Люмікан

Люмікан
Ідентифікатори
Символи	LUM, LDC, SLRR2D, lumican
Зовнішні ІД	OMIM: 600616 MGI: 109347 HomoloGene: 37614 GeneCards: LUM
Онтологія гена
Молекулярна функція	• collagen binding; • extracellular matrix structural constituent; • GO:0001948 protein binding; • extracellular matrix structural constituent conferring compression resistance;
Клітинна компонента	• GO:0005578 Позаклітинна матриця; • fibrillar collagen trimer; • lysosomal lumen; • Golgi lumen; • Екзосома; • extracellular space; • extracellular region; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• response to organic cyclic compound; • axonogenesis; • collagen fibril organization; • extracellular matrix organization; • positive regulation of transforming growth factor beta1 production; • cartilage development; • keratan sulfate catabolic process; • response to growth factor; • keratan sulfate biosynthetic process; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • зір;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4060
	17022
	ENSG00000139329
	ENSMUSG00000036446
	P51884
	P51885
	NM_002345
	NM_008524
	NP_002336
	NP_032550
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Люмікан (англ. Lumican) – білок, який кодується геном LUM, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 338 амінокислот, а молекулярна маса — 38 429[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSLSAFTLFL	ALIGGTSGQY	YDYDFPLSIY	GQSSPNCAPE	CNCPESYPSA
MYCDELKLKS	VPMVPPGIKY	LYLRNNQIDH	IDEKAFENVT	DLQWLILDHN
LLENSKIKGR	VFSKLKQLKK	LHINHNNLTE	SVGPLPKSLE	DLQLTHNKIT
KLGSFEGLVN	LTFIHLQHNR	LKEDAVSAAF	KGLKSLEYLD	LSFNQIARLP
SGLPVSLLTL	YLDNNKISNI	PDEYFKRFNA	LQYLRLSHNE	LADSGIPGNS
FNVSSLVELD	LSYNKLKNIP	TVNENLENYY	LEVNQLEKFD	IKSFCKILGP
LSYSKIKHLR	LDGNRISETS	LPPDMYECLR	VANEVTLN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

Grover J., Chen X.-N., Korenberg J.R., Roughley P.J. (1995). The human lumican gene. Organization, chromosomal location, and expression in articular cartilage.. J. Biol. Chem. 270: 21942 — 21949. PubMed DOI:10.1074/jbc.270.37.21942
Chakravarti S., Stallings R.L., Sundar-Raj N., Cornuet P.K., Hassell J.R. (1995). Primary structure of human lumican (keratan sulfate proteoglycan) and localization of the gene (LUM) to chromosome 12q21.3-q22.. Genomics 27: 481 — 488. PubMed DOI:10.1006/geno.1995.1080
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Onnerfjord P., Heathfield T.F., Heinegaard D. (2004). Identification of tyrosine sulfation in extracellular leucine-rich repeat proteins using mass spectrometry.. J. Biol. Chem. 279: 26 — 33. PubMed DOI:10.1074/jbc.M308689200
Bunkenborg J., Pilch B.J., Podtelejnikov A.V., Wisniewski J.R. (2004). Screening for N-glycosylated proteins by liquid chromatography mass spectrometry.. Proteomics 4: 454 — 465. PubMed DOI:10.1002/pmic.200300556

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6724 (англ.). Процитовано 30 січня 2017.
UniProt, P51884 (англ.). Процитовано 30 січня 2017.

Див. також

Хромосома 12

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6724 (англ.). Процитовано 30 січня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P51884 (англ.). Процитовано 30 січня 2017.