Нефрин

NPHS1 (англ. NPHS1, nephrin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 241 амінокислот, а молекулярна маса — 134 742[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MALGTTLRASLLLLGLLTEGLAQLAIPASVPRGFWALPENLTVVEGASVE
LRCGVSTPGSAVQWAKDGLLLGPDPRIPGFPRYRLEGDPARGEFHLHIEA
CDLSDDAEYECQVGRSEMGPELVSPRVILSILVPPKLLLLTPEAGTMVTW
VAGQEYVVNCVSGDAKPAPDITILLSGQTISDISANVNEGSQQKLFTVEA
TARVTPRSSDNRQLLVCEASSPALEAPIKASFTVNVLFPPGPPVIEWPGL
DEGHVRAGQSLELPCVARGGNPLATLQWLKNGQPVSTAWGTEHTQAVARS
VLVMTVRPEDHGAQLSCEAHNSVSAGTQEHGITLQVTFPPSAIIILGSAS
QTENKNVTLSCVSKSSRPRVLLRWWLGWRQLLPMEETVMDGLHGGHISMS
NLTFLARREDNGLTLTCEAFSEAFTKETFKKSLILNVKYPAQKLWIEGPP
EGQKLRAGTRVRLVCLAIGGNPEPSLMWYKDSRTVTESRLPQESRRVHLG
SVEKSGSTFSRELVLVTGPSDNQAKFTCKAGQLSASTQLAVQFPPTNVTI
LANASALRPGDALNLTCVSVSSNPPVNLSWDKEGERLEGVAAPPRRAPFK
GSAAARSVLLQVSSRDHGQRVTCRAHSAELRETVSSFYRLNVLYRPEFLG
EQVLVVTAVEQGEALLPVSVSANPAPEAFNWTFRGYRLSPAGGPRHRILS
SGALHLWNVTRADDGLYQLHCQNSEGTAEARLRLDVHYAPTIRALQDPTE
VNVGGSVDIVCTVDANPILPGMFNWERLGEDEEDQSLDDMEKISRGPTGR
LRIHHAKLAQAGAYQCIVDNGVAPPARRLLRLVVRFAPQVEHPTPLTKVA
AAGDSTSSATLHCRARGVPNIVFTWTKNGVPLDLQDPRYTEHTYHQGGVH
SSLLTIANVSAAQDYALFTCTATNALGSDQTNIQLVSISRPDPPSGLKVV
SLTPHSVGLEWKPGFDGGLPQRFCIRYEALGTPGFHYVDVVPPQATTFTL
TGLQPSTRYRVWLLASNALGDSGLADKGTQLPITTPGLHQPSGEPEDQLP
TEPPSGPSGLPLLPVLFALGGLLLLSNASCVGGVLWQRRLRRLAEGISEK
TEAGSEEDRVRNEYEESQWTGERDTQSSTVSTTEAEPYYRSLRDFSPQLP
PTQEEVSYSRGFTGEDEDMAFPGHLYDEVERTYPPSGAWGPLYDEVQMGP
WDLHWPEDTYQDPRGIYDQVAGDLDTLEPDSLPFELRGHLV
NPHS1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи NPHS1, CNF, NPHN, nephrin, NPHS1 nephrin, nephrin, NPHS1 adhesion molecule, nephrin
Зовнішні ІД OMIM: 602716 MGI: 1859637 HomoloGene: 20974 GeneCards: NPHS1
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4868
54631
Ensembl
ENSG00000161270
ENSMUSG00000006649
UniProt
O60500
Q9QZS7
RefSeq (мРНК)
NM_004646
NM_019459
RefSeq (білок)
NP_004637
NP_062332
Локус (UCSC) Хр. 19: 35.83 – 35.87 Mb Хр. 7: 30.46 – 30.49 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, міогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

  • Huber T.B., Kottgen M., Schilling B., Walz G., Benzing T. (2001). Interaction with podocin facilitates nephrin signaling.. J. Biol. Chem. 276: 41543 — 41546. PubMed DOI:10.1074/jbc.C100452200
  • Aya K., Tanaka H., Seino Y. (2000). Novel mutation in the nephrin gene of a Japanese patient with congenital nephrotic syndrome of the Finnish type.. Kidney Int. 57: 401 — 404. PubMed DOI:10.1046/j.1523-1755.2000.00859.x
  • Beltcheva O., Martin P., Lenkkeri U., Tryggvason K. (2001). Mutation spectrum in the nephrin gene (NPHS1) in congenital nephrotic syndrome.. Hum. Mutat. 17: 368 — 373. PubMed DOI:10.1002/humu.1111
  • Wu L.Q., Hu J.J., Xue J.J., Liang D.S. (2011). Two novel NPHS1 mutations in a Chinese family with congenital nephrotic syndrome.. Genet. Mol. Res. 10: 2517 — 2522. PubMed DOI:10.4238/2011.October.18.1
  • Tikhomirov E., Voznesenskaya T., Tsygin A. (2009). Novel human pathological mutations. Gene symbol: NPHS1. Disease: congenital nephrotic syndrome, Finnish type.. Hum. Genet. 125: 334 — 334. PubMed

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7908 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
  4. UniProt, O60500 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.