CEBPE

CEBPE
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3T92
Ідентифікатори
Символи	CEBPE, C/EBP-epsilon, CRP1, CCAAT/enhancer binding protein epsilon, CCAAT enhancer binding protein epsilon, c/EBP epsilon
Зовнішні ІД	OMIM: 600749 MGI: 103572 HomoloGene: 1367 GeneCards: CEBPE
Пов'язані генетичні захворювання
	Гострий лімфобластний лейкоз, lymphoblastic leukemia[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein heterodimerization activity; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • protein homodimerization activity; • GO:0001948 protein binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• Нуклеоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• defense response; • myeloid cell differentiation; • positive regulation of gene expression; • cellular response to lipopolysaccharide; • regulation of transcription, DNA-templated; • defense response to bacterium; • transcription, DNA-templated; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • macrophage differentiation; • Фагоцитоз; • transcription by RNA polymerase II; • granulocyte differentiation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	1053
	110794
	ENSG00000092067
	ENSMUSG00000052435
	Q15744
	Q6PZD9
	NM_001805
	NM_207131
	NP_001796
	NP_997014
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CEBPE (англ. CCAAT/enhancer binding protein epsilon) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 281 амінокислот, а молекулярна маса — 30 603[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSHGTYYECE	PRGGQQPLEF	SGGRAGPGEL	GDMCEHEASI	DLSAYIESGE
EQLLSDLFAV	KPAPEARGLK	GPGTPAFPHY	LPPDPRPFAY	PPHTFGPDRK
ALGPGIYSSP	GSYDPRAVAV	KEEPRGPEGS	RAASRGSYNP	LQYQVAHCGQ
TAMHLPPTLA	APGQPLRVLK	APLATAAPPC	SPLLKAPSPA	GPLHKGKKAV
NKDSLEYRLR	RERNNIAVRK	SRDKAKRRIL	ETQQKVLEYM	AENERLRSRV
EQLTQELDTL	RNLFRQIPEA	ANLIKGVGGC	S

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Antonson P., Stellan B., Yamanaka R., Xanthopoulos K.G. (1996). A novel human CCAAT/enhancer binding protein gene, C/EBPepsilon, is expressed in cells of lymphoid and myeloid lineages and is localized on chromosome 14q11.2 close to the T-cell receptor alpha/delta locus.. Genomics 35: 30 — 38. PubMed DOI:10.1006/geno.1996.0319
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з CEBPE переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1836 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, Q15744 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 14

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з CEBPE переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1836 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q15744 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.