Стоматин

Стоматин
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4FVF, 4FVG, 4FVJ
Ідентифікатори
Символи	STOM, BND7, EPB7, EPB72, stomatin
Зовнішні ІД	OMIM: 133090 MGI: 95403 HomoloGene: 81681 GeneCards: STOM
Реагує на сполуку
	Viroporin 3a [SARS-CoV-2][1]
	Viroporin 3a [SARS-CoV-2][2]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity; • GO:0001948 protein binding; • RNA polymerase binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• везикула; • blood microparticle; • мембрана; • Меланосома; • integral component of plasma membrane; • Ендоплазматичний ретикулум; • мітохондрія; • perinuclear region of cytoplasm; • membrane raft; • Екзосома; • Цитоскелет; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • extracellular space; • цитоплазма; • гіалоплазма; • клітинна мембрана; • azurophil granule membrane; • specific granule membrane; • tertiary granule membrane; • integral component of membrane;
Біологічний процес	• regulation of ion transmembrane transport; • positive regulation by host of viral genome replication; • regulation of acid-sensing ion channel activity; • protein homooligomerization; • positive regulation of viral process; • positive regulation of protein targeting to membrane; • neutrophil degranulation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	2040
	13830
	ENSG00000148175
	ENSMUSG00000026880
	P27105
	P54116
	NM_001270526; NM_001270527; NM_004099; NM_198194
	NM_013515
	NP_001257455; NP_001257456; NP_004090; NP_937837; NP_004090.4
	NP_038543
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Стоматин (англ. Stomatin) – білок, який кодується геном STOM, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 288 амінокислот, а молекулярна маса — 31 731[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAEKRHTRDS	EAQRLPDSFK	DSPSKGLGPC	GWILVAFSFL	FTVITFPISI
WMCIKIIKEY	ERAIIFRLGR	ILQGGAKGPG	LFFILPCTDS	FIKVDMRTIS
FDIPPQEILT	KDSVTISVDG	VVYYRVQNAT	LAVANITNAD	SATRLLAQTT
LRNVLGTKNL	SQILSDREEI	AHNMQSTLDD	ATDAWGIKVE	RVEIKDVKLP
VQLQRAMAAE	AEASREARAK	VIAAEGEMNA	SRALKEASMV	ITESPAALQL
RYLQTLTTIA	AEKNSTIVFP	LPIDMLQGII	GAKHSHLG

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, цитоплазматичних везикулах.

Література

Unfried I., Entler B., Prohaska R. (1995). The organization of the gene (EPB72) encoding the human erythrocyte band 7 integral membrane protein (protein 7.2b).. Genomics 30: 521 — 528. PubMed DOI:10.1006/geno.1995.1273
Gallagher P.G., Forget B.G. (1995). Structure, organization, and expression of the human band 7.2b gene, a candidate gene for hereditary hydrocytosis.. J. Biol. Chem. 270: 26358 — 26363. PubMed DOI:10.1074/jbc.270.44.26358
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Salzer U., Ahorn H., Prohaska R. (1993). Identification of the phosphorylation site on human erythrocyte band 7 integral membrane protein: implications for a monotopic protein structure.. Biochim. Biophys. Acta 1151: 149 — 152. PubMed DOI:10.1016/0005-2736(93)90098-K
Snyers L., Umlauf E., Prohaska R. (1998). Oligomeric nature of the integral membrane protein stomatin.. J. Biol. Chem. 273: 17221 — 17226. PubMed DOI:10.1074/jbc.273.27.17221
Snyers L., Umlauf E., Prohaska R. (1999). Cysteine 29 is the major palmitoylation site on stomatin.. FEBS Lett. 449: 101 — 104. PubMed DOI:10.1016/S0014-5793(99)00417-2

Примітки

Сполуки, які фізично взаємодіють з Стоматин переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Сполуки, які фізично взаємодіють з Stomatin, isoform CRA_a переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3383 (англ.). Процитовано 30 січня 2017.
UniProt, P27105 (англ.). Процитовано 30 січня 2017.

Див. також

Хромосома 9

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Стоматин переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з Stomatin, isoform CRA_a переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3383 (англ.). Процитовано 30 січня 2017.

[UniProt-6] UniProt, P27105 (англ.). Процитовано 30 січня 2017.