Альфа-катенін 1

Альфа-катенін 1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1H6G, 4EHP, 4IGG
Ідентифікатори
Символи	CTNNA1, CAP102, Catenin, MDPT2, catenin alpha 1
Зовнішні ІД	OMIM: 116805 MGI: 88274 HomoloGene: 1433 GeneCards: CTNNA1
Пов'язані генетичні захворювання
	patterned macular dystrophy 2[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• gamma-catenin binding; • actin filament binding; • beta-catenin binding; • GO:0001948 protein binding; • vinculin binding; • structural molecule activity; • protein heterodimerization activity; • RNA binding; • cadherin binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• Акросома; • Цитоскелет; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • intercalated disc; • actin cytoskeleton; • Адгезивні контакти; • catenin complex; • гіалоплазма; • мембрана; • клітинна мембрана; • цитоплазма; • cell-cell junction; • Міжклітинні контакти; • lamellipodium; • комплекс Ґольджі; • focal adhesion; • zonula adherens; • flotillin complex;
Біологічний процес	• positive regulation of smoothened signaling pathway; • actin filament organization; • response to estrogen; • regulation of cell population proliferation; • response to organic cyclic compound; • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand; • negative regulation of neuroblast proliferation; • establishment or maintenance of cell polarity; • positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand; • gap junction assembly; • cellular protein localization; • negative regulation of cell motility; • negative regulation of integrin-mediated signaling pathway; • apical junction assembly; • Адгезія клітин; • Старіння людини; • male gonad development; • protein heterooligomerization; • adherens junction organization; • positive regulation of muscle cell differentiation; • ovarian follicle development; • odontogenesis of dentin-containing tooth; • cellular response to indole-3-methanol; • negative regulation of apoptotic process; • axon regeneration; • epithelial cell-cell adhesion;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	1495
	12385
	ENSG00000044115
	ENSMUSG00000037815
	P35221
	P26231
NM_001290307; NM_001290309; NM_001290310; NM_001290312; NM_001903;
	NM_001323982; NM_001323983; NM_001323984; NM_001323985; NM_001323986; NM_001323987; NM_001323988; NM_001323989; NM_001323990; NM_001323991; NM_001323992; NM_001323993; NM_001323994; NM_001323995; NM_001323996; NM_001323997; NM_001323998; NM_001323999; NM_001324000; NM_001324001; NM_001324002; NM_001324003; NM_001324004; NM_001324005; NM_001324006; NM_001324007; NM_001324008; NM_001324009; NM_001324010; NM_001324011; NM_001324012; NM_001324013
	NM_009818
NP_001277236; NP_001277238; NP_001277239; NP_001277241; NP_001310911;
	NP_001310912; NP_001310913; NP_001310914; NP_001310915; NP_001310916; NP_001310917; NP_001310918; NP_001310919; NP_001310920; NP_001310921; NP_001310922; NP_001310923; NP_001310924; NP_001310925; NP_001310926; NP_001310927; NP_001310928; NP_001310929; NP_001310930; NP_001310931; NP_001310932; NP_001310933; NP_001310934; NP_001310935; NP_001310936; NP_001310937; NP_001310938; NP_001310939; NP_001310940; NP_001310941; NP_001310942; NP_001894; NP_001277236.1
	NP_033948
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Альфа-катенін 1 (англ. Catenin alpha 1) – білок, який кодується геном CTNNA1, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 906 амінокислот, а молекулярна маса — 100 071[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTAVHAGNIN	FKWDPKSLEI	RTLAVERLLE	PLVTQVTTLV	NTNSKGPSNK
KRGRSKKAHV	LAASVEQATE	NFLEKGDKIA	KESQFLKEEL	VAAVEDVRKQ
GDLMKAAAGE	FADDPCSSVK	RGNMVRAARA	LLSAVTRLLI	LADMADVYKL
LVQLKVVEDG	ILKLRNAGNE	QDLGIQYKAL	KPEVDKLNIM	AAKRQQELKD
VGHRDQMAAA	RGILQKNVPI	LYTASQACLQ	HPDVAAYKAN	RDLIYKQLQQ
AVTGISNAAQ	ATASDDASQH	QGGGGGELAY	ALNNFDKQII	VDPLSFSEER
FRPSLEERLE	SIISGAALMA	DSSCTRDDRR	ERIVAECNAV	RQALQDLLSE
YMGNAGRKER	SDALNSAIDK	MTKKTRDLRR	QLRKAVMDHV	SDSFLETNVP
LLVLIEAAKN	GNEKEVKEYA	QVFREHANKL	IEVANLACSI	SNNEEGVKLV
RMSASQLEAL	CPQVINAALA	LAAKPQSKLA	QENMDLFKEQ	WEKQVRVLTD
AVDDITSIDD	FLAVSENHIL	EDVNKCVIAL	QEKDVDGLDR	TAGAIRGRAA
RVIHVVTSEM	DNYEPGVYTE	KVLEATKLLS	NTVMPRFTEQ	VEAAVEALSS
DPAQPMDENE	FIDASRLVYD	GIRDIRKAVL	MIRTPEELDD	SDFETEDFDV
RSRTSVQTED	DQLIAGQSAR	AIMAQLPQEQ	KAKIAEQVAS	FQEEKSKLDA
EVSKWDDSGN	DIIVLAKQMC	MIMMEMTDFT	RGKGPLKNTS	DVISAAKKIA
EAGSRMDKLG	RTIADHCPDS	ACKQDLLAYL	QRIALYCHQL	NICSKVKAEV
QNLGGELVVS	GVDSAMSLIQ	AAKNLMNAVV	QTVKASYVAS	TKYQKSQGMA
SLNLPAVSWK	MKAPEKKPLV	KREKQDETQT	KIKRASQKKH	VNPVQALSEF
KAMDSI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як клітинна адгезія. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах.

Література

Rimm D.L., Kebriaei P., Morrow J.S. (1994). Molecular cloning reveals alternative splice forms of human alpha(E)-catenin.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 203: 1691 — 1699. PubMed DOI:10.1006/bbrc.1994.2381
Kask M., Pruunsild P., Timmusk T. (2011). Bidirectional transcription from human LRRTM2/CTNNA1 and LRRTM1/CTNNA2 gene loci leads to expression of N-terminally truncated CTNNA1 and CTNNA2 isoforms.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 411: 56 — 61. PubMed DOI:10.1016/j.bbrc.2011.06.085
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Butz S., Kemler R. (1994). Distinct cadherin-catenin complexes in Ca(2+)-dependent cell-cell adhesion.. FEBS Lett. 355: 195 — 200. PubMed DOI:10.1016/0014-5793(94)01205-9
Koslov E.R., Maupin P., Pradhan D., Morrow J.S., Rimm D.L. (1997). Alpha-catenin can form asymmetric homodimeric complexes and/or heterodimeric complexes with beta-catenin.. J. Biol. Chem. 272: 27301 — 27306. PubMed DOI:10.1074/jbc.272.43.27301
Gocke C.B., Yu H., Kang J. (2005). Systematic identification and analysis of mammalian small ubiquitin-like modifier substrates.. J. Biol. Chem. 280: 5004 — 5012. PubMed DOI:10.1074/jbc.M411718200

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з Альфа-катенін 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2509 (англ.). Процитовано 21 серпня 2017.
UniProt, P35221 (англ.). Процитовано 21 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 5

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з Альфа-катенін 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2509 (англ.). Процитовано 21 серпня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P35221 (англ.). Процитовано 21 серпня 2017.