UMPS

UMPS
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4HKP, 2EAW, 2JGY, 2P1F, 2QCC, 2QCD, 2QCE, 2QCF, 2QCG, 2QCH, 2QCL, 2QCM, 2QCN, 2V30, 2WNS, 3BGG, 3BGJ, 3BK0, 3BVJ, 3DBP, 3EWU, 3EWW, 3EWX, 3EWY, 3EWZ, 3EX1, 3EX2, 3EX3, 3EX4, 3EX6, 3G3D, 3G3M, 3L0K, 3L0N, 3MI2, 3MO7, 3MW7, 4HIB
Ідентифікатори
Символи	UMPS, OPRT, uridine monophosphate synthetase
Зовнішні ІД	OMIM: 613891 MGI: 1298388 HomoloGene: 319 GeneCards: UMPS
Пов'язані генетичні захворювання
	Оротацидурія[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• lyase activity; • carboxy-lyase activity; • transferase activity; • каталітична активність; • glycosyltransferase activity; • orotidine-5'-phosphate decarboxylase activity; • orotate phosphoribosyltransferase activity; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• female pregnancy; • pyrimidine nucleotide biosynthetic process; • UMP biosynthetic process; • Обмін речовин; • nucleoside metabolic process; • pyrimidine nucleoside biosynthetic process; • 'de novo' UMP biosynthetic process; • 'de novo' pyrimidine nucleobase biosynthetic process; • Лактація; • pyrimidine nucleobase biosynthetic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	7372
	22247
	ENSG00000114491
	ENSMUSG00000022814
	P11172
	P13439
	NM_000373
	NM_009471; NM_001348087
	NP_000364
	NP_033497; NP_001335016
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

UMPS (англ. Uridine monophosphate synthetase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 480 амінокислот, а молекулярна маса — 52 222[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAVARAALGP	LVTGLYDVQA	FKFGDFVLKS	GLSSPIYIDL	RGIVSRPRLL
SQVADILFQT	AQNAGISFDT	VCGVPYTALP	LATVICSTNQ	IPMLIRRKET
KDYGTKRLVE	GTINPGETCL	IIEDVVTSGS	SVLETVEVLQ	KEGLKVTDAI
VLLDREQGGK	DKLQAHGIRL	HSVCTLSKML	EILEQQKKVD	AETVGRVKRF
IQENVFVAAN	HNGSPLSIKE	APKELSFGAR	AELPRIHPVA	SKLLRLMQKK
ETNLCLSADV	SLARELLQLA	DALGPSICML	KTHVDILNDF	TLDVMKELIT
LAKCHEFLIF	EDRKFADIGN	TVKKQYEGGI	FKIASWADLV	NAHVVPGSGV
VKGLQEVGLP	LHRGCLLIAE	MSSTGSLATG	DYTRAAVRMA	EEHSEFVVGF
ISGSRVSMKP	EFLHLTPGVQ	LEAGGDNLGQ	QYNSPQEVIG	KRGSDIIIVG
RGIISAADRL	EAAEMYRKAA	WEAYLSRLGV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, ліаз, глікозилтрансфераз, декарбоксилаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як біосинтез піримідинів, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг.

Література

Suttle D.P., Bugg B.Y., Winkler J.K., Kanalas J.J. (1988). Molecular cloning and nucleotide sequence for the complete coding region of human UMP synthase.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85: 1754 — 1758. PubMed DOI:10.1073/pnas.85.6.1754
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Suchi M. (1988). Molecular genetic studies on hereditary orotic aciduria: I. Purification of human orotidine 5'-monophosphate decarboxylase and cloning of its cDNA.. Nagoya Med. J. 32: 207 — 220.

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з UMPS переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12563 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
UniProt, P11172 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з UMPS переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12563 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P11172 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.