Рибосомний білок S11

Рибосомний білок S11
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 4KZY, 3J7R, 4D61, 4KZX, 4D5L, 4V5Z, 5FLX, 4UJD, 3J7P, 4KZZ, 4UJE, 4UJC
Ідентифікатори
Символи	RPS11, S11, ribosomal protein S11
Зовнішні ІД	OMIM: 180471 MGI: 1351329 HomoloGene: 88443 GeneCards: RPS11
Онтологія гена
Молекулярна функція	• rRNA binding; • structural constituent of ribosome; • GO:0001948 protein binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • рибосома; • focal adhesion; • внутрішньоклітинний; • Ядерце; • Екзосома; • Нуклеоплазма; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • мембрана; • cytosolic small ribosomal subunit;
Біологічний процес	• viral transcription; • SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane; • translational initiation; • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; • Біосинтез білків; • rRNA processing; • osteoblast differentiation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	6205
	27207
	ENSG00000142534
	ENSMUSG00000003429
	P62280
	P62281
	NM_001015
	NM_013725
	NP_001006
	NP_038753
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Рибосомний білок S11 (англ. Ribosomal protein S11) – білок, який кодується геном RPS11, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 158 амінокислот, а молекулярна маса — 18 431[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MADIQTERAY	QKQPTIFQNK	KRVLLGETGK	EKLPRYYKNI	GLGFKTPKEA
IEGTYIDKKC	PFTGNVSIRG	RILSGVVTKM	KMQRTIVIRR	DYLHYIRKYN
RFEKRHKNMS	VHLSPCFRDV	QIGDIVTVGE	CRPLSKTVRF	NVLKVTKAAG
TKKQFQKF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, рибосомних білків. Білок має сайт для зв'язування з РНК, рРНК.

Література

Lott J.B., Mackie G.A. (1988). Sequence of a cloned cDNA encoding human ribosomal protein S11.. Nucleic Acids Res. 16: 1205 — 1205. PubMed DOI:10.1093/nar/16.3.1205
Higa S., Yoshihama M., Tanaka T., Kenmochi N. (1999). Gene organization and sequence of the region containing the ribosomal protein genes RPL13A and RPS11 in the human genome and conserved features in the mouse genome.. Gene 240: 371 — 377. PubMed DOI:10.1016/S0378-1119(99)00429-1
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10384 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.
UniProt, P62280 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

Хромосома 19

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10384 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.

[UniProt-4] UniProt, P62280 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.