Тканинний активатор плазміногену

PLAT
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1A5H, 1BDA, 1PK2, 1PML, 1RTF, 1TPG, 1TPK, 1TPM, 1TPN, 5BRR
Ідентифікатори
Символи	PLAT, T-PA, TPA, plasminogen activator, tissue type
Зовнішні ІД	OMIM: 173370 MGI: 97610 HomoloGene: 717 GeneCards: PLAT
Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptidase activity; • phosphoprotein binding; • serine-type peptidase activity; • serine-type endopeptidase activity; • signaling receptor binding; • hydrolase activity; • GO:0001948 protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • apical part of cell; • secretory granule; • extracellular region; • cell surface; • Екзосома; • extracellular space; • collagen-containing extracellular matrix; • Schaffer collateral - CA1 synapse; • glutamatergic synapse;
Біологічний процес	• negative regulation of proteolysis; • response to hypoxia; • Фібриноліз; • зсідання крові; • smooth muscle cell migration; • Протеоліз; • cellular protein modification process; • platelet-derived growth factor receptor signaling pathway; • plasminogen activation; • trans-synaptic signaling by BDNF, modulating synaptic transmission;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5327
	18791
	ENSG00000104368
	ENSMUSG00000031538
	P00750
	P11214
	NM_033011; NM_000930; NM_000931; NM_001319189
	NM_008872
	NP_000921; NP_001306118; NP_127509
	NP_032898
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PLAT (англ. Plasminogen activator, tissue type) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 562 амінокислот, а молекулярна маса — 62 917[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDAMKRGLCC	VLLLCGAVFV	SPSQEIHARF	RRGARSYQVI	CRDEKTQMIY
QQHQSWLRPV	LRSNRVEYCW	CNSGRAQCHS	VPVKSCSEPR	CFNGGTCQQA
LYFSDFVCQC	PEGFAGKCCE	IDTRATCYED	QGISYRGTWS	TAESGAECTN
WNSSALAQKP	YSGRRPDAIR	LGLGNHNYCR	NPDRDSKPWC	YVFKAGKYSS
EFCSTPACSE	GNSDCYFGNG	SAYRGTHSLT	ESGASCLPWN	SMILIGKVYT
AQNPSAQALG	LGKHNYCRNP	DGDAKPWCHV	LKNRRLTWEY	CDVPSCSTCG
LRQYSQPQFR	IKGGLFADIA	SHPWQAAIFA	KHRRSPGERF	LCGGILISSC
WILSAAHCFQ	ERFPPHHLTV	ILGRTYRVVP	GEEEQKFEVE	KYIVHKEFDD
DTYDNDIALL	QLKSDSSRCA	QESSVVRTVC	LPPADLQLPD	WTECELSGYG
KHEALSPFYS	ERLKEAHVRL	YPSSRCTSQH	LLNRTVTDNM	LCAGDTRSGG
PQANLHDACQ	GDSGGPLVCL	NDGRMTLVGI	ISWGLGCGQK	DVPGVYTKVT
NYLDWIRDNM	RP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, серинових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як активація плазміногену, альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

Ny T., Elgh F., Lund B. (1984). The structure of the human tissue-type plasminogen activator gene: correlation of intron and exon structures to functional and structural domains.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 81: 5355 — 5359. PubMed DOI:10.1073/pnas.81.17.5355
Sasaki H., Saito Y., Hayashi M., Otsuka K., Niwa M. (1988). Nucleotide sequence of the tissue-type plasminogen activator cDNA from human fetal lung cells.. Nucleic Acids Res. 16: 5695 — 5695. PubMed DOI:10.1093/nar/16.12.5695
Siebert P.D., Fong K. (1990). Variant tissue-type plasminogen activator (PLAT) cDNA obtained from human endothelial cells.. Nucleic Acids Res. 18: 1086 — 1086. PubMed DOI:10.1093/nar/18.4.1086
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Itagaki Y., Yasuda H., Morinaga T., Mitsuda S., Higashio K. (1991). Purification and characterization of tissue plasminogen activator secreted by human embryonic lung diploid fibroblasts, IMR-90 cells.. Agric. Biol. Chem. 55: 1225 — 1232. PubMed DOI:10.1271/bbb1961.55.1225
Pohl G., Kaellstroem M., Bergsdorf N., Wallen P., Joernvall H. (1984). Tissue plasminogen activator: peptide analyses confirm an indirectly derived amino acid sequence, identify the active site serine residue, establish glycosylation sites, and localize variant differences.. Biochemistry 23: 3701 — 3707. PubMed DOI:10.1021/bi00311a020

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9051 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.
UniProt, P00750 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 8

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9051 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P00750 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.