Альфа-ланцюг фібриногену

Альфа-ланцюг фібриногену
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1BBR, 1DM4, 1FPH, 1FZA, 1FZB, 1FZC, 1FZD, 1FZE, 1FZF, 1FZG, 1LT9, 1LTJ, 1N86, 1N8E, 1RE3, 1RE4, 1RF0, 1RF1, 1YCP, 2A45, 2FFD, 2H43, 2HLO, 2HOD, 2HPC, 2OYH, 2OYI, 2Q9I, 2XNX, 2XNY, 2Z4E, 3AT0, 3BVH, 3E1I, 3GHG, 3H32, 3HUS, 4F27, 5CFA
Ідентифікатори
Символи	FGA, Fib2, fibrinogen alpha chain
Зовнішні ІД	OMIM: 134820 MGI: 1316726 HomoloGene: 428 GeneCards: FGA
Пов'язані генетичні захворювання
	familial visceral amyloidosis, congenital fibrinogen deficiency[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein-macromolecule adaptor activity; • structural molecule activity; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948 protein binding; • signaling receptor binding; • cell adhesion molecule binding;
Клітинна компонента	• platelet alpha granule; • extracellular vesicle; • клітинна мембрана; • Фібриноген; • extracellular region; • cell surface; • cell cortex; • Екзосома; • platelet alpha granule lumen; • external side of plasma membrane; • blood microparticle; • extracellular space; • endoplasmic reticulum lumen;
Біологічний процес	• гемостаз; • cellular protein metabolic process; • negative regulation of endothelial cell apoptotic process; • positive regulation of peptide hormone secretion; • protein polymerization; • positive regulation of heterotypic cell-cell adhesion; • adaptive immune response; • Фібриноліз; • immune system process; • platelet degranulation; • зсідання крові; • extracellular matrix organization; • response to calcium ion; • positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading; • blood coagulation, common pathway; • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors; • positive regulation of vasoconstriction; • positive regulation of protein secretion; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • negative regulation of blood coagulation, common pathway; • positive regulation of exocytosis; • blood coagulation, fibrin clot formation; • plasminogen activation; • cell-matrix adhesion; • Вроджений імунітет; • platelet aggregation; • Сигнальна трансдукція; • induction of bacterial agglutination; • platelet activation; • toll-like receptor signaling pathway; • посттрансляційна модифікація;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	2243
	14161
	ENSG00000171560
	ENSMUSG00000028001
	P02671
	E9PV24
	NM_000508; NM_021871
	NM_001111048; NM_010196
	NP_000499; NP_068657
	NP_001104518; NP_034326
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Альфа-ланцюг фібриногену (англ. Fibrinogen alpha chain) – білок, який кодується геном FGA, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 866 амінокислот, а молекулярна маса — 94 973[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFSMRIVCLV	LSVVGTAWTA	DSGEGDFLAE	GGGVRGPRVV	ERHQSACKDS
DWPFCSDEDW	NYKCPSGCRM	KGLIDEVNQD	FTNRINKLKN	SLFEYQKNNK
DSHSLTTNIM	EILRGDFSSA	NNRDNTYNRV	SEDLRSRIEV	LKRKVIEKVQ
HIQLLQKNVR	AQLVDMKRLE	VDIDIKIRSC	RGSCSRALAR	EVDLKDYEDQ
QKQLEQVIAK	DLLPSRDRQH	LPLIKMKPVP	DLVPGNFKSQ	LQKVPPEWKA
LTDMPQMRME	LERPGGNEIT	RGGSTSYGTG	SETESPRNPS	SAGSWNSGSS
GPGSTGNRNP	GSSGTGGTAT	WKPGSSGPGS	TGSWNSGSSG	TGSTGNQNPG
SPRPGSTGTW	NPGSSERGSA	GHWTSESSVS	GSTGQWHSES	GSFRPDSPGS
GNARPNNPDW	GTFEEVSGNV	SPGTRREYHT	EKLVTSKGDK	ELRTGKEKVT
SGSTTTTRRS	CSKTVTKTVI	GPDGHKEVTK	EVVTSEDGSD	CPEAMDLGTL
SGIGTLDGFR	HRHPDEAAFF	DTASTGKTFP	GFFSPMLGEF	VSETESRGSE
SGIFTNTKES	SSHHPGIAEF	PSRGKSSSYS	KQFTSSTSYN	RGDSTFESKS
YKMADEAGSE	ADHEGTHSTK	RGHAKSRPVR	DCDDVLQTHP	SGTQSGIFNI
KLPGSSKIFS	VYCDQETSLG	GWLLIQQRMD	GSLNFNRTWQ	DYKRGFGSLN
DEGEGEFWLG	NDYLHLLTQR	GSVLRVELED	WAGNEAYAEY	HFRVGSEAEG
YALQVSSYEG	TAGDALIEGS	VEEGAEYTSH	NNMQFSTFDR	DADQWEENCA
EVYGGGWWYN	NCQAANLNGI	YYPGGSYDPR	NNSPYEIENG	VVWVSFRGAD
YSLRAVRMKI	RPLVTQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як адаптивний імунітет, зсідання крові, гемостаз, імунітет, вроджений імунітет. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Kant J.A., Lord S.T., Crabtree G.R. (1983). Partial mRNA sequences for human A alpha, B beta, and gamma fibrinogen chains: evolutionary and functional implications.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 80: 3953 — 3957. PubMed DOI:10.1073/pnas.80.13.3953
Rixon M.W., Chan W.-Y., Davie E.W., Chung D.W. (1983). Characterization of a complementary deoxyribonucleic acid coding for the alpha chain of human fibrinogen.. Biochemistry 22: 3237 — 3244. PubMed DOI:10.1021/bi00282a031
Watt K.W.K., Cottrell B.A., Strong D.D., Doolittle R.F. (1979). Amino acid sequence studies on the alpha chain of human fibrinogen. Overlapping sequences providing the complete sequence.. Biochemistry 18: 5410 — 5416. PubMed DOI:10.1021/bi00591a024
Imam A.M.A., Eaton M.A.W., Williamson R., Humphries S. (1983). Isolation and characterisation of cDNA clones for the A alpha- and gamma-chains of human fibrinogen.. Nucleic Acids Res. 11: 7427 — 7434. PubMed DOI:10.1093/nar/11.21.7427
Chung D.W., Rixon M.W., Que B.G., Davie E.W. (1983). Cloning of fibrinogen genes and their cDNA.. Ann. N. Y. Acad. Sci. 408: 449 — 456. PubMed DOI:10.1111/j.1749-6632.1983.tb23265.x

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з Альфа-ланцюг фібриногену переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3661 (англ.). Процитовано 30 січня 2017.
UniProt, P02671 (англ.). Процитовано 30 січня 2017.

Див. також

Хромосома 4

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з Альфа-ланцюг фібриногену переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3661 (англ.). Процитовано 30 січня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P02671 (англ.). Процитовано 30 січня 2017.