VCAN
VCAN (англ. Versican) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 396 амінокислот, а молекулярна маса — 372 820[5].
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MFINIKSILW | MCSTLIVTHA | LHKVKVGKSP | PVRGSLSGKV | SLPCHFSTMP | ||||
| TLPPSYNTSE | FLRIKWSKIE | VDKNGKDLKE | TTVLVAQNGN | IKIGQDYKGR | ||||
| VSVPTHPEAV | GDASLTVVKL | LASDAGLYRC | DVMYGIEDTQ | DTVSLTVDGV | ||||
| VFHYRAATSR | YTLNFEAAQK | ACLDVGAVIA | TPEQLFAAYE | DGFEQCDAGW | ||||
| LADQTVRYPI | RAPRVGCYGD | KMGKAGVRTY | GFRSPQETYD | VYCYVDHLDG | ||||
| DVFHLTVPSK | FTFEEAAKEC | ENQDARLATV | GELQAAWRNG | FDQCDYGWLS | ||||
| DASVRHPVTV | ARAQCGGGLL | GVRTLYRFEN | QTGFPPPDSR | FDAYCFKPKE | ||||
| ATTIDLSILA | ETASPSLSKE | PQMVSDRTTP | IIPLVDELPV | IPTEFPPVGN | ||||
| IVSFEQKATV | QPQAITDSLA | TKLPTPTGST | KKPWDMDDYS | PSASGPLGKL | ||||
| DISEIKEEVL | QSTTGVSHYA | TDSWDGVVED | KQTQESVTQI | EQIEVGPLVT | ||||
| SMEILKHIPS | KEFPVTETPL | VTARMILESK | TEKKMVSTVS | ELVTTGHYGF | ||||
| TLGEEDDEDR | TLTVGSDEST | LIFDQIPEVI | TVSKTSEDTI | HTHLEDLESV | ||||
| SASTTVSPLI | MPDNNGSSMD | DWEERQTSGR | ITEEFLGKYL | STTPFPSQHR | ||||
| TEIELFPYSG | DKILVEGIST | VIYPSLQTEM | THRRERTETL | IPEMRTDTYT | ||||
| DEIQEEITKS | PFMGKTEEEV | FSGMKLSTSL | SEPIHVTESS | VEMTKSFDFP | ||||
| TLITKLSAEP | TEVRDMEEDF | TATPGTTKYD | ENITTVLLAH | GTLSVEAATV | ||||
| SKWSWDEDNT | TSKPLESTEP | SASSKLPPAL | LTTVGMNGKD | KDIPSFTEDG | ||||
| ADEFTLIPDS | TQKQLEEVTD | EDIAAHGKFT | IRFQPTTSTG | IAEKSTLRDS | ||||
| TTEEKVPPIT | STEGQVYATM | EGSALGEVED | VDLSKPVSTV | PQFAHTSEVE | ||||
| GLAFVSYSST | QEPTTYVDSS | HTIPLSVIPK | TDWGVLVPSV | PSEDEVLGEP | ||||
| SQDILVIDQT | RLEATISPET | MRTTKITEGT | TQEEFPWKEQ | TAEKPVPALS | ||||
| STAWTPKEAV | TPLDEQEGDG | SAYTVSEDEL | LTGSERVPVL | ETTPVGKIDH | ||||
| SVSYPPGAVT | EHKVKTDEVV | TLTPRIGPKV | SLSPGPEQKY | ETEGSSTTGF | ||||
| TSSLSPFSTH | ITQLMEETTT | EKTSLEDIDL | GSGLFEKPKA | TELIEFSTIK | ||||
| VTVPSDITTA | FSSVDRLHTT | SAFKPSSAIT | KKPPLIDREP | GEETTSDMVI | ||||
| IGESTSHVPP | TTLEDIVAKE | TETDIDREYF | TTSSPPATQP | TRPPTVEDKE | ||||
| AFGPQALSTP | QPPASTKFHP | DINVYIIEVR | ENKTGRMSDL | SVIGHPIDSE | ||||
| SKEDEPCSEE | TDPVHDLMAE | ILPEFPDIIE | IDLYHSEENE | EEEEECANAT | ||||
| DVTTTPSVQY | INGKHLVTTV | PKDPEAAEAR | RGQFESVAPS | QNFSDSSESD | ||||
