APC (ген)

APC
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1DEB, 1EMU, 1JPP, 1M5I, 1T08, 1TH1, 1V18, 2RQU, 3AU3, 3NMW, 3NMX, 3NMZ, 3QHE, 3RL7, 3RL8, 3T7U, 4G69, 4YJL, 4YK6, 4YJE
Ідентифікатори
Символи	APC, BTPS2, DP2, DP2.5, DP3, GS, PPP1R46, adenomatous polyposis coli, WNT signaling pathway regulator, Genes
Зовнішні ІД	OMIM: 611731 MGI: 88039 HomoloGene: 30950 GeneCards: APC
Пов'язані генетичні захворювання
	APC-related attenuated familial adenomatous polyposis[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• gamma-catenin binding; • protein kinase binding; • microtubule plus-end binding; • microtubule binding; • cadherin binding; • protein kinase regulator activity; • GO:0001948 protein binding; • beta-catenin binding; • ubiquitin protein ligase binding; • identical protein binding; • dynein complex binding;
Клітинна компонента	• Цитоскелет; • Адгезивні контакти; • beta-catenin destruction complex; • Нуклеоплазма; • цитоплазма; • cell projection; • гіалоплазма; • catenin complex; • Міжклітинні контакти; • клітинне ядро; • lamellipodium; • мембрана; • Wnt signalosome; • центросома; • Кінетохор; • bicellular tight junction; • ruffle membrane; • клітинна мембрана; • lateral plasma membrane; • perinuclear region of cytoplasm; • Мікротрубочки; • cytoplasmic microtubule;
Біологічний процес	• negative regulation of cell population proliferation; • negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity; • mitotic spindle assembly checkpoint signaling; • positive regulation of cell migration; • positive regulation of protein catabolic process; • bicellular tight junction assembly; • regulation of microtubule-based process; • positive regulation of pseudopodium assembly; • regulation of attachment of spindle microtubules to kinetochore; • cellular response to DNA damage stimulus; • negative regulation of Wnt signaling pathway; • Адгезія клітин; • mitotic cytokinesis; • negative regulation of microtubule depolymerization; • positive regulation of apoptotic process; • canonical Wnt signaling pathway; • cell migration; • beta-catenin destruction complex assembly; • beta-catenin destruction complex disassembly; • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway; • Wnt signaling pathway; • protein deubiquitination; • insulin receptor signaling pathway; • positive regulation of cell death; • protein homooligomerization; • positive regulation of protein localization to centrosome; • protein-containing complex assembly; • cell fate specification; • pattern specification process; • regulation of cell differentiation; • positive regulation of cold-induced thermogenesis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	324
	11789
	ENSG00000134982
	ENSMUSG00000005871
	P25054
	Q61315
	NM_001127511; NM_000038; NM_001127510
	NM_007462; NM_001360979; NM_001360980
NP_000029; NP_001120982; NP_001120983; NP_001341824; NP_001341825;
	NP_001341826; NP_001341827; NP_001341828; NP_001341829; NP_001341830; NP_001341831; NP_001341832; NP_001341833; NP_001341834; NP_001341835
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

