BCL6

BCL6
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1R28, 1R29, 1R2B, 2EN2, 2EOS, 2LCE, 2YRM, 3BIM, 3E4U, 3LBZ, 4CP3, 4U2M
Ідентифікатори
Символи	BCL6, BCL5, BCL6A, LAZ3, ZBTB27, ZNF51, B-cell CLL/lymphoma 6, B cell CLL/lymphoma 6, transcription repressor, BCL6 transcription repressor
Зовнішні ІД	OMIM: 109565 MGI: 107187 HomoloGene: 7640 GeneCards: BCL6
Онтологія гена
Молекулярна функція	• sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • intronic transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • chromatin binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948 protein binding; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • nucleic acid binding; • chromatin DNA binding; • identical protein binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• replication fork; • клітинне ядро; • Нуклеоплазма; • комплекс Ґольджі;
Біологічний процес	• regulation of germinal center formation; • positive regulation of histone deacetylation; • negative regulation of T-helper 2 cell differentiation; • protein localization; • negative regulation of mast cell cytokine production; • regulation of transcription, DNA-templated; • immune system process; • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity; • regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of cell differentiation; • germinal center formation; • negative regulation of Rho protein signal transduction; • negative regulation of isotype switching to IgE isotypes; • negative regulation of apoptotic process; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • type 2 immune response; • cellular response to DNA damage stimulus; • negative regulation of cell-matrix adhesion; • regulation of cell population proliferation; • positive regulation of B cell proliferation; • negative regulation of cell growth; • Rho protein signal transduction; • cell morphogenesis; • Сперматогенез; • regulation of memory T cell differentiation; • positive regulation of neuron differentiation; • regulation of inflammatory response; • regulation of immune response; • positive regulation of apoptotic process; • negative regulation of type 2 immune response; • negative regulation of B cell apoptotic process; • positive regulation of cellular component movement; • B cell differentiation; • inflammatory response; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • actin cytoskeleton organization; • negative regulation of cell population proliferation; • negative regulation of Notch signaling pathway; • erythrocyte development; • negative regulation of cellular senescence; • regulation of apoptotic process; • negative regulation of mitotic cell cycle DNA replication; • positive regulation of regulatory T cell differentiation; • cytokine-mediated signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	604
	12053
	ENSG00000113916
	ENSMUSG00000022508
	P41182
	P41183
	NM_001130845; NM_001134738; NM_001706; NM_138931
	NM_009744; NM_001348026
	NP_001124317; NP_001128210; NP_001697
	NP_001334955; NP_033874
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

BCL6 (англ. B-cell CLL/lymphoma 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 706 амінокислот, а молекулярна маса — 78 846[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASPADSCIQ	FTRHASDVLL	NLNRLRSRDI	LTDVVIVVSR	EQFRAHKTVL
MACSGLFYSI	FTDQLKCNLS	VINLDPEINP	EGFCILLDFM	YTSRLNLREG
NIMAVMATAM	YLQMEHVVDT	CRKFIKASEA	EMVSAIKPPR	EEFLNSRMLM
PQDIMAYRGR	EVVENNLPLR	SAPGCESRAF	APSLYSGLST	PPASYSMYSH
LPVSSLLFSD	EEFRDVRMPV	ANPFPKERAL	PCDSARPVPG	EYSRPTLEVS
PNVCHSNIYS	PKETIPEEAR	SDMHYSVAEG	LKPAAPSARN	APYFPCDKAS
KEEERPSSED	EIALHFEPPN	APLNRKGLVS	PQSPQKSDCQ	PNSPTESCSS
KNACILQASG	SPPAKSPTDP	KACNWKKYKF	IVLNSLNQNA	KPEGPEQAEL
GRLSPRAYTA	PPACQPPMEP	ENLDLQSPTK	LSASGEDSTI	PQASRLNNIV
NRSMTGSPRS	SSESHSPLYM	HPPKCTSCGS	QSPQHAEMCL	HTAGPTFPEE
MGETQSEYSD	SSCENGAFFC	NECDCRFSEE	ASLKRHTLQT	HSDKPYKCDR
CQASFRYKGN	LASHKTVHTG	EKPYRCNICG	AQFNRPANLK	THTRIHSGEK
PYKCETCGAR	FVQVAHLRAH	VLIHTGEKPY	PCEICGTRFR	HLQTLKSHLR
IHTGEKPYHC	EKCNLHFRHK	SQLRLHLRQK	HGAITNTKVQ	YRVSATDLPP
ELPKAC

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, запальна відповідь, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Niu H., Ye B.H., Dalla-Favera R. (1998). Antigen receptor signaling induces MAP kinase-mediated phosphorylation and degradation of the BCL-6 transcription factor.. Genes Dev. 12: 1953 — 1961. PubMed DOI:10.1101/gad.12.13.1953
Bereshchenko O.R., Gu W., Dalla-Favera R. (2002). Acetylation inactivates the transcriptional repressor BCL6.. Nat. Genet. 32: 606 — 613. PubMed DOI:10.1038/ng1018
Mascle X., Albagli O., Lemercier C. (2003). Point mutations in BCL6 DNA-binding domain reveal distinct roles for the six zinc fingers.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 300: 391 — 396. PubMed DOI:10.1016/S0006-291X(02)02873-5
Phan R.T., Dalla-Favera R. (2004). The BCL6 proto-oncogene suppresses p53 expression in germinal-centre B-cells.. Nature 432: 635 — 639. PubMed DOI:10.1038/nature03147
Phan R.T., Saito M., Basso K., Niu H., Dalla-Favera R. (2005). BCL6 interacts with the transcription factor Miz-1 to suppress the cyclin-dependent kinase inhibitor p21 and cell cycle arrest in germinal center B cells.. Nat. Immunol. 6: 1054 — 1060. PubMed DOI:10.1038/ni1245

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1001 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
UniProt, P41182 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1001 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P41182 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.