APCS

APCS
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4AYU, 1GYK, 1LGN, 1SAC, 2A3W, 2A3X, 2A3Y, 2W08, 3D5O, 3KQR, 4AVS, 4AVT, 4AVV
Ідентифікатори
Символи	APCS, HEL-S-92n, PTX2, SAP, amyloid P component, serum
Зовнішні ІД	OMIM: 104770 MGI: 98229 HomoloGene: 123932 GeneCards: APCS
Реагує на сполуку
	miridesap[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • unfolded protein binding; • зв'язування з іоном металу; • virion binding; • complement component C1q complex binding; • carbohydrate binding; • identical protein binding; • low-density lipoprotein particle binding;
Клітинна компонента	• blood microparticle; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • Екзосома; • клітинне ядро; • extracellular space; • extracellular region; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• cellular protein metabolic process; • negative regulation of monocyte differentiation; • negative regulation of acute inflammatory response; • negative regulation of viral entry into host cell; • chaperone-mediated protein complex assembly; • negative regulation of viral process; • negative regulation of glycoprotein metabolic process; • Згортання білків; • acute-phase response; • negative regulation of exo-alpha-sialidase activity; • negative regulation of wound healing; • Вроджений імунітет; • complement activation, classical pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	325
	20219
	ENSG00000132703
	ENSMUSG00000026542
	P02743
	P12246
	NM_001639
	NM_011318
	NP_001630
	NP_035448
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

APCS (англ. Amyloid P component, serum) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 223 амінокислот, а молекулярна маса — 25 387[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNKPLLWISV	LTSLLEAFAH	TDLSGKVFVF	PRESVTDHVN	LITPLEKPLQ
NFTLCFRAYS	DLSRAYSLFS	YNTQGRDNEL	LVYKERVGEY	SLYIGRHKVT
SKVIEKFPAP	VHICVSWESS	SGIAEFWING	TPLVKKGLRQ	GYFVEAQPKI
VLGQEQDSYG	GKFDRSQSFV	GEIGDLYMWD	SVLPPENILS	AYQGTPLPAN
ILDWQALNYE	IRGYVIIKPL	VWV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, лектинами. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Thompson A.R., Enfield D.L. (1978). Human plasma P component: isolation and characterization.. Biochemistry 17: 4304 — 4311. PubMed DOI:10.1021/bi00613a030
Kiernan U.A., Nedelkov D., Tubbs K.A., Niederkofler E.E., Nelson R.W. (2004). Proteomic characterization of novel serum amyloid P component variants from human plasma and urine.. Proteomics 4: 1825 — 1829. PubMed DOI:10.1002/pmic.200300690
Hohenester E., Hutchinson W.L., Pepys M.B., Wood S.P. (1997). Crystal structure of a decameric complex of human serum amyloid P component with bound dAMP.. J. Mol. Biol. 269: 570 — 578. PubMed DOI:10.1006/jmbi.1997.1075
Ohnishi S., Maeda S., Shimada K., Arao T. (1986). Isolation and characterization of the complete complementary and genomic DNA sequences of human serum amyloid P component.. J. Biochem. 100: 849 — 858. PubMed
Prelli F., Pras M., Frangione B. (1985). The primary structure of human tissue amyloid P component from a patient with primary idiopathic amyloidosis.. J. Biol. Chem. 260: 12895 — 12898. PubMed

Примітки

Сполуки, які фізично взаємодіють з Amyloid P component, serum переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:584 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.
UniProt, P02743 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Amyloid P component, serum переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:584 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.

[UniProt-5] UniProt, P02743 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.