APOBEC1

APOBEC1
Ідентифікатори
Символи	APOBEC1, APOBEC-1, BEDP, CDAR1, HEPR, apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600130 MGI: 103298 HomoloGene: 1243 GeneCards: APOBEC1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0010577 enzyme activator activity; • hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in cyclic amidines; • GO:0001948 protein binding; • mRNA binding; • cytidine deaminase activity; • RNA binding; • каталітична активність; • zinc ion binding; • hydrolase activity; • cytosine deaminase activity; • зв'язування з іоном металу; • protein domain specific binding; • ribonucleoprotein complex binding; • mRNA 3'-UTR AU-rich region binding;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • Нуклеоплазма; • цитоплазма;
Біологічний процес	• DNA cytosine deamination; • cellular response to insulin stimulus; • response to osmotic stress; • mRNA processing; • RNA processing; • response to calcium ion; • response to ethanol; • regulation of cell population proliferation; • response to zinc ion; • defense response to virus; • cytidine to uridine editing; • response to gamma radiation; • mRNA stabilization; • DNA demethylation; • lipoprotein metabolic process; • lipoprotein transport; • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity; • lipoprotein biosynthetic process; • lipid metabolism; • negative regulation of DNA methylation-dependent heterochromatin assembly; • positive regulation of mRNA modification; • cytidine deamination; • mRNA modification; • triglyceride metabolic process; • negative regulation of triglyceride metabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	339
	11810
	ENSG00000111701
	ENSMUSG00000040613
	P41238
	P51908
	NM_005889; NM_001304566; NM_001644
	NM_001134391; NM_031159
	NP_001291495; NP_001635; NP_005880
	NP_001127863; NP_112436
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

APOBEC1 (англ. Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 236 амінокислот, а молекулярна маса — 28 192[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTSEKGPSTG	DPTLRRRIEP	WEFDVFYDPR	ELRKEACLLY	EIKWGMSRKI
WRSSGKNTTN	HVEVNFIKKF	TSERDFHPSM	SCSITWFLSW	SPCWECSQAI
REFLSRHPGV	TLVIYVARLF	WHMDQQNRQG	LRDLVNSGVT	IQIMRASEYY
HCWRNFVNYP	PGDEAHWPQY	PPLWMMLYAL	ELHCIILSLP	PCLKISRRWQ
NHLTFFRLHL	QNCHYQTIPP	HILLATGLIH	PSVAWR

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у такому біологічному процесі як процесінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Hadjiagapiou C., Giannoni F., Funahashi T., Skarosi S.F., Davidson N.O. (1994). Molecular cloning of a human small intestinal apolipoprotein B mRNA editing protein.. Nucleic Acids Res. 22: 1874 — 1879. PubMed DOI:10.1093/nar/22.10.1874
Lau P.P., Zhu H.-J., Baldini A., Charnsangavej C., Chan L. (1994). Dimeric structure of a human apolipoprotein B mRNA editing protein and cloning and chromosomal localization of its gene.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 8522 — 8526. PubMed DOI:10.1073/pnas.91.18.8522
Fujino T., Navaratnam N., Scott J. (1998). Human apolipoprotein B RNA editing deaminase gene (APOBEC1).. Genomics 47: 266 — 275. PubMed DOI:10.1006/geno.1997.5110
Lau P.P., Zhu H.J., Nakamuta M., Chan L. (1997). Cloning of an Apobec-1-binding protein that also interacts with apolipoprotein B mRNA and evidence for its involvement in RNA editing.. J. Biol. Chem. 272: 1452 — 1455. PubMed DOI:10.1074/jbc.272.3.1452
Lau P.P., Chang B.-H., Chan L. (2001). Two-hybrid cloning identifies an RNA-binding protein, GRY-RBP, as a component of apobec-1 editosome.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 282: 977 — 983. PubMed DOI:10.1006/bbrc.2001.4679
Hirano K., Min J., Funahashi T., Baunoch D.A., Davidson N.O. (1997). Characterization of the human apobec-1 gene: expression in gastrointestinal tissues determined by alternative splicing with production of a novel truncated peptide.. J. Lipid Res. 38: 847 — 859. PubMed

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:604 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.
UniProt, P41238 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 12

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:604 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P41238 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.