VCAM1

VCAM1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1IJ9, 1VCA, 1VSC
Ідентифікатори
Символи	VCAM1, CD106, INCAM-100, vascular cell adhesion molecule 1
Зовнішні ІД	OMIM: 192225 MGI: 98926 HomoloGene: 838 GeneCards: VCAM1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• primary amine oxidase activity; • integrin binding; • cell adhesion molecule binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • комплекс Ґольджі; • alpha9-beta1 integrin-vascular cell adhesion molecule-1 complex; • мембрана; • filopodium; • клітинна мембрана; • apical part of cell; • Мікроворсинки; • cell surface; • early endosome; • Ендоплазматичний ретикулум; • podosome; • Сарколема; • Екзосома; • external side of plasma membrane; • extracellular space; • integral component of plasma membrane;
Біологічний процес	• leukocyte cell-cell adhesion; • response to ionizing radiation; • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; • response to hypoxia; • response to nutrient; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • cellular response to tumor necrosis factor; • response to nicotine; • Старіння людини; • response to zinc ion; • extracellular matrix organization; • amine metabolic process; • response to lipopolysaccharide; • Адгезія клітин; • acute inflammatory response; • positive regulation of T cell proliferation; • membrane to membrane docking; • regulation of immune response; • leukocyte tethering or rolling; • cell chemotaxis; • B cell differentiation; • cellular response to vascular endothelial growth factor stimulus; • cell-matrix adhesion; • GO:0022415 viral process; • response to ethanol; • calcium-mediated signaling using intracellular calcium source; • chronic inflammatory response; • cell-cell adhesion; • cytokine-mediated signaling pathway; • heterotypic cell-cell adhesion; • іннервація; • cardiac neuron differentiation; • cell-cell adhesion in response to extracellular stimulus; • cellular response to amyloid-beta;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	7412
	22329
	ENSG00000162692
	ENSMUSG00000027962
	P19320
	P29533
	NM_080682; NM_001078; NM_001199834
	NM_011693
	NP_001069; NP_001186763; NP_542413
	NP_035823
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

VCAM1 (англ. Vascular cell adhesion molecule 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 739 амінокислот, а молекулярна маса — 81 276[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPGKMVVILG	ASNILWIMFA	ASQAFKIETT	PESRYLAQIG	DSVSLTCSTT
GCESPFFSWR	TQIDSPLNGK	VTNEGTTSTL	TMNPVSFGNE	HSYLCTATCE
SRKLEKGIQV	EIYSFPKDPE	IHLSGPLEAG	KPITVKCSVA	DVYPFDRLEI
DLLKGDHLMK	SQEFLEDADR	KSLETKSLEV	TFTPVIEDIG	KVLVCRAKLH
IDEMDSVPTV	RQAVKELQVY	ISPKNTVISV	NPSTKLQEGG	SVTMTCSSEG
LPAPEIFWSK	KLDNGNLQHL	SGNATLTLIA	MRMEDSGIYV	CEGVNLIGKN
RKEVELIVQE	KPFTVEISPG	PRIAAQIGDS	VMLTCSVMGC	ESPSFSWRTQ
IDSPLSGKVR	SEGTNSTLTL	SPVSFENEHS	YLCTVTCGHK	KLEKGIQVEL
YSFPRDPEIE	MSGGLVNGSS	VTVSCKVPSV	YPLDRLEIEL	LKGETILENI
EFLEDTDMKS	LENKSLEMTF	IPTIEDTGKA	LVCQAKLHID	DMEFEPKQRQ
STQTLYVNVA	PRDTTVLVSP	SSILEEGSSV	NMTCLSQGFP	APKILWSRQL
PNGELQPLSE	NATLTLISTK	MEDSGVYLCE	GINQAGRSRK	EVELIIQVTP
KDIKLTAFPS	ESVKEGDTVI	ISCTCGNVPE	TWIILKKKAE	TGDTVLKSID
GAYTIRKAQL	KDAGVYECES	KNKVGSQLRS	LTLDVQGREN	NKDYFSPELL
VLYFASSLII	PAIGMIIYFA	RKANMKGSYS	LVEAQKSKV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у мембрані.

Література

Polte T., Newman W., Gopal T.V. (1990). Full length vascular cell adhesion molecule 1 (VCAM-1).. Nucleic Acids Res. 18: 5901 — 5901. PubMed DOI:10.1093/nar/18.19.5901
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Osborn L., Vassallo C., Benjamin C.D. (1992). Activated endothelium binds lymphocytes through a novel binding site in the alternately spliced domain of vascular cell adhesion molecule-1.. J. Exp. Med. 176: 99 — 107. PubMed DOI:10.1084/jem.176.1.99
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites.. Protein Sci. 13: 2819 — 2824. PubMed DOI:10.1110/ps.04682504
Iademarco M.F., McQuillan J.J., Rosen G.D., Dean D.C. (1992). Characterization of the promoter for vascular cell adhesion molecule-1 (VCAM-1).. J. Biol. Chem. 267: 16323 — 16329. PubMed

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12663 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.
UniProt, P19320 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12663 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P19320 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.