AGO4

AGO4
Ідентифікатори
Символи	AGO4, EIF2C4, argonaute 4, RISC catalytic component, argonaute RISC catalytic component 4, argonaute RISC component 4
Зовнішні ІД	OMIM: 607356 MGI: 1924100 HomoloGene: 41184 GeneCards: AGO4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948 protein binding; • single-stranded RNA binding; • RNA binding; • nucleic acid binding; • double-stranded RNA binding; • miRNA binding;
Клітинна компонента	• мембрана; • P-body; • RISC-loading complex; • цитоплазма; • клітинне ядро; • Нуклеоплазма; • гіалоплазма; • RISC; • Ядерні тільця;
Біологічний процес	• mRNA destabilization-mediated gene silencing by siRNA; • miRNA loading onto RISC involved in gene silencing by miRNA; • mRNA catabolic process; • pre-miRNA processing; • post-transcriptional gene silencing by RNA; • RNA secondary structure unwinding; • mRNA destabilization-mediated gene silencing by miRNA; • regulation of translation; • production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA; • Wnt signaling pathway, calcium modulating pathway; • Сайленсинг генів; • regulation of cell morphogenesis; • synaptonemal complex assembly; • miRNA metabolic process; • negative regulation of apoptotic process; • male meiotic nuclear division; • male gonad development; • miRNA-mediated gene silencing by inhibition of translation; • regulation of megakaryocyte differentiation; • positive regulation of gene expression; • negative regulation of gene expression;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	192670
	76850
	ENSG00000134698
	ENSMUSG00000042500
	Q9HCK5
	Q8CJF8
	NM_017629
	NM_153177
	NP_060099
	NP_694817
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

AGO4 (англ. Argonaute 4, RISC catalytic component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 861 амінокислот, а молекулярна маса — 97 097[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEALGPGPPA	SLFQPPRRPG	LGTVGKPIRL	LANHFQVQIP	KIDVYHYDVD
IKPEKRPRRV	NREVVDTMVR	HFKMQIFGDR	QPGYDGKRNM	YTAHPLPIGR
DRVDMEVTLP	GEGKDQTFKV	SVQWVSVVSL	QLLLEALAGH	LNEVPDDSVQ
ALDVITRHLP	SMRYTPVGRS	FFSPPEGYYH	PLGGGREVWF	GFHQSVRPAM
WNMMLNIDVS	ATAFYRAQPI	IEFMCEVLDI	QNINEQTKPL	TDSQRVKFTK
EIRGLKVEVT	HCGQMKRKYR	VCNVTRRPAS	HQTFPLQLEN	GQAMECTVAQ
YFKQKYSLQL	KYPHLPCLQV	GQEQKHTYLP	LEVCNIVAGQ	RCIKKLTDNQ
TSTMIKATAR	SAPDRQEEIS	RLVKSNSMVG	GPDPYLKEFG	IVVHNEMTEL
TGRVLPAPML	QYGGRNKTVA	TPNQGVWDMR	GKQFYAGIEI	KVWAVACFAP
QKQCREDLLK	SFTDQLRKIS	KDAGMPIQGQ	PCFCKYAQGA	DSVEPMFKHL
KMTYVGLQLI	VVILPGKTPV	YAEVKRVGDT	LLGMATQCVQ	VKNVVKTSPQ
TLSNLCLKIN	AKLGGINNVL	VPHQRPSVFQ	QPVIFLGADV	THPPAGDGKK
PSIAAVVGSM	DGHPSRYCAT	VRVQTSRQEI	SQELLYSQEV	IQDLTNMVRE
LLIQFYKSTR	FKPTRIIYYR	GGVSEGQMKQ	VAWPELIAIR	KACISLEEDY
RPGITYIVVQ	KRHHTRLFCA	DKTERVGKSG	NVPAGTTVDS	TITHPSEFDF
YLCSHAGIQG	TSRPSHYQVL	WDDNCFTADE	LQLLTYQLCH	TYVRCTRSVS
IPAPAYYARL	VAFRARYHLV	DKDHDSAEGS	HVSGQSNGRD	PQALAKAVQI
HHDTQHTMYF	A

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, РНК-залежне заглушення генів. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro.. DNA Res. 7: 273 — 281. PubMed DOI:10.1093/dnares/7.4.271
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Pillai R.S., Artus C.G., Filipowicz W. (2004). Tethering of human Ago proteins to mRNA mimics the miRNA-mediated repression of protein synthesis.. RNA 10: 1518 — 1525. PubMed DOI:10.1261/rna.7131604
Wu L., Fan J., Belasco J.G. (2008). Importance of translation and nonnucleolytic ago proteins for on-target RNA interference.. Curr. Biol. 18: 1327 — 1332. PubMed DOI:10.1016/j.cub.2008.07.072

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18424 (англ.). Процитовано 18 вересня 2017.
UniProt, Q9HCK5 (англ.). Процитовано 18 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18424 (англ.). Процитовано 18 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9HCK5 (англ.). Процитовано 18 вересня 2017.