Аполіпопротеїн D

Аполіпротеїн D
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2HZQ, 2HZR
Ідентифікатори
Символи	APOD, Apod, apolipoprotein D
Зовнішні ІД	OMIM: 107740 MGI: 88056 HomoloGene: 1246 GeneCards: APOD
Онтологія гена
Молекулярна функція	• lipid transporter activity; • transporter activity; • cholesterol binding; • GO:0001948 protein binding; • small molecule binding; • lipid binding;
Клітинна компонента	• cytosolic ribosome; • внутрішньоклітинний; • neuronal cell body; • Дендрит (нейробіологія); • Ендоплазматичний ретикулум; • perinuclear region of cytoplasm; • Екзосома; • extracellular space; • extracellular region; • цитоплазма;
Біологічний процес	• negative regulation of T cell migration; • negative regulation of platelet-derived growth factor receptor signaling pathway; • negative regulation of monocyte chemotactic protein-1 production; • negative regulation of smooth muscle cell proliferation; • tissue regeneration; • lipid metabolism; • response to reactive oxygen species; • negative regulation of smooth muscle cell-matrix adhesion; • Старіння людини; • negative regulation of lipoprotein lipid oxidation; • brain development; • peripheral nervous system axon regeneration; • response to axon injury; • Ангіогенез; • glucose metabolic process; • negative regulation of focal adhesion assembly; • negative regulation of protein import into nucleus; • negative regulation of cytokine production involved in inflammatory response; • lipid transport; • транспорт;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	347
	11815
	ENSG00000189058
	ENSMUSG00000022548
	P05090
	P51910
	NM_001647
	NM_001301353; NM_001301354; NM_007470
	NP_001638
	NP_001288282; NP_001288283; NP_031496
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Аполіпротеїн D (англ. Apolipoprotein D) – білок, який кодується геном APOD, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 189 амінокислот, а молекулярна маса — 21 276[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVMLLLLLSA	LAGLFGAAEG	QAFHLGKCPN	PPVQENFDVN	KYLGRWYEIE
KIPTTFENGR	CIQANYSLME	NGKIKVLNQE	LRADGTVNQI	EGEATPVNLT
EPAKLEVKFS	WFMPSAPYWI	LATDYENYAL	VYSCTCIIQL	FHVDFAWILA
RNPNLPPETV	DSLKNILTSN	NIDVKKMTVT	DQVNCPKLS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як транспорт. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Holzfeind P., Merschak P., Dieplinger H., Redl B. (1995). The human lacrimal gland synthesizes apolipoprotein D mRNA in addition to tear prealbumin mRNA, both species encoding members of the lipocalin superfamily.. Exp. Eye Res. 61: 495 — 500. PubMed DOI:10.1016/S0014-4835(05)80145-9
Balbin M., Freije J.M.P., Fueyo A., Sanchez L.M., Lopez-Otin C. (1990). Apolipoprotein D is the major protein component in cyst fluid from women with human breast gross cystic disease.. Biochem. J. 271: 803 — 807. PubMed DOI:10.1042/bj2710803
Bunkenborg J., Pilch B.J., Podtelejnikov A.V., Wisniewski J.R. (2004). Screening for N-glycosylated proteins by liquid chromatography mass spectrometry.. Proteomics 4: 454 — 465. PubMed DOI:10.1002/pmic.200300556
Halim A., Nilsson J., Ruetschi U., Hesse C., Larson G. (2011). Human urinary glycoproteomics; attachment site specific analysis of N-and O-linked glycosylations by CID and ECD.. Mol. Cell. Proteomics: —. PubMed DOI:10.1074/mcp.M111.013649
Schindler P.A., Settineri C.A., Collet X., Fielding C.J., Burlingame A.L. (1995). Site-specific detection and structural characterization of the glycosylation of human plasma proteins lecithin:cholesterol acyltransferase and apolipoprotein D using HPLC/electrospray mass spectrometry and sequential glycosidase digestion.. Protein Sci. 4: 791 — 803. PubMed DOI:10.1002/pro.5560040419

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:612 (англ.). Процитовано 30 січня 2017.
UniProt, P05090 (англ.). Процитовано 30 січня 2017.

Див. також

Хромосома 3

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:612 (англ.). Процитовано 30 січня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P05090 (англ.). Процитовано 30 січня 2017.