFAGV	DCSEKRCPAD	CHNRGRCVDG	RCECDDGFTG
ADCGELKCPN	GCSGHGRCVN	GQCVCDEGYT	GEDCSQLRCP	NDCHSRGRCV
EGKCVCEQGF	KGYDCSDMSC	PNDCHQHGRC	VNGMCVCDDG	YTGEDCRDRQ
CPRDCSNRGL	CVDGQCVCED	GFTGPDCAEL	SCPNDCHGQG	RCVNGQCVCH
EGFMGKDCKE	QRCPSDCHGQ	GRCVDGQCIC	HEGFTGLDCG	QHSCPSDCNN
LGQCVSGRCI	CNEGYSGEDC	SEVSPPKDLV	VTEVTEETVN	LAWDNEMRVT
EYLVVYTPTH	EGGLEMQFRV	PGDQTSTIIQ	ELEPGVEYFI	RVFAILENKK
SIPVSARVAT	YLPAPEGLKF	KSIKETSVEV	EWDPLDIAFE	TWEIIFRNMN
KEDEGEITKS	LRRPETSYRQ	TGLAPGQEYE	ISLHIVKNNT	RGPGLKRVTT
TRLDAPSQIE	VKDVTDTTAL	ITWFKPLAEI	DGIELTYGIK	DVPGDRTTID
LTEDENQYSI	GNLKPDTEYE	VSLISRRGDM	SSNPAKETFT	TGLDAPRNLR
RVSQTDNSIT	LEWRNGKAAI	DSYRIKYAPI	SGGDHAEVDV	PKSQQATTKT
TLTGLRPGTE	YGIGVSAVKE	DKESNPATIN	AATELDTPKD	LQVSETAETS
LTLLWKTPLA	KFDRYRLNYS	LPTGQWVGVQ	LPRNTTSYVL	RGLEPGQEYN
VLLTAEKGRH	KSKPARVKAS	TEQAPELENL	TVTEVGWDGL	RLNWTAADQA
YEHFIIQVQE	ANKVEAARNL	TVPGSLRAVD	IPGLKAATPY	TVSIYGVIQG
YRTPVLSAEA	STGETPNLGE	VVVAEVGWDA	LKLNWTAPEG	AYEYFFIQVQ
EADTVEAAQN	LTVPGGLRST	DLPGLKAATH	YTITIRGVTQ	DFSTTPLSVE
VLTEEVPDMG	NLTVTEVSWD	ALRLNWTTPD	GTYDQFTIQV	QEADQVEEAH
NLTVPGSLRS	MEIPGLRAGT	PYTVTLHGEV	RGHSTRPLAV	EVVTEDLPQL
GDLAVSEVGW	DGLRLNWTAA	DNAYEHFVIQ	VQEVNKVEAA	QNLTLPGSLR
AVDIPGLEAA	TPYRVSIYGV	IRGYRTPVLS	AEASTAKEPE	IGNLNVSDIT
PESFNLSWMA	TDGIFETFTI	EIIDSNRLLE	TVEYNISGAE	RTAHISGLPP
STDFIVYLSG	LAPSIRTKTI	SATATTEALP	LLENLTISDI	NPYGFTVSWM
ASENAFDSFL	VTVVDSGKLL	DPQEFTLSGT	QRKLELRGLI	TGIGYEVMVS
GFTQGHQTKP	LRAEIVTEAE	PEVDNLLVSD	ATPDGFRLSW	TADEGVFDNF
VLKIRDTKKQ	SEPLEITLLA	PERTRDITGL	REATEYEIEL	YGISKGRRSQ
TVSAIATTAM	GSPKEVIFSD	ITENSATVSW	RAPTAQVESF	RITYVPITGG
TPSMVTVDGT	KTQTRLVKLI	PGVEYLVSII	AMKGFEESEP	VSGSFTTALD
GPSGLVTANI	TDSEALARWQ	PAIATVDSYV	ISYTGEKVPE	ITRTVSGNTV
EYALTDLEPA	TEYTLRIFAE	KGPQKSSTIT	AKFTTDLDSP	RDLTATEVQS
ETALLTWRPP	RASVTGYLLV	YESVDGTVKE	VIVGPDTTSY	SLADLSPSTH
YTAKIQALNG	PLRSNMIQTI	FTTIGLLYPF	PKDCSQAMLN	GDTTSGLYTI
YLNGDKAEAL	EVFCDMTSDG	GGWIVFLRRK	NGRENFYQNW	KAYAAGFGDR
REEFWLGLDN	LNKITAQGQY	ELRVDLRDHG	ETAFAVYDKF	SVGDAKTRYK
LKVEGYSGTA	GDSMAYHNGR	SFSTFDKDTD	SAITNCALSY	KGAFWYRNCH
RVNLMGRYGD	NNHSQGVNWF	HWKGHEHSIQ	FAEMKLRPSN	FRNLEGRRKR
A

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

Glumoff V., Savontaus M., Vehanen J., Vuorio E. (1994). Analysis of aggrecan and tenascin gene expression in mouse skeletal tissues by northern and in situ hybridization using species specific cDNA probes.. Biochim. Biophys. Acta 1219: 613 — 622. PubMed DOI:10.1016/0167-4781(94)90220-8
Gulcher J.R., Nies D.E., Marton L.S., Stefansson K. (1989). An alternatively spliced region of the human hexabrachion contains a repeat of potential N-glycosylation sites.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86: 1588 — 1592. PubMed DOI:10.1073/pnas.86.5.1588
Burg M.A., Tillet E., Timpl R., Stallcup W.B. (1996). Binding of the NG2 proteoglycan to type VI collagen and other extracellular matrix molecules.. J. Biol. Chem. 271: 26110 — 26116. PubMed DOI:10.1074/jbc.271.42.26110
Picariello G., Ferranti P., Mamone G., Roepstorff P., Addeo F. (2008). Identification of N-linked glycoproteins in human milk by hydrophilic interaction liquid chromatography and mass spectrometry.. Proteomics 8: 3833 — 3847. PubMed DOI:10.1002/pmic.200701057
Leahy D.J., Hendrickson W.A., Aukhil I., Erickson H.P. (1992). Structure of a fibronectin type III domain from tenascin phased by MAD analysis of the selenomethionyl protein.. Science 258: 987 — 991. PubMed DOI:10.1126/science.1279805
Nies D.E., Hemesath T.J., Kim J.H., Gulcher J.R., Stefansson K. (1991). The complete cDNA sequence of human hexabrachion (Tenascin). A multidomain protein containing unique epidermal growth factor repeats.. J. Biol. Chem. 266: 2818 — 2823. PubMed

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з TNC переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5318 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.
UniProt, P24821 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 9

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з TNC переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5318 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P24821 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.