Талін-1

Талін-1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1SYQ, 2MWN, 4DJ9
Ідентифікатори
Символи	TLN1, ILWEQ, TLN, talin 1, talin-1
Зовнішні ІД	OMIM: 186745 MGI: 1099832 HomoloGene: 21267 GeneCards: TLN1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• structural constituent of cytoskeleton; • actin filament binding; • LIM domain binding; • integrin binding; • GO:0001948 protein binding; • vinculin binding; • GO:0032403 protein-containing complex binding; • actin binding; • cadherin binding; • phosphatidylserine binding; • phosphatidylinositol binding;
Клітинна компонента	• Цитоскелет; • cell projection; • ruffle membrane; • ruffle; • гіалоплазма; • Екзосома; • мембрана; • cell surface; • cell-cell junction; • Міжклітинні контакти; • focal adhesion; • extracellular region; • цитоплазма; • клітинна мембрана;
Біологічний процес	• cell-substrate junction assembly; • IRE1-mediated unfolded protein response; • м'язове скорочення; • platelet degranulation; • movement of cell or subcellular component; • platelet aggregation; • cell-cell junction assembly; • GO:0033109 cortical actin cytoskeleton organization; • Адгезія клітин; • GO:0022415 viral process; • integrin-mediated signaling pathway; • integrin activation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	7094
	21894
	ENSG00000137076
	ENSMUSG00000028465
	Q9Y490
	P26039
	NM_006289
	NM_011602
	NP_006280
	NP_035732
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Талін-1 (англ. Talin 1) – білок, який кодується геном TLN1, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 541 амінокислот, а молекулярна маса — 269 767[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVALSLKISI	GNVVKTMQFE	PSTMVYDACR	IIRERIPEAP	AGPPSDFGLF
LSDDDPKKGI	WLEAGKALDY	YMLRNGDTME	YRKKQRPLKI	RMLDGTVKTI
MVDDSKTVTD	MLMTICARIG	ITNHDEYSLV	RELMEEKKEE	ITGTLRKDKT
LLRDEKKMEK	LKQKLHTDDE	LNWLDHGRTL	REQGVEEHET	LLLRRKFFYS
DQNVDSRDPV	QLNLLYVQAR	DDILNGSHPV	SFDKACEFAG	FQCQIQFGPH
NEQKHKAGFL	DLKDFLPKEY	VKQKGERKIF	QAHKNCGQMS	EIEAKVRYVK
LARSLKTYGV	SFFLVKEKMK	GKNKLVPRLL	GITKECVMRV	DEKTKEVIQE
WNLTNIKRWA	ASPKSFTLDF	GDYQDGYYSV	QTTEGEQIAQ	LIAGYIDIIL
KKKKSKDHFG	LEGDEESTML	EDSVSPKKST	VLQQQYNRVG	KVEHGSVALP
AIMRSGASGP	ENFQVGSMPP	AQQQITSGQM	HRGHMPPLTS	AQQALTGTIN
SSMQAVQAAQ	ATLDDFDTLP	PLGQDAASKA	WRKNKMDESK	HEIHSQVDAI
TAGTASVVNL	TAGDPAETDY	TAVGCAVTTI	SSNLTEMSRG	VKLLAALLED
EGGSGRPLLQ	AAKGLAGAVS	ELLRSAQPAS	AEPRQNLLQA	AGNVGQASGE
LLQQIGESDT	DPHFQDALMQ	LAKAVASAAA	ALVLKAKSVA	QRTEDSGLQT
QVIAAATQCA	LSTSQLVACT	KVVAPTISSP	VCQEQLVEAG	RLVAKAVEGC
VSASQAATED	GQLLRGVGAA	ATAVTQALNE	LLQHVKAHAT	GAGPAGRYDQ
ATDTILTVTE	NIFSSMGDAG	EMVRQARILA	QATSDLVNAI	KADAEGESDL
ENSRKLLSAA	KILADATAKM	VEAAKGAAAH	PDSEEQQQRL	REAAEGLRMA
TNAAAQNAIK	KKLVQRLEHA	AKQAAASATQ	TIAAAQHAAS	TPKASAGPQP
LLVQSCKAVA	EQIPLLVQGV	RGSQAQPDSP	SAQLALIAAS	QSFLQPGGKM
VAAAKASVPT	IQDQASAMQL	SQCAKNLGTA	LAELRTAAQK	AQEACGPLEM
DSALSVVQNL	EKDLQEVKAA	ARDGKLKPLP	GETMEKCTQD	LGNSTKAVSS
AIAQLLGEVA	QGNENYAGIA	ARDVAGGLRS	LAQAARGVAA	LTSDPAVQAI
VLDTASDVLD	KASSLIEEAK	KAAGHPGDPE	SQQRLAQVAK	AVTQALNRCV
SCLPGQRDVD	NALRAVGDAS	KRLLSDSLPP	STGTFQEAQS	RLNEAAAGLN
QAATELVQAS	RGTPQDLARA	SGRFGQDFST	FLEAGVEMAG	QAPSQEDRAQ
VVSNLKGISM	SSSKLLLAAK	ALSTDPAAPN	LKSQLAAAAR	AVTDSINQLI
TMCTQQAPGQ	KECDNALREL	ETVRELLENP	VQPINDMSYF	GCLDSVMENS
KVLGEAMTGI	SQNAKNGNLP	EFGDAISTAS	KALCGFTEAA	AQAAYLVGVS
DPNSQAGQQG	LVEPTQFARA	NQAIQMACQS	LGEPGCTQAQ	VLSAATIVAK
HTSALCNSCR	LASARTTNPT	AKRQFVQSAK	EVANSTANLV	KTIKALDGAF
TEENRAQCRA	ATAPLLEAVD	NLSAFASNPE	FSSIPAQISP	EGRAAMEPIV
ISAKTMLESA	GGLIQTARAL	AVNPRDPPSW	SVLAGHSRTV	SDSIKKLITS
MRDKAPGQLE	CETAIAALNS	CLRDLDQASL	AAVSQQLAPR	EGISQEALHT
QMLTAVQEIS	HLIEPLANAA	RAEASQLGHK	VSQMAQYFEP	LTLAAVGAAS
KTLSHPQQMA	LLDQTKTLAE	SALQLLYTAK	EAGGNPKQAA	HTQEALEEAV
QMMTEAVEDL	TTTLNEAASA	AGVVGGMVDS	ITQAINQLDE	GPMGEPEGSF
VDYQTTMVRT	AKAIAVTVQE	MVTKSNTSPE	ELGPLANQLT	SDYGRLASEA
KPAAVAAENE	EIGSHIKHRV	QELGHGCAAL	VTKAGALQCS	PSDAYTKKEL
IECARRVSEK	VSHVLAALQA	GNRGTQACIT	AASAVSGIIA	DLDTTIMFAT
AGTLNREGTE	TFADHREGIL	KTAKVLVEDT	KVLVQNAAGS	QEKLAQAAQS
SVATITRLAD	VVKLGAASLG	AEDPETQVVL	INAVKDVAKA	LGDLISATKA
AAGKVGDDPA	VWQLKNSAKV	MVTNVTSLLK	TVKAVEDEAT	KGTRALEATT
EHIRQELAVF	CSPEPPAKTS	TPEDFIRMTK	GITMATAKAV	AAGNSCRQED
VIATANLSRR	AIADMLRACK	EAAYHPEVAP	DVRLRALHYG	RECANGYLEL
LDHVLLTLQK	PSPELKQQLT	GHSKRVAGSV	TELIQAAEAM	KGTEWVDPED
PTVIAENELL	GAAAAIEAAA	KKLEQLKPRA	KPKEADESLN	FEEQILEAAK
SIAAATSALV	KAASAAQREL	VAQGKVGAIP	ANALDDGQWS	QGLISAARMV
AAATNNLCEA	ANAAVQGHAS	QEKLISSAKQ	VAASTAQLLV	ACKVKADQDS
EAMKRLQAAG	NAVKRASDNL	VKAAQKAAAF	EEQENETVVV	KEKMVGGIAQ
IIAAQEEMLR	KERELEEARK	KLAQIRQQQY	KFLPSELRDE	H