APC (англ. APC, WNT signaling pathway regulator) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 843 амінокислот, а молекулярна маса — 311 646[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAASYDQLL	KQVEALKMEN	SNLRQELEDN	SNHLTKLETE	ASNMKEVLKQ
LQGSIEDEAM	ASSGQIDLLE	RLKELNLDSS	NFPGVKLRSK	MSLRSYGSRE
GSVSSRSGEC	SPVPMGSFPR	RGFVNGSRES	TGYLEELEKE	RSLLLADLDK
EEKEKDWYYA	QLQNLTKRID	SLPLTENFSL	QTDMTRRQLE	YEARQIRVAM
EEQLGTCQDM	EKRAQRRIAR	IQQIEKDILR	IRQLLQSQAT	EAERSSQNKH
ETGSHDAERQ	NEGQGVGEIN	MATSGNGQGS	TTRMDHETAS	VLSSSSTHSA
PRRLTSHLGT	KVEMVYSLLS	MLGTHDKDDM	SRTLLAMSSS	QDSCISMRQS
GCLPLLIQLL	HGNDKDSVLL	GNSRGSKEAR	ARASAALHNI	IHSQPDDKRG
RREIRVLHLL	EQIRAYCETC	WEWQEAHEPG	MDQDKNPMPA	PVEHQICPAV
CVLMKLSFDE	EHRHAMNELG	GLQAIAELLQ	VDCEMYGLTN	DHYSITLRRY
AGMALTNLTF	GDVANKATLC	SMKGCMRALV	AQLKSESEDL	QQVIASVLRN
LSWRADVNSK	KTLREVGSVK	ALMECALEVK	KESTLKSVLS	ALWNLSAHCT
ENKADICAVD	GALAFLVGTL	TYRSQTNTLA	IIESGGGILR	NVSSLIATNE
DHRQILRENN	CLQTLLQHLK	SHSLTIVSNA	CGTLWNLSAR	NPKDQEALWD
MGAVSMLKNL	IHSKHKMIAM	GSAAALRNLM	ANRPAKYKDA	NIMSPGSSLP
SLHVRKQKAL	EAELDAQHLS	ETFDNIDNLS	PKASHRSKQR	HKQSLYGDYV
FDTNRHDDNR	SDNFNTGNMT	VLSPYLNTTV	LPSSSSSRGS	LDSSRSEKDR
SLERERGIGL	GNYHPATENP	GTSSKRGLQI	STTAAQIAKV	MEEVSAIHTS
QEDRSSGSTT	ELHCVTDERN	ALRRSSAAHT	HSNTYNFTKS	ENSNRTCSMP
YAKLEYKRSS	NDSLNSVSSS	DGYGKRGQMK	PSIESYSEDD	ESKFCSYGQY
PADLAHKIHS	ANHMDDNDGE	LDTPINYSLK	YSDEQLNSGR	QSPSQNERWA
RPKHIIEDEI	KQSEQRQSRN	QSTTYPVYTE	STDDKHLKFQ	PHFGQQECVS
PYRSRGANGS	ETNRVGSNHG	INQNVSQSLC	QEDDYEDDKP	TNYSERYSEE
EQHEEEERPT	NYSIKYNEEK	RHVDQPIDYS	LKYATDIPSS	QKQSFSFSKS
SSGQSSKTEH	MSSSSENTST	PSSNAKRQNQ	LHPSSAQSRS	GQPQKAATCK
VSSINQETIQ	TYCVEDTPIC	FSRCSSLSSL	SSAEDEIGCN	QTTQEADSAN
TLQIAEIKEK	IGTRSAEDPV	SEVPAVSQHP	RTKSSRLQGS	SLSSESARHK
AVEFSSGAKS	PSKSGAQTPK	SPPEHYVQET	PLMFSRCTSV	SSLDSFESRS
IASSVQSEPC	SGMVSGIISP	SDLPDSPGQT	MPPSRSKTPP	PPPQTAQTKR
EVPKNKAPTA	EKRESGPKQA	AVNAAVQRVQ	VLPDADTLLH	FATESTPDGF
SCSSSLSALS	LDEPFIQKDV	ELRIMPPVQE	NDNGNETESE	QPKESNENQE
KEAEKTIDSE	KDLLDDSDDD	DIEILEECII	SAMPTKSSRK	AKKPAQTASK
LPPPVARKPS	QLPVYKLLPS	QNRLQPQKHV	SFTPGDDMPR	VYCVEGTPIN
FSTATSLSDL	TIESPPNELA	AGEGVRGGAQ	SGEFEKRDTI	PTEGRSTDEA
QGGKTSSVTI	PELDDNKAEE	GDILAECINS	AMPKGKSHKP	FRVKKIMDQV
QQASASSSAP	NKNQLDGKKK	KPTSPVKPIP	QNTEYRTRVR	KNADSKNNLN
AERVFSDNKD	SKKQNLKNNS	KVFNDKLPNN	EDRVRGSFAF	DSPHHYTPIE
GTPYCFSRND	SLSSLDFDDD	DVDLSREKAE	LRKAKENKES	EAKVTSHTEL
TSNQQSANKT	QAIAKQPINR	GQPKPILQKQ	STFPQSSKDI	PDRGAATDEK
LQNFAIENTP	VCFSHNSSLS	SLSDIDQENN	NKENEPIKET	EPPDSQGEPS
KPQASGYAPK	SFHVEDTPVC	FSRNSSLSSL	SIDSEDDLLQ	ECISSAMPKK
KKPSRLKGDN	EKHSPRNMGG	ILGEDLTLDL	KDIQRPDSEH	GLSPDSENFD
WKAIQEGANS	IVSSLHQAAA	AACLSRQASS	DSDSILSLKS	GISLGSPFHL
TPDQEEKPFT	SNKGPRILKP	GEKSTLETKK	IESESKGIKG	GKKVYKSLIT
GKVRSNSEIS	GQMKQPLQAN	MPSISRGRTM	IHIPGVRNSS	SSTSPVSKKG
PPLKTPASKS	PSEGQTATTS	PRGAKPSVKS	ELSPVARQTS	QIGGSSKAPS
RSGSRDSTPS	RPAQQPLSRP	IQSPGRNSIS	PGRNGISPPN	KLSQLPRTSS
PSTASTKSSG	SGKMSYTSPG	RQMSQQNLTK	QTGLSKNASS	IPRSESASKG
LNQMNNGNGA	NKKVELSRMS	STKSSGSESD	RSERPVLVRQ	STFIKEAPSP
TLRRKLEESA	SFESLSPSSR	PASPTRSQAQ	TPVLSPSLPD	MSLSTHSSVQ
AGGWRKLPPN	LSPTIEYNDG	RPAKRHDIAR	SHSESPSRLP	INRSGTWKRE
HSKHSSSLPR	VSTWRRTGSS	SSILSASSES	SEKAKSEDEK	HVNSISGTKQ
SKENQVSAKG	TWRKIKENEF	SPTNSTSQTV	SSGATNGAES	KTLIYQMAPA
VSKTEDVWVR	IEDCPINNPR	SGRSPTGNTP	PVIDSVSEKA	NPNIKDSKDN
QAKQNVGNGS	VPMRTVGLEN	RLNSFIQVDA	PDQKGTEIKP	GQNNPVPVSE
TNESSIVERT	PFSSSSSSKH	SSPSGTVAAR	VTPFNYNPSP	RKSSADSTSA
RPSQIPTPVN	NNTKKRDSKT	DSTESSGTQS	PKRHSGSYLV	TSV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як сигнальний шлях Wnt, поліморфізм, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

