Каспаза-6

CASP6
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2WDP, 3K7E, 3NKF, 3NR2, 3OD5, 3P45, 3P4U, 3QNW, 3S70, 3S8E, 3V6L, 3V6M, 4EJF, 4FXO, 4HVA, 4IYR, 4N5D, 4N6G, 4N7J, 4N7M, 4NBK, 4NBL, 4NBN
Ідентифікатори
Символи	CASP6, MCH2, Caspase 6
Зовнішні ІД	OMIM: 601532 MGI: 1312921 HomoloGene: 37455 GeneCards: CASP6
Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptidase activity; • cysteine-type endopeptidase activity; • cysteine-type peptidase activity; • endopeptidase activity; • GO:0001948 protein binding; • hydrolase activity; • identical protein binding; • cysteine-type endopeptidase activity involved in execution phase of apoptosis; • cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • Нуклеоплазма; • цитоплазма;
Біологічний процес	• epithelial cell differentiation; • Протеоліз; • Апоптоз; • regulation of apoptotic process; • execution phase of apoptosis; • cellular response to staurosporine;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	839
	12368
	ENSG00000138794
	ENSMUSG00000027997
	P55212
	O08738
	NM_001226; NM_032992
	NM_009811
	NP_001217; NP_116787
	NP_033941
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CASP6 (англ. Caspase 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 293 амінокислот, а молекулярна маса — 33 310[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSSASGLRRG	HPAGGEENMT	ETDAFYKREM	FDPAEKYKMD	HRRRGIALIF
NHERFFWHLT	LPERRGTCAD	RDNLTRRFSD	LGFEVKCFND	LKAEELLLKI
HEVSTVSHAD	ADCFVCVFLS	HGEGNHIYAY	DAKIEIQTLT	GLFKGDKCHS
LVGKPKIFII	QACRGNQHDV	PVIPLDVVDN	QTEKLDTNIT	EVDAASVYTL
PAGADFLMCY	SVAEGYYSHR	ETVNGSWYIQ	DLCEMLGKYG	SSLEFTELLT
LVNRKVSQRR	VDFCKDPSAI	GKKQVPCFAS	MLTKKLHFFP	KSN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Bartke T., Pohl C., Pyrowolakis G., Jentsch S. (2004). Dual role of BRUCE as an antiapoptotic IAP and a chimeric E2/E3 ubiquitin ligase.. Mol. Cell 14: 801 — 811. PubMed DOI:10.1016/j.molcel.2004.05.018
Fernandes-Alnemri T., Litwack G., Alnemri E.S. (1995). Mch2, a new member of the apoptotic Ced-3/Ice cysteine protease gene family.. Cancer Res. 55: 2737 — 2742. PubMed

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1507 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
UniProt, P55212 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1507 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P55212 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.