| THPFVIAKTE | LSTAVQPNES | TETTESLEVT | WKPETYPETS | EHFSGGEPDV | ||||
| FPTVPFHEEF | ESGTAKKGAE | SVTERDTEVG | HQAHEHTEPV | SLFPEESSGE | ||||
| IAIDQESQKI | AFARATEVTF | GEEVEKSTSV | TYTPTIVPSS | ASAYVSEEEA | ||||
| VTLIGNPWPD | DLLSTKESWV | EATPRQVVEL | SGSSSIPITE | GSGEAEEDED | ||||
| TMFTMVTDLS | QRNTTDTLIT | LDTSRIITES | FFEVPATTIY | PVSEQPSAKV | ||||
| VPTKFVSETD | TSEWISSTTV | EEKKRKEEEG | TTGTASTFEV | YSSTQRSDQL | ||||
| ILPFELESPN | VATSSDSGTR | KSFMSLTTPT | QSEREMTDST | PVFTETNTLE | ||||
| NLGAQTTEHS | SIHQPGVQEG | LTTLPRSPAS | VFMEQGSGEA | AADPETTTVS | ||||
| SFSLNVEYAI | QAEKEVAGTL | SPHVETTFST | EPTGLVLSTV | MDRVVAENIT | ||||
| QTSREIVISE | RLGEPNYGAE | IRGFSTGFPL | EEDFSGDFRE | YSTVSHPIAK | ||||
| EETVMMEGSG | DAAFRDTQTS | PSTVPTSVHI | SHISDSEGPS | STMVSTSAFP | ||||
| WEEFTSSAEG | SGEQLVTVSS | SVVPVLPSAV | QKFSGTASSI | IDEGLGEVGT | ||||
| VNEIDRRSTI | LPTAEVEGTK | APVEKEEVKV | SGTVSTNFPQ | TIEPAKLWSR | ||||
| QEVNPVRQEI | ESETTSEEQI | QEEKSFESPQ | NSPATEQTIF | DSQTFTETEL | ||||
| KTTDYSVLTT | KKTYSDDKEM | KEEDTSLVNM | STPDPDANGL | ESYTTLPEAT | ||||
| EKSHFFLATA | LVTESIPAEH | VVTDSPIKKE | ESTKHFPKGM | RPTIQESDTE | ||||
| LLFSGLGSGE | EVLPTLPTES | VNFTEVEQIN | NTLYPHTSQV | ESTSSDKIED | ||||
| FNRMENVAKE | VGPLVSQTDI | FEGSGSVTST | TLIEILSDTG | AEGPTVAPLP | ||||
| FSTDIGHPQN | QTVRWAEEIQ | TSRPQTITEQ | DSNKNSSTAE | INETTTSSTD | ||||
| FLARAYGFEM | AKEFVTSAPK | PSDLYYEPSG | EGSGEVDIVD | SFHTSATTQA | ||||
| TRQESSTTFV | SDGSLEKHPE | VPSAKAVTAD | GFPTVSVMLP | LHSEQNKSSP | ||||
| DPTSTLSNTV | SYERSTDGSF | QDRFREFEDS | TLKPNRKKPT | ENIIIDLDKE | ||||
| DKDLILTITE | STILEILPEL | TSDKNTIIDI | DHTKPVYEDI | LGMQTDIDTE | ||||
| VPSEPHDSND | ESNDDSTQVQ | EIYEAAVNLS | LTEETFEGSA | DVLASYTQAT | ||||
| HDESMTYEDR | SQLDHMGFHF | TTGIPAPSTE | TELDVLLPTA | TSLPIPRKSA | ||||
| TVIPEIEGIK | AEAKALDDMF | ESSTLSDGQA | IADQSEIIPT | LGQFERTQEE | ||||
| YEDKKHAGPS | FQPEFSSGAE | EALVDHTPYL | SIATTHLMDQ | SVTEVPDVME | ||||
| GSNPPYYTDT | TLAVSTFAKL | SSQTPSSPLT | IYSGSEASGH | TEIPQPSALP | ||||
| GIDVGSSVMS | PQDSFKEIHV | NIEATFKPSS | EEYLHITEPP | SLSPDTKLEP | ||||
| SEDDGKPELL | EEMEASPTEL | IAVEGTEILQ | DFQNKTDGQV | SGEAIKMFPT | ||||
| IKTPEAGTVI | TTADEIELEG | ATQWPHSTSA | SATYGVEAGV | VPWLSPQTSE | ||||
