ASF1A

ASF1A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1TEY, 2I32, 2IIJ, 2IO5, 3AAD, 5C3I
Ідентифікатори
Символи	ASF1A, CGI-98, CIA, HSPC146, anti-silencing function 1A histone chaperone
Зовнішні ІД	OMIM: 609189 MGI: 1913653 HomoloGene: 8528 GeneCards: ASF1A
Онтологія гена
Молекулярна функція	• histone binding; • chromatin binding; • GO:0001948 protein binding;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • Нуклеоплазма; • protein-containing complex;
Біологічний процес	• DNA replication-dependent chromatin assembly; • muscle cell differentiation; • nucleosome assembly; • DNA replication-independent chromatin assembly; • regulation of transcription, DNA-templated; • chromatin assembly or disassembly; • Репарація ДНК; • osteoblast differentiation; • transcription, DNA-templated; • chromatin organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	25842
	66403
	ENSG00000111875
	ENSMUSG00000019857
	Q9Y294
	Q9CQE6
	NM_014034
	NM_025541
	NP_054753
	NP_079817
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ASF1A (англ. Anti-silencing function 1A histone chaperone) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 204 амінокислот, а молекулярна маса — 22 969[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAKVQVNNVV	VLDNPSPFYN	PFQFEITFEC	IEDLSEDLEW	KIIYVGSAES
EEYDQVLDSV	LVGPVPAGRH	MFVFQADAPN	PGLIPDADAV	GVTVVLITCT
YRGQEFIRVG	YYVNNEYTET	ELRENPPVKP	DFSKLQRNIL	ASNPRVTRFH
INWEDNTEKL	EDAESSNPNL	QSLLSTDALP	SASKGWSTSE	NSLNVMLESH
MDCM

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до шаперонів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Локалізований у ядрі.

Література

Munakata T., Adachi N., Yokoyama N., Kuzuhara T., Horikoshi M. (2000). A human homologue of yeast anti-silencing factor has histone chaperone activity.. Genes Cells 5: 221 — 233. PubMed DOI:10.1046/j.1365-2443.2000.00319.x
Sillje H.H.W., Nigg E.A. (2001). Identification of human Asf1 chromatin assembly factors as substrates of Tousled-like kinases.. Curr. Biol. 11: 1068 — 1073. PubMed DOI:10.1016/S0960-9822(01)00298-6
Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics.. Genome Res. 10: 703 — 713. PubMed DOI:10.1101/gr.10.5.703
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Chimura T., Kuzuhara T., Horikoshi M. (2002). Identification and characterization of CIA/ASF1 as an interactor of bromodomains associated with TFIID.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 9334 — 9339. PubMed DOI:10.1073/pnas.142627899
Umehara T., Horikoshi M. (2003). Transcription initiation factor IID-interactive histone chaperone CIA-II implicated in mammalian spermatogenesis.. J. Biol. Chem. 278: 35660 — 35667. PubMed DOI:10.1074/jbc.M303549200

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20995 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
UniProt, Q9Y294 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20995 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9Y294 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.