XCL1

XCL1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1J8I, 1J9O, 2HDM, 2JP1, 2NYZ, 2N54
Ідентифікатори
Символи	XCL1, ATAC, LPTN, LTN, SCM-1, SCM-1a, SCM1, SCM1A, SCYC1, X-C motif chemokine ligand 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600250 MGI: 104593 HomoloGene: 2250 GeneCards: XCL1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• chemokine receptor binding; • cytokine activity; • protein homodimerization activity; • chemokine activity; • CCR chemokine receptor binding; • GO:0001948 protein binding;
Клітинна компонента	• extracellular region; • extracellular space;
Біологічний процес	• cellular response to transforming growth factor beta stimulus; • cellular response to interleukin-4; • release of sequestered calcium ion into cytosol; • negative regulation of interferon-gamma production; • positive regulation of T-helper 1 cell cytokine production; • monocyte chemotaxis; • positive regulation of interleukin-10 production; • positive regulation of natural killer cell chemotaxis; • chemokine-mediated signaling pathway; • positive regulation of CD4-positive, alpha-beta T cell proliferation; • cellular response to tumor necrosis factor; • cell-cell signaling; • positive regulation of thymocyte migration; • response to virus; • positive regulation of T cell mediated cytotoxicity; • positive regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol; • negative regulation of T-helper 1 type immune response; • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity; • neutrophil chemotaxis; • хемотаксис; • positive regulation of leukocyte chemotaxis; • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity; • positive regulation of granzyme A production; • positive regulation of immunoglobulin production in mucosal tissue; • negative regulation of T cell cytokine production; • positive regulation of T cell cytokine production; • cellular response to interleukin-1; • positive regulation of T cell chemotaxis; • mature natural killer cell chemotaxis; • regulation of inflammatory response; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • positive regulation of neutrophil chemotaxis; • cellular response to interferon-gamma; • Імунна відповідь; • positive regulation of B cell chemotaxis; • positive regulation of transforming growth factor beta production; • negative regulation of CD4-positive, alpha-beta T cell proliferation; • positive regulation of T-helper 2 cell cytokine production; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of CD8-positive, alpha-beta T cell proliferation; • negative regulation of interleukin-2 production; • negative regulation of T-helper 1 cell activation; • positive regulation of granzyme B production; • Сигнальна трансдукція; • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide; • regulation of signaling receptor activity; • G protein-coupled receptor signaling pathway; • inflammatory response; • lymphocyte chemotaxis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	6375
	16963
	ENSG00000143184
	ENSMUSG00000026573
	P47992
	P47993
	NM_002995
	NM_008510
	NP_002986
	NP_032536
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

XCL1 (англ. X-C motif chemokine ligand 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 114 амінокислот, а молекулярна маса — 12 517[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRLLILALLG	ICSLTAYIVE	GVGSEVSDKR	TCVSLTTQRL	PVSRIKTYTI
TEGSLRAVIF	ITKRGLKVCA	DPQATWVRDV	VRSMDRKSNT	RNNMIQTKPT
GTQQSTNTAV	TLTG

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у такому біологічному процесі як хемотаксис. Секретований назовні.

Література

Yoshida T., Imai T., Kakizaki M., Nishimura M., Yoshie O. (1995). Molecular cloning of a novel C or gamma type chemokine, SCM-1.. FEBS Lett. 360: 155 — 159. PubMed DOI:10.1016/0014-5793(95)00093-O
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10645 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.
UniProt, P47992 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10645 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P47992 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.