AIF1

AIF1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2D58, 2G2B
Ідентифікатори
Символи	AIF1, AIF-1, IBA1, IRT-1, IRT1, allograft inflammatory factor 1, Iba-1
Зовнішні ІД	OMIM: 601833 MGI: 1343098 HomoloGene: 1226 GeneCards: AIF1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • зв'язування з іоном металу; • actin filament binding; • actin binding; • молекулярна функція;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • Перикаріон; • cell projection; • мембрана; • ruffle; • клітинна мембрана; • ruffle membrane; • Мікрофіламенти; • perinuclear region of cytoplasm; • phagocytic cup; • Цитоскелет; • клітинне ядро; • lamellipodium;
Біологічний процес	• cellular response to extracellular stimulus; • positive regulation of smooth muscle cell chemotaxis; • response to cytokine; • positive regulation of protein phosphorylation; • negative regulation of smooth muscle cell proliferation; • positive regulation of cell migration; • positive regulation of muscle hyperplasia; • positive regulation of nitric oxide biosynthetic process; • positive regulation of monocyte chemotaxis; • negative regulation of apoptotic process; • response to glucocorticoid; • response to electrical stimulus; • negative regulation of gene expression; • cellular response to hydroperoxide; • actin filament bundle assembly; • microglial cell activation; • positive regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle; • actin filament polymerization; • negative regulation of smooth muscle cell chemotaxis; • cellular response to hormone stimulus; • phagocytosis, engulfment; • response to axon injury; • positive regulation of T cell proliferation; • cellular response to interferon-gamma; • cellular response to morphine; • Rac protein signal transduction; • inflammatory response; • ruffle assembly; • positive regulation of T cell migration; • positive regulation of smooth muscle cell proliferation; • cerebellum development; • positive regulation of cell population proliferation; • Регуляція експресії генів; • parallel actin filament bundle assembly; • cellular response to oxidative stress; • positive regulation of chemotaxis; • actin crosslink formation; • positive regulation of mononuclear cell migration; • positive regulation of fibroblast growth factor production;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	199
	11629
ENSG00000206428; ENSG00000235985; ENSG00000235588; ENSG00000234836; ENSG00000237727;
	ENSG00000204472
	ENSMUSG00000024397
	P55008; Q4V347
	O70200
	NM_001623; NM_004847; NM_032955; NM_001318970
	NM_019467; NM_001361501; NM_001361502
	NP_001305899; NP_001614; NP_116573; NP_001614.3
	NP_062340; NP_001348430; NP_001348431
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

AIF1 (англ. Allograft inflammatory factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 147 амінокислот, а молекулярна маса — 16 703[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSQTRDLQGG	KAFGLLKAQQ	EERLDEINKQ	FLDDPKYSSD	EDLPSKLEGF
KEKYMEFDLN	GNGDIDIMSL	KRMLEKLGVP	KTHLELKKLI	GEVSSGSGET
FSYPDFLRMM	LGKRSAILKM	ILMYEEKARE	KEKPTGPPAK	KAISELP

A: Аланін

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних відростках.

Література

Albertella M.R., Campbell D.R. (1994). Characterization of a novel gene in the human major histocompatibility complex that encodes a potential new member of the I kappa B family of proteins.. Hum. Mol. Genet. 3: 793 — 799. PubMed DOI:10.1093/hmg/3.5.793
Autieri M.V. (1996). cDNA cloning of human allograft inflammatory factor-1: tissue distribution, cytokine induction, and mRNA expression in injured rat carotid arteries.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 228: 29 — 37. PubMed DOI:10.1006/bbrc.1996.1612
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Chen X., Kelemen S.E., Autieri M.V. (2004). AIF-1 expression modulates proliferation of human vascular smooth muscle cells by autocrine expression of G-CSF.. Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol. 24: 1217 — 1222. PubMed DOI:10.1161/01.ATV.0000130024.50058.de
Kelemen S.E., Autieri M.V. (2005). Expression of allograft inflammatory factor-1 in T lymphocytes: a role in T-lymphocyte activation and proliferative arteriopathies.. Am. J. Pathol. 167: 619 — 626. PubMed DOI:10.1016/S0002-9440(10)63003-9
Yamada M., Ohsawa K., Imai Y., Kohsaka S., Kamitori S. (2006). X-ray structures of the microglia/macrophage-specific protein Iba1 from human and mouse demonstrate novel molecular conformation change induced by calcium binding.. J. Mol. Biol. 364: 449 — 457. PubMed DOI:10.1016/j.jmb.2006.09.027

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:352 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
UniProt, P55008 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:352 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P55008 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.