APOBEC3D
APOBEC3D (англ. Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. [2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 386 амінокислот, а молекулярна маса — 46 598[3].
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MNPQIRNPME | RMYRDTFYDN | FENEPILYGR | SYTWLCYEVK | IKRGRSNLLW | ||||
| DTGVFRGPVL | PKRQSNHRQE | VYFRFENHAE | MCFLSWFCGN | RLPANRRFQI | ||||
| TWFVSWNPCL | PCVVKVTKFL | AEHPNVTLTI | SAARLYYYRD | RDWRWVLLRL | ||||
| HKAGARVKIM | DYEDFAYCWE | NFVCNEGQPF | MPWYKFDDNY | ASLHRTLKEI | ||||
| LRNPMEAMYP | HIFYFHFKNL | LKACGRNESW | LCFTMEVTKH | HSAVFRKRGV | ||||
| FRNQVDPETH | CHAERCFLSW | FCDDILSPNT | NYEVTWYTSW | SPCPECAGEV | ||||
| AEFLARHSNV | NLTIFTARLC | YFWDTDYQEG | LCSLSQEGAS | VKIMGYKDFV | ||||
| SCWKNFVYSD | DEPFKPWKGL | QTNFRLLKRR | LREILQ |
Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, антивірусний захист. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- Wedekind J.E., Dance G.S.C., Sowden M.P., Smith H.C. (2003). Messenger RNA editing in mammals: new members of the APOBEC family seeking roles in the family business.. Trends Genet. 19: 207 — 216. PubMed DOI:10.1016/S0168-9525(03)00054-4
- Chiu Y.L., Greene W.C. (2008). The APOBEC3 cytidine deaminases: an innate defensive network opposing exogenous retroviruses and endogenous retroelements.. Annu. Rev. Immunol. 26: 317 — 353. PubMed DOI:10.1146/annurev.immunol.26.021607.090350
- Stenglein M.D., Burns M.B., Li M., Lengyel J., Harris R.S. (2010). APOBEC3 proteins mediate the clearance of foreign DNA from human cells.. Nat. Struct. Mol. Biol. 17: 222 — 229. PubMed DOI:10.1038/nsmb.1744
- Arias J.F., Koyama T., Kinomoto M., Tokunaga K. (2012). Retroelements versus APOBEC3 family members: No great escape from the magnificent seven.. Front. Microbiol. 3: 275 — 275. PubMed DOI:10.3389/fmicb.2012.00275
- Phalora P.K., Sherer N.M., Wolinsky S.M., Swanson C.M., Malim M.H. (2012). HIV-1 replication and APOBEC3 antiviral activity are not regulated by P bodies.. J. Virol. 86: 11712 — 11724. PubMed DOI:10.1128/JVI.00595-12
- Refsland E.W., Hultquist J.F., Harris R.S. (2012). Endogenous origins of HIV-1 G-to-A hypermutation and restriction in the nonpermissive T cell line CEM2n.. PLoS Pathog. 8: E1002800 — E1002800. PubMed DOI:10.1371/journal.ppat.1002800
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17354 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.
- UniProt, Q96AK3 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.