| RPTLSSSPEI | NPETQAALIR | GQDSTIAASE | QQVAARILDS | NDQATVNPVE | ||||
| FNTEVATPPF | SLLETSNETD | FLIGINEESV | EGTAIYLPGP | DRCKMNPCLN | ||||
| GGTCYPTETS | YVCTCVPGYS | GDQCELDFDE | CHSNPCRNGA | TCVDGFNTFR | ||||
| CLCLPSYVGA | LCEQDTETCD | YGWHKFQGQC | YKYFAHRRTW | DAAERECRLQ | ||||
| GAHLTSILSH | EEQMFVNRVG | HDYQWIGLND | KMFEHDFRWT | DGSTLQYENW | ||||
| RPNQPDSFFS | AGEDCVVIIW | HENGQWNDVP | CNYHLTYTCK | KGTVACGQPP | ||||
| VVENAKTFGK | MKPRYEINSL | IRYHCKDGFI | QRHLPTIRCL | GNGRWAIPKI | ||||
| TCMNPSAYQR | TYSMKYFKNS | SSAKDNSINT | SKHDHRWSRR | WQESRR |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію, лектинами. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- Zako M., Shinomura T., Ujita M., Ito K., Kimata K. (1995). Expression of PG-M(V3), an alternatively spliced form of PG-M without a chondroitin sulfate attachment in region in mouse and human tissues.. J. Biol. Chem. 270: 3914 — 3918. PubMed DOI:10.1074/jbc.270.8.3914
- Yao L.Y., Moody C., Schoenherr E., Wight T.N., Sandell L.J. (1994). Identification of the proteoglycan versican in aorta and smooth muscle cells by DNA sequence analysis, in situ hybridization and immunohistochemistry.. Matrix Biol. 14: 213 — 225. PubMed DOI:10.1016/0945-053X(94)90185-6
- Iozzo R.V., Naso M.F., Cannizzaro L.A., Wasmuth J.J., McPherson J.D. (1992). Mapping of the versican proteoglycan gene (CSPG2) to the long arm of human chromosome 5 (5q12-5q14).. Genomics 14: 845 — 851. PubMed DOI:10.1016/S0888-7543(05)80103-X
- Bignami A., Lane W.S., Andrews D., Dahl D. (1989). Structural similarity of hyaluronate binding proteins in brain and cartilage.. Brain Res. Bull. 22: 67 — 70. PubMed DOI:10.1016/0361-9230(89)90129-9
- Zimmermann D.R., Ruoslahti E. (1989). Multiple domains of the large fibroblast proteoglycan, versican.. EMBO J. 8: 2975 — 2981. PubMed
- Dours-Zimmermann M.T., Zimmermann D.R. (1994). A novel glycosaminoglycan attachment domain identified in two alternative splice variants of human versican.. J. Biol. Chem. 269: 32992 — 32998. PubMed
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з VCAN переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2464 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.
- UniProt, P13611 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.