CIITA

CIITA
Ідентифікатори
Символи	CIITA, C2TA, CIITAIV, MHC2TA, NLRA, class II, major histocompatibility complex, transactivator, class II major histocompatibility complex transactivator
Зовнішні ІД	OMIM: 600005 MGI: 108445 HomoloGene: 207 GeneCards: CIITA
Пов'язані генетичні захворювання
	неспецифічний виразковий коліт[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • DNA binding; • nucleotide binding; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • GTP binding; • kinase activity; • protein C-terminus binding; • GO:0001948 protein binding; • acyltransferase activity; • ATP binding; • GO:0032403 protein-containing complex binding;
Клітинна компонента	• PML body; • Нуклеоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• positive regulation of MHC class II biosynthetic process; • regulation of transcription, DNA-templated; • response to interferon-gamma; • фосфорилювання; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • response to antibiotic; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • Імунна відповідь; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of MHC class I biosynthetic process; • negative regulation of collagen biosynthetic process; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • inflammatory response;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	4261
	12265
	ENSG00000179583
	ENSMUSG00000022504
	P33076
	P79621
NM_000246; NM_001286402; NM_001286403; NM_001379330; NM_001379331;
	NM_001379332; NM_001379333; NM_001379334
	NM_001243760; NM_001243761; NM_007575; NM_001302618; NM_001302619
NP_000237; NP_001273331; NP_001273332; NP_001366259; NP_001366260;
	NP_001366261; NP_001366262; NP_001366263
	NP_001230689; NP_001230690; NP_001289547; NP_001289548; NP_031601
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CIITA (англ. Class II major histocompatibility complex transactivator) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 130 амінокислот, а молекулярна маса — 123 514[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRCLAPRPAG	SYLSEPQGSS	QCATMELGPL	EGGYLELLNS	DADPLCLYHF
YDQMDLAGEE	EIELYSEPDT	DTINCDQFSR	LLCDMEGDEE	TREAYANIAE
LDQYVFQDSQ	LEGLSKDIFK	HIGPDEVIGE	SMEMPAEVGQ	KSQKRPFPEE
LPADLKHWKP	AEPPTVVTGS	LLVRPVSDCS	TLPCLPLPAL	FNQEPASGQM
RLEKTDQIPM	PFSSSSLSCL	NLPEGPIQFV	PTISTLPHGL	WQISEAGTGV
SSIFIYHGEV	PQASQVPPPS	GFTVHGLPTS	PDRPGSTSPF	APSATDLPSM
PEPALTSRAN	MTEHKTSPTQ	CPAAGEVSNK	LPKWPEPVEQ	FYRSLQDTYG
AEPAGPDGIL	VEVDLVQARL	ERSSSKSLER	ELATPDWAER	QLAQGGLAEV
LLAAKEHRRP	RETRVIAVLG	KAGQGKSYWA	GAVSRAWACG	RLPQYDFVFS
VPCHCLNRPG	DAYGLQDLLF	SLGPQPLVAA	DEVFSHILKR	PDRVLLILDG
FEELEAQDGF	LHSTCGPAPA	EPCSLRGLLA	GLFQKKLLRG	CTLLLTARPR
GRLVQSLSKA	DALFELSGFS	MEQAQAYVMR	YFESSGMTEH	QDRALTLLRD
RPLLLSHSHS	PTLCRAVCQL	SEALLELGED	AKLPSTLTGL	YVGLLGRAAL
DSPPGALAEL	AKLAWELGRR	HQSTLQEDQF	PSADVRTWAM	AKGLVQHPPR
AAESELAFPS	FLLQCFLGAL	WLALSGEIKD	KELPQYLALT	PRKKRPYDNW
LEGVPRFLAG	LIFQPPARCL	GALLGPSAAA	SVDRKQKVLA	RYLKRLQPGT
LRARQLLELL	HCAHEAEEAG	IWQHVVQELP	GRLSFