CD38

CD38
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4TMF, 1YH3, 1ZVM, 2EF1, 2HCT, 2I65, 2I66, 2I67, 2O3Q, 2O3R, 2O3S, 2O3T, 2O3U, 2PGJ, 2PGL, 3DZF, 3DZG, 3DZH, 3DZI, 3DZJ, 3DZK, 3F6Y, 3I9M, 3I9N, 3OFS, 3RAJ, 3ROK, 3ROM, 3ROP, 3ROQ, 3U4H, 3U4I, 4CMH, 4F45, 4F46, 4OGW, 4XJS, 4XJT, 5F1K, 5F1O, 5F21
Ідентифікатори
Символи	CD38, ADPRC1, ADPRC 1, CD38 molecule
Зовнішні ІД	OMIM: 107270 MGI: 107474 HomoloGene: 1345 GeneCards: CD38
шифр КФ	2.4.99.20
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • hydrolase activity, acting on glycosyl bonds; • NAD(P)+ nucleosidase activity; • hydrolase activity; • NAD+ nucleotidase, cyclic ADP-ribose generating; • NAD+ nucleosidase activity; • phosphorus-oxygen lyase activity; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • cell surface; • Екзосома; • клітинне ядро; • клітинна мембрана; • basolateral plasma membrane; • secretory granule membrane;
Біологічний процес	• B cell receptor signaling pathway; • response to cytokine; • response to estradiol; • response to interleukin-1; • response to hypoxia; • response to retinoic acid; • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration; • response to progesterone; • female pregnancy; • negative regulation of apoptotic process; • response to hydroperoxide; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of cell growth; • positive regulation of B cell proliferation; • positive regulation of vasoconstriction; • long-term synaptic depression; • apoptotic signaling pathway; • response to hormone; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • Сигнальна трансдукція; • positive regulation of insulin secretion; • negative regulation of bone resorption; • NAD metabolic process; • positive regulation of cell population proliferation; • negative regulation of neuron projection development; • artery smooth muscle contraction;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	952
	12494
	ENSG00000004468
	ENSMUSG00000029084
	P28907
	P56528
	NM_001775
	NM_007646
	NP_001766
	NP_031672
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CD38 (англ. CD38 molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 300 амінокислот, а молекулярна маса — 34 328[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MANCEFSPVS	GDKPCCRLSR	RAQLCLGVSI	LVLILVVVLA	VVVPRWRQQW
SGPGTTKRFP	ETVLARCVKY	TEIHPEMRHV	DCQSVWDAFK	GAFISKHPCN
ITEEDYQPLM	KLGTQTVPCN	KILLWSRIKD	LAHQFTQVQR	DMFTLEDTLL
GYLADDLTWC	GEFNTSKINY	QSCPDWRKDC	SNNPVSVFWK	TVSRRFAEAA
CDVVHVMLNG	SRSKIFDKNS	TFGSVEVHNL	QPEKVQTLEA	WVIHGGREDS
RDLCQDPTIK	ELESIISKRN	IQFSCKNIYR	PDKFLQCVKN	PEDSSCTSEI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, гідролаз, рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з НАД, НАДФ. Локалізований у мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
States D.J., Walseth T.F., Lee H.C. (1992). Similarities in amino acid sequences of Aplysia ADP-ribosyl cyclase and human lymphocyte antigen CD38.. Trends Biochem. Sci. 17: 495 — 495. PubMed DOI:10.1016/0968-0004(92)90337-9
Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance.. Genome Biol. 5: R8.1 — R8.16. PubMed DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
Moreschi I., Bruzzone S., Melone L., De Flora A., Zocchi E. (2006). NAADP+ synthesis from cADPRP and nicotinic acid by ADP-ribosyl cyclases.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 345: 573 — 580. PubMed DOI:10.1016/j.bbrc.2006.04.096
Jackson D.G., Bell J.I. (1990). Isolation of a cDNA encoding the human CD38 (T10) molecule, a cell surface glycoprotein with an unusual discontinuous pattern of expression during lymphocyte differentiation.. J. Immunol. 144: 2811 — 2815. PubMed

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1667 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
UniProt, P28907 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1667 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P28907 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.