Тромбін

Тромбін (активований фактор зсідання крові II, fibrinogenase, thrombase, thrombofort, topical, thrombin-C, tropostasin, activated blood-coagulation factor II, blood-coagulation factor IIa, factor IIa, E thrombin, beta-thrombin, gamma-thrombin) — білок, який кодується геном F2, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[5][6] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 622 амінокислот, а молекулярна маса — 70 037[7]. Тромбін - важливий компонент системи згортання крові людини і тварин. Тромбін (КФ 3.4.21.5[8]) відноситься до ферментів класу гідролаз, групи серинових протеаз, та каталізує гідроліз пептидних зв'язків, утворених залишками аргініну і лізину (має обмежену субстратну специфічність).

Послідовність амінокислот
1020304050
MAHVRGLQLPGCLALAALCSLVHSQHVFLAPQQARSLLQRVRRANTFLEE
VRKGNLERECVEETCSYEEAFEALESSTATDVFWAKYTACETARTPRDKL
AACLEGNCAEGLGTNYRGHVNITRSGIECQLWRSRYPHKPEINSTTHPGA
DLQENFCRNPDSSTTGPWCYTTDPTVRRQECSIPVCGQDQVTVAMTPRSE
GSSVNLSPPLEQCVPDRGQQYQGRLAVTTHGLPCLAWASAQAKALSKHQD
FNSAVQLVENFCRNPDGDEEGVWCYVAGKPGDFGYCDLNYCEEAVEEETG
DGLDEDSDRAIEGRTATSEYQTFFNPRTFGSGEADCGLRPLFEKKSLEDK
TERELLESYIDGRIVEGSDAEIGMSPWQVMLFRKSPQELLCGASLISDRW
VLTAAHCLLYPPWDKNFTENDLLVRIGKHSRTRYERNIEKISMLEKIYIH
PRYNWRENLDRDIALMKLKKPVAFSDYIHPVCLPDRETAASLLQAGYKGR
VTGWGNLKETWTANVGKGQPSVLQVVNLPIVERPVCKDSTRIRITDNMFC
AGYKPDEGKRGDACEGDSGGPFVMKSPFNNRWYQMGIVSWGEGCDRDGKY
GFYTHVFRLKKWIQKVIDQFGE
Тромбін
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи F2, PT, RPRGL2, THPH1, coagulation factor II, thrombin
Зовнішні ІД OMIM: 176930 MGI: 88380 HomoloGene: 426 GeneCards: F2
Пов'язані генетичні захворювання
Hypoprothrombinemia, thrombophilia[1]
Реагує на сполуку
Дабігатран, ximelagatran[2]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
2147
14061
Ensembl
ENSG00000180210
ENSMUSG00000027249
UniProt
P00734
P19221
RefSeq (мРНК)
NM_000506
NM_001311257
NM_010168
RefSeq (білок)
NP_000497
NP_034298
Локус (UCSC) Хр. 11: 46.72 – 46.74 Mb Хр. 2: 91.63 – 91.64 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Тромбін в комплексі з інгібітором

Цей білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, серинових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як зсідання крові, гемостаз, гостра фаза запалення. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Секретований назовні.

Література

  • Degen S.J.F., Davie E.W. (1987). Nucleotide sequence of the gene for human prothrombin.. Biochemistry 26: 6165 — 6177. PubMed DOI:10.1021/bi00393a033
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
  • Degen S.J.F., McGillivray R.T.A., Davie E.W. (1983). Characterization of the complementary deoxyribonucleic acid and gene coding for human prothrombin.. Biochemistry 22: 2087 — 2097. PubMed DOI:10.1021/bi00278a008
  • Walz D.A., Hewett-Emmett D., Seegers W.H. (1977). Amino acid sequence of human prothrombin fragments 1 and 2.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 74: 1969 — 1972. PubMed DOI:10.1073/pnas.74.5.1969
  • Casas J.P., Hingorani A.D., Bautista L.E., Sharma P. (2004). Meta-analysis of genetic studies in ischemic stroke: thirty-two genes involving approximately 18,000 cases and 58,000 controls.. Arch. Neurol. 61: 1652 — 1661. PubMed DOI:10.1001/archneur.61.11.1652
  • Bunkenborg J., Pilch B.J., Podtelejnikov A.V., Wisniewski J.R. (2004). Screening for N-glycosylated proteins by liquid chromatography mass spectrometry.. Proteomics 4: 454 — 465. PubMed DOI:10.1002/pmic.200300556

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з Тромбін переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Сполуки, які фізично взаємодіють з Тромбін переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. Human PubMed Reference:.
  4. Mouse PubMed Reference:.
  5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3535 (англ.). Процитовано 5 жовтня 2018.
  6. Royle NJ, Irwin DM, Koschinsky ML, MacGillivray RT, Hamerton JL (May 1987). Human genes encoding prothrombin and ceruloplasmin map to 11p11-q12 and 3q21-24, respectively. Somat. Cell Mol. Genet. 13 (3): 285–92. PMID 3474786. doi:10.1007/BF01535211.
  7. UniProt, P00734 (англ.). Процитовано 5 жовтня 2018.
  8. 3.4.21.5(англ.)

Див. також

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.