ADARB1
ADARB1 (англ. Adenosine deaminase, RNA specific B1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 741 амінокислот, а молекулярна маса — 80 763[4].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MDIEDEENMS | SSSTDVKENR | NLDNVSPKDG | STPGPGEGSQ | LSNGGGGGPG | ||||
RKRPLEEGSN | GHSKYRLKKR | RKTPGPVLPK | NALMQLNEIK | PGLQYTLLSQ | ||||
TGPVHAPLFV | MSVEVNGQVF | EGSGPTKKKA | KLHAAEKALR | SFVQFPNASE | ||||
AHLAMGRTLS | VNTDFTSDQA | DFPDTLFNGF | ETPDKAEPPF | YVGSNGDDSF | ||||
SSSGDLSLSA | SPVPASLAQP | PLPVLPPFPP | PSGKNPVMIL | NELRPGLKYD | ||||
FLSESGESHA | KSFVMSVVVD | GQFFEGSGRN | KKLAKARAAQ | SALAAIFNLH | ||||
LDQTPSRQPI | PSEGLQLHLP | QVLADAVSRL | VLGKFGDLTD | NFSSPHARRK | ||||
VLAGVVMTTG | TDVKDAKVIS | VSTGTKCING | EYMSDRGLAL | NDCHAEIISR | ||||
RSLLRFLYTQ | LELYLNNKDD | QKRSIFQKSE | RGGFRLKENV | QFHLYISTSP | ||||
CGDARIFSPH | EPILEGSRSY | TQAGVQWCNH | GSLQPRPPGL | LSDPSTSTFQ | ||||
GAGTTEPADR | HPNRKARGQL | RTKIESGEGT | IPVRSNASIQ | TWDGVLQGER | ||||
LLTMSCSDKI | ARWNVVGIQG | SLLSIFVEPI | YFSSIILGSL | YHGDHLSRAM | ||||
YQRISNIEDL | PPLYTLNKPL | LSGISNAEAR | QPGKAPNFSV | NWTVGDSAIE | ||||
VINATTGKDE | LGRASRLCKH | ALYCRWMRVH | GKVPSHLLRS | KITKPNVYHE | ||||
SKLAAKEYQA | AKARLFTAFI | KAGLGAWVEK | PTEQDQFSLT | P |
Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, процесінг мРНК, антивірусний захист. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у ядрі.
У мозку миші в ході ембріонального розвитку активність білку зростає. Особливо висока його кількість у таламусі. Активність білка посилюють імпортин KPNA3, який транспортує його в ядро з цитоплазми, та ізомераза PIN1, що стабілізує фермент у ядрі[5].
Література
- Lai F., Chen C.-X., Carter K.C., Nishikura K. (1997). Editing of glutamate receptor B subunit ion channel RNAs by four alternatively spliced DRADA2 double-stranded RNA adenosine deaminases.. Mol. Cell. Biol. 17: 2413 — 2424. PubMed DOI:10.1128/MCB.17.5.2413
- Villard L., Tassone F., Haymowicz M., Welborn R., Gardiner K. (1997). Map location, genomic organization and expression patterns of the human RED1 RNA editase.. Somat. Cell Mol. Genet. 23: 135 — 145. PubMed DOI:10.1007/BF02679972
- Slavov D., Gardiner K. (2002). Phylogenetic comparison of the pre-mRNA adenosine deaminase ADAR2 genes and transcripts: conservation and diversity in editing site sequence and alternative splicing patterns.. Gene 299: 83 — 94. PubMed DOI:10.1016/S0378-1119(02)01016-8
- Kawahara Y., Ito K., Ito M., Tsuji S., Kwak S. (2005). Novel splice variants of human ADAR2 mRNA: skipping of the exon encoding the dsRNA-binding domains, and multiple C-terminal splice sites.. Gene 363: 193 — 201. PubMed DOI:10.1016/j.gene.2005.07.028
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
- Maas S., Gommans W.M. (2009). Novel exon of mammalian ADAR2 extends open reading frame.. PLoS ONE 4: E4225 — E4225. PubMed DOI:10.1371/journal.pone.0004225
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:226 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.
- UniProt, P78563 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.
- Lundin, Elin; Wu, Chenglin; Widmark, Albin; Behm, Mikaela; Hjerling-Leffler, Jens; Daniel, Chammiran; Öhman, Marie; Nilsson, Mats (2020). Spatiotemporal mapping of RNA editing in the developing mouse brain using in situ sequencing reveals regional and cell-type-specific regulation. BMC Biology 18 (1). ISSN 1741-7007. doi:10.1186/s12915-019-0736-3.(англ.)