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

Ben-Yosef T., Francomano C.A. (1999). Characterization of the human talin (TLN) gene: genomic structure, chromosomal localization, and expression pattern.. Genomics 62: 316 — 319. PubMed DOI:10.1006/geno.1999.6019
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Luo G., Herrera A.H., Horowits R. (1999). Molecular interactions of N-RAP, a nebulin-related protein of striated muscle myotendon junctions and intercalated disks.. Biochemistry 38: 6135 — 6143. PubMed DOI:10.1021/bi982395t
Ling K., Doughman R.L., Firestone A.J., Bunce M.W., Anderson R.A. (2002). Type I gamma phosphatidylinositol phosphate kinase targets and regulates focal adhesions.. Nature 420: 89 — 93. PubMed DOI:10.1038/nature01082
Sun N., Critchley D.R., Paulin D., Li Z., Robson R.M. (2008). Identification of a repeated domain within mammalian alpha-synemin that interacts directly with talin.. Exp. Cell Res. 314: 1839 — 1849. PubMed DOI:10.1016/j.yexcr.2008.01.034
Izard T., Vonrhein C. (2004). Structural basis for amplifying vinculin activation by talin.. J. Biol. Chem. 279: 27667 — 27678. PubMed DOI:10.1074/jbc.M403076200

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11845 (англ.). Процитовано 30 січня 2017.
UniProt, Q9Y490 (англ.). Процитовано 30 січня 2017.

Див. також

Хромосома 9

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11845 (англ.). Процитовано 30 січня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9Y490 (англ.). Процитовано 30 січня 2017.