BHLHE40

BHLHE40
Ідентифікатори
Символи	BHLHE40, BHLHB2, DEC1, HLHB2, SHARP-2, STRA13, Stra14, basic helix-loop-helix family member e40, Clast5, SHARP2
Зовнішні ІД	OMIM: 604256 MGI: 1097714 HomoloGene: 2722 GeneCards: BHLHE40
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • protein dimerization activity; • protein homodimerization activity; • MRF binding; • GO:0001106 transcription corepressor activity; • protein domain specific binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • bHLH transcription factor binding; • E-box binding; • GO:0001948 protein binding; • protein heterodimerization activity; • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • transcription factor binding; • sequence-specific DNA binding; • sequence-specific double-stranded DNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • клітинне ядро; • Ядерні тільця;
Біологічний процес	• regulation of transcription, DNA-templated; • response to light stimulus; • ритмічний процес; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • circadian regulation of gene expression; • transcription, DNA-templated; • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • entrainment of circadian clock by photoperiod; • Циркадний ритм; • somitogenesis; • Notch signaling pathway; • Диференціація клітин; • regulation of neurogenesis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	8553
	20893
	ENSG00000134107
	ENSMUSG00000030103
	O14503
	O35185
	NM_003670
	NM_011498
	NP_003661
	NP_035628
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

BHLHE40 (англ. Basic helix-loop-helix family member e40) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 412 амінокислот, а молекулярна маса — 45 510[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MERIPSAQPP	PACLPKAPGL	EHGDLPGMYP	AHMYQVYKSR	RGIKRSEDSK
ETYKLPHRLI	EKKRRDRINE	CIAQLKDLLP	EHLKLTTLGH	LEKAVVLELT
LKHVKALTNL	IDQQQQKIIA	LQSGLQAGEL	SGRNVETGQE	MFCSGFQTCA
REVLQYLAKH	ENTRDLKSSQ	LVTHLHRVVS	ELLQGGTSRK	PSDPAPKVMD
FKEKPSSPAK	GSEGPGKNCV	PVIQRTFAHS	SGEQSGSDTD	TDSGYGGESE
KGDLRSEQPC	FKSDHGRRFT	MGERIGAIKQ	ESEEPPTKKN	RMQLSDDEGH
FTSSDLISSP	FLGPHPHQPP	FCLPFYLIPP	SATAYLPMLE	KCWYPTSVPV
LYPGLNASAA	ALSSFMNPDK	ISAPLLMPQR	LPSPLPAHPS	VDSSVLLQAL
KPIPPLNLET	KD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Ivanova A.V., Ivanov S.V., Danilkovitch-Miagkova A., Lerman M.I. (2001). Regulation of STRA13 by the von Hippel-Lindau tumor suppressor protein, hypoxia, and the UBC9/ubiquitin proteasome degradation pathway.. J. Biol. Chem. 276: 15306 — 15315. PubMed DOI:10.1074/jbc.M010516200
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432 — 12437. PubMed DOI:10.1073/pnas.1413825111
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage.. Cell Rep. 10: 1778 — 1791. PubMed DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1046 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
UniProt, O14503 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1046 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O14503 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.