ARNT

ARNT
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4PKY, 1X0O, 2A24, 2B02, 2HV1, 2K7S, 3F1N, 3F1O, 3F1P, 3H7W, 3H82, 4EQ1, 4GHI, 4GS9, 4H6J, 4LPZ, 4XT2
Ідентифікатори
Символи	ARNT, HIF-1-beta, HIF-1beta, HIF1-beta, HIF1B, HIF1BETA, TANGO, bHLHe2, aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator
Зовнішні ІД	OMIM: 126110 MGI: 88071 HomoloGene: 1261 GeneCards: ARNT
Онтологія гена
Молекулярна функція	• sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • protein dimerization activity; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • aryl hydrocarbon receptor binding; • transcription factor binding; • GO:0001948 protein binding; • protein heterodimerization activity; • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • protein homodimerization activity; • sequence-specific double-stranded DNA binding; • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • transcription regulator complex; • Нуклеоплазма; • RNA polymerase II transcription regulator complex; • клітинне ядро; • Ядерні тільця;
Біологічний процес	• positive regulation of vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway; • Диференціація клітин; • response to hypoxia; • regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of endothelial cell proliferation; • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to oxidative stress; • positive regulation of erythrocyte differentiation; • embryonic placenta development; • mRNA transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of protein sumoylation; • transcription, DNA-templated; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • intracellular receptor signaling pathway; • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia; • positive regulation of vascular endothelial growth factor production; • positive regulation of glycolytic process; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of hormone biosynthetic process; • xenobiotic metabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	405
	11863
	ENSG00000143437
	ENSMUSG00000015522
	P27540
	P53762
NM_001197325; NM_001286035; NM_001286036; NM_001668; NM_178426;
	NM_178427; NM_001350224; NM_001350225; NM_001350226
	NM_001037737; NM_009709
NP_001184254; NP_001272964; NP_001272965; NP_001659; NP_848514;
	NP_001337153; NP_001337154; NP_001337155
	NP_001032826; NP_033839
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ARNT (англ. Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 789 амінокислот, а молекулярна маса — 86 636[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAATTANPEM	TSDVPSLGPA	IASGNSGPGI	QGGGAIVQRA	IKRRPGLDFD
DDGEGNSKFL	RCDDDQMSND	KERFARSDDE	QSSADKERLA	RENHSEIERR
RRNKMTAYIT	ELSDMVPTCS	ALARKPDKLT	ILRMAVSHMK	SLRGTGNTST
DGSYKPSFLT	DQELKHLILE	AADGFLFIVS	CETGRVVYVS	DSVTPVLNQP
QSEWFGSTLY	DQVHPDDVDK	LREQLSTSEN	ALTGRILDLK	TGTVKKEGQQ
SSMRMCMGSR	RSFICRMRCG	SSSVDPVSVN	RLSFVRNRCR	NGLGSVKDGE
PHFVVVHCTG	YIKAWPPAGV	SLPDDDPEAG	QGSKFCLVAI	GRLQVTSSPN
CTDMSNVCQP	TEFISRHNIE	GIFTFVDHRC	VATVGYQPQE	LLGKNIVEFC
HPEDQQLLRD	SFQQVVKLKG	QVLSVMFRFR	SKNQEWLWMR	TSSFTFQNPY
SDEIEYIICT	NTNVKNSSQE	PRPTLSNTIQ	RPQLGPTANL	PLEMGSGQLA
PRQQQQQTEL	DMVPGRDGLA	SYNHSQVVQP	VTTTGPEHSK	PLEKSDGLFA
QDRDPRFSEI	YHNINADQSK	GISSSTVPAT	QQLFSQGNTF	PPTPRPAENF
RNSGLAPPVT	IVQPSASAGQ	MLAQISRHSN	PTQGATPTWT	PTTRSGFSAQ
QVATQATAKT	RTSQFGVGSF	QTPSSFSSMS	LPGAPTASPG	AAAYPSLTNR
GSNFAPETGQ	TAGQFQTRTA	EGVGVWPQWQ	GQQPHHRSSS	SEQHVQQPPA
QQPGQPEVFQ	EMLSMLGDQS	NSYNNEEFPD	LTMFPPFSE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Wang G.L., Jiang B.-H., Rue E.A., Semenza G.L. (1995). Hypoxia-inducible factor 1 is a basic-helix-loop-helix-PAS heterodimer regulated by cellular O2 tension.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 5510 — 5514. PubMed DOI:10.1073/pnas.92.12.5510
Reyes H., Reisz-Porszasz S., Hankinson O. (1992). Identification of the Ah receptor nuclear translocator protein (Arnt) as a component of the DNA binding form of the Ah receptor.. Science 256: 1193 — 1195. PubMed DOI:10.1126/science.256.5060.1193
Bacsi S.G., Hankinson O. (1996). Functional characterization of DNA-binding domains of the subunits of the heterodimeric aryl hydrocarbon receptor complex imputing novel and canonical basic helix-loop-helix protein-DNA interactions.. J. Biol. Chem. 271: 8843 — 8850. PubMed DOI:10.1074/jbc.271.15.8843
Nguyen T.A., Hoivik D., Lee J.-E., Safe S. (1999). Interactions of nuclear receptor coactivator/corepressor proteins with the aryl hydrocarbon receptor complex.. Arch. Biochem. Biophys. 367: 250 — 257. PubMed DOI:10.1006/abbi.1999.1282

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:700 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.
UniProt, P27540 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:700 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P27540 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.