APOBEC3F
APOBEC3F (англ. Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3F) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. [2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 373 амінокислот, а молекулярна маса — 45 020[3].
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MKPHFRNTVE | RMYRDTFSYN | FYNRPILSRR | NTVWLCYEVK | TKGPSRPRLD | ||||
| AKIFRGQVYS | QPEHHAEMCF | LSWFCGNQLP | AYKCFQITWF | VSWTPCPDCV | ||||
| AKLAEFLAEH | PNVTLTISAA | RLYYYWERDY | RRALCRLSQA | GARVKIMDDE | ||||
| EFAYCWENFV | YSEGQPFMPW | YKFDDNYAFL | HRTLKEILRN | PMEAMYPHIF | ||||
| YFHFKNLRKA | YGRNESWLCF | TMEVVKHHSP | VSWKRGVFRN | QVDPETHCHA | ||||
| ERCFLSWFCD | DILSPNTNYE | VTWYTSWSPC | PECAGEVAEF | LARHSNVNLT | ||||
| IFTARLYYFW | DTDYQEGLRS | LSQEGASVEI | MGYKDFKYCW | ENFVYNDDEP | ||||
| FKPWKGLKYN | FLFLDSKLQE | ILE |
Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, антивірусний захист. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
- Wedekind J.E., Dance G.S.C., Sowden M.P., Smith H.C. (2003). Messenger RNA editing in mammals: new members of the APOBEC family seeking roles in the family business.. Trends Genet. 19: 207 — 216. PubMed DOI:10.1016/S0168-9525(03)00054-4
- Wiegand H.L., Doehle B.P., Bogerd H.P., Cullen B.R. (2004). A second human antiretroviral factor, APOBEC3F, is suppressed by the HIV-1 and HIV-2 Vif proteins.. EMBO J. 23: 2451 — 2458. PubMed DOI:10.1038/sj.emboj.7600246
- Hakata Y., Landau N.R. (2006). Reversed functional organization of mouse and human APOBEC3 cytidine deaminase domains.. J. Biol. Chem. 281: 36624 — 36631. PubMed DOI:10.1074/jbc.M604980200
- Wichroski M.J., Robb G.B., Rana T.M. (2006). Human retroviral host restriction factors APOBEC3G and APOBEC3F localize to mRNA processing bodies.. PLoS Pathog. 2: E41 — E41. PubMed DOI:10.1371/journal.ppat.0020041
- Chiu Y.L., Greene W.C. (2008). The APOBEC3 cytidine deaminases: an innate defensive network opposing exogenous retroviruses and endogenous retroelements.. Annu. Rev. Immunol. 26: 317 — 353. PubMed DOI:10.1146/annurev.immunol.26.021607.090350
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17356 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.
- UniProt, Q8IUX4 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.