Рибосомний білок S16

Рибосомний білок S16
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 4KZY, 3J7R, 4D61, 4KZX, 4D5L, 4V5Z, 5FLX, 4UJD, 3J7P, 4KZZ, 4UJE, 4UJC
Ідентифікатори
Символи	RPS16, S16, ribosomal protein S16
Зовнішні ІД	OMIM: 603675 MGI: 98118 HomoloGene: 794 GeneCards: RPS16
Онтологія гена
Молекулярна функція	• structural constituent of ribosome; • GO:0001948 protein binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • рибосома; • мембрана; • focal adhesion; • small ribosomal subunit; • Екзосома; • Нуклеоплазма; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • cytosolic small ribosomal subunit;
Біологічний процес	• maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA); • viral transcription; • SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane; • translational initiation; • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; • ribosomal small subunit biogenesis; • Біосинтез білків; • rRNA processing; • cellular response to leukemia inhibitory factor; • liver regeneration;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	6217
	20055
	ENSG00000105193
	ENSMUSG00000037563
	P62249
	P14131
	NM_001020; NM_001321111; NM_001363860
	NM_013647
	NP_001011; NP_001308040; NP_001350789
	NP_038675
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Рибосомний білок S16 (англ. Ribosomal protein S16) – білок, який кодується геном RPS16, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 146 амінокислот, а молекулярна маса — 16 445[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPSKGPLQSV	QVFGRKKTAT	AVAHCKRGNG	LIKVNGRPLE	MIEPRTLQYK
LLEPVLLLGK	ERFAGVDIRV	RVKGGGHVAQ	IYAIRQSISK	ALVAYYQKYV
DEASKKEIKD	ILIQYDRTLL	VADPRRCESK	KFGGPGARAR	YQKSYR

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, рибосомних білків.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Batra S.K., Metzgar R.S., Hollingsworth M.A. (1991). Molecular cloning and sequence analysis of the human ribosomal protein S16.. J. Biol. Chem. 266: 6830 — 6833. PubMed

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10396 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.
UniProt, P62249 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

Хромосома 19

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10396 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.

[UniProt-4] UniProt, P62249 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.