Su L.-K., Vogelstein B., Kinzler K.W. (1993). Association of the APC tumor suppressor protein with catenins.. Science 262: 1734 — 1737. PubMed DOI:10.1126/science.8259519
Bu W., Su L.-K. (2003). Characterization of functional domains of human EB1 family proteins.. J. Biol. Chem. 278: 49721 — 49731. PubMed DOI:10.1074/jbc.M306194200
Choi J., Park S.Y., Costantini F., Jho E.-H., Joo C.-K. (2004). Adenomatous polyposis coli is down-regulated by the ubiquitin-proteasome pathway in a process facilitated by Axin.. J. Biol. Chem. 279: 49188 — 49198. PubMed DOI:10.1074/jbc.M404655200
Tran H., Hamada F., Schwarz-Romond T., Bienz M. (2008). Trabid, a new positive regulator of Wnt-induced transcription with preference for binding and cleaving K63-linked ubiquitin chains.. Genes Dev. 22: 528 — 542. PubMed DOI:10.1101/gad.463208
Zaoui K., Benseddik K., Daou P., Salaun D., Badache A. (2010). ErbB2 receptor controls microtubule capture by recruiting ACF7 to the plasma membrane of migrating cells.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107: 18517 — 18522. PubMed DOI:10.1073/pnas.1000975107
Pfister A.S., Tanneberger K., Schambony A., Behrens J. (2012). Amer2 protein is a novel negative regulator of Wnt/beta-Catenin signaling involved in neuroectodermal patterning.. J. Biol. Chem. 287: 1734 — 1741. PubMed DOI:10.1074/jbc.M111.308650

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з APC переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:583 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.
UniProt, P25054 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 5

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з APC переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:583 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P25054 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.