CDH2

CDH2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1NCG, 1NCH, 1NCI, 1NCJ, 1OP4, 2QVI, 3Q2W, 4NUM, 4NUP, 4NUQ
Ідентифікатори
Символи	CDH2, CD325, CDHN, CDw325, NCAD, cadherin 2, ACOGS, ARVD14
Зовнішні ІД	OMIM: 114020 MGI: 88355 HomoloGene: 20424 GeneCards: CDH2
Пов'язані генетичні захворювання
	ожиріння[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • gamma-catenin binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948 protein binding; • enzyme binding; • protein phosphatase binding; • alpha-catenin binding; • protein kinase binding; • beta-catenin binding; • identical protein binding; • cytoskeletal protein binding; • protein homodimerization activity; • cadherin binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • integral component of membrane; • мембрана; • intercalated disc; • cell-cell junction; • focal adhesion; • plasma membrane raft; • Адгезивні контакти; • клітинна мембрана; • синапс; • basolateral plasma membrane; • apical plasma membrane; • cortical actin cytoskeleton; • catenin complex; • fascia adherens; • Екзосома; • lamellipodium; • GO:0097483, GO:0097481 Постсинаптичне ущільнення; • Сарколема; • endoplasmic reticulum lumen; • cell surface; • Міжклітинні контакти; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • integral component of plasma membrane; • neuron projection; • apical part of cell; • collagen-containing extracellular matrix; • integral component of presynaptic active zone membrane; • integral component of postsynaptic specialization membrane;
Біологічний процес	• calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; • blood vessel morphogenesis; • homeostasis of number of cells; • positive regulation of muscle cell differentiation; • regulation of postsynaptic density protein 95 clustering; • glial cell differentiation; • neuroepithelial cell differentiation; • cell-cell adhesion mediated by cadherin; • radial glial cell differentiation; • neuronal stem cell population maintenance; • regulation of oligodendrocyte progenitor proliferation; • telencephalon development; • neuroligin clustering involved in postsynaptic membrane assembly; • positive regulation of synaptic vesicle clustering; • адгезія клітин; • regulation of signal transduction; • cerebral cortex development; • striated muscle cell differentiation; • adherens junction organization; • cell migration; • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway; • positive regulation of MAPK cascade; • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; • brain morphogenesis; • посттрансляційна модифікація; • cellular protein metabolic process; • protein localization to plasma membrane; • cell morphogenesis; • cell-cell junction assembly; • synapse assembly; • regulation of axonogenesis; • regulation of synaptic transmission, glutamatergic; • cell-cell adhesion;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	1000
	12558
	ENSG00000170558
	ENSMUSG00000024304
	P19022
	P15116
	NM_001308176; NM_001792
	NM_007664
	NP_001295105; NP_001783; NP_001783.2
	NP_031690
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CDH2 (англ. Cadherin 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 906 амінокислот, а молекулярна маса — 99 809[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MCRIAGALRT	LLPLLAALLQ	ASVEASGEIA	LCKTGFPEDV	YSAVLSKDVH
EGQPLLNVKF	SNCNGKRKVQ	YESSEPADFK	VDEDGMVYAV	RSFPLSSEHA
KFLIYAQDKE	TQEKWQVAVK	LSLKPTLTEE	SVKESAEVEE	IVFPRQFSKH
SGHLQRQKRD	WVIPPINLPE	NSRGPFPQEL	VRIRSDRDKN	LSLRYSVTGP
GADQPPTGIF	IINPISGQLS	VTKPLDREQI	ARFHLRAHAV	DINGNQVENP
IDIVINVIDM	NDNRPEFLHQ	VWNGTVPEGS	KPGTYVMTVT	AIDADDPNAL
NGMLRYRIVS	QAPSTPSPNM	FTINNETGDI	ITVAAGLDRE	KVQQYTLIIQ
ATDMEGNPTY	GLSNTATAVI	TVTDVNDNPP	EFTAMTFYGE	VPENRVDIIV
ANLTVTDKDQ	PHTPAWNAVY	RISGGDPTGR	FAIQTDPNSN	DGLVTVVKPI
DFETNRMFVL	TVAAENQVPL	AKGIQHPPQS	TATVSVTVID	VNENPYFAPN
PKIIRQEEGL	HAGTMLTTFT	AQDPDRYMQQ	NIRYTKLSDP	ANWLKIDPVN
GQITTIAVLD	RESPNVKNNI	YNATFLASDN	GIPPMSGTGT	LQIYLLDIND
NAPQVLPQEA	ETCETPDPNS	INITALDYDI	DPNAGPFAFD	LPLSPVTIKR
NWTITRLNGD	FAQLNLKIKF	LEAGIYEVPI	IITDSGNPPK	SNISILRVKV
CQCDSNGDCT	DVDRIVGAGL	GTGAIIAILL	CIIILLILVL	MFVVWMKRRD
KERQAKQLLI	DPEDDVRDNI	LKYDEEGGGE	EDQDYDLSQL	QQPDTVEPDA
IKPVGIRRMD	ERPIHAEPQY	PVRSAAPHPG	DIGDFINEGL	KAADNDPTAP
PYDSLLVFDY	EGSGSTAGSL	SSLNSSSSGG	EQDYDYLNDW	GPRFKKLADM
YGGGDD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах.

Література

Reid R.A., Hemperly J.J. (1990). Human N-cadherin: nucleotide and deduced amino acid sequence.. Nucleic Acids Res. 18: 5896 — 5896. PubMed DOI:10.1093/nar/18.19.5896
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Wallis J.A., Fox M., Walsh F.S. (1994). Structure of the human N-cadherin gene: YAC analysis and fine chromosomal mapping to 18q11.2.. Genomics 22: 172 — 179. PubMed DOI:10.1006/geno.1994.1358
Bhatt A.S., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Craik C.S., Moasser M.M. (2005). Adhesion signaling by a novel mitotic substrate of src kinases.. Oncogene 24: 5333 — 5343. PubMed DOI:10.1038/sj.onc.1208582
Salomon D., Ayalon O., Patel-King R., Hynes R.O., Geiger B. (1992). Extrajunctional distribution of N-cadherin in cultured human endothelial cells.. J. Cell Sci. 102: 7 — 17. PubMed

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з CDH2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1759 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, P19022 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 18

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з CDH2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1759 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P19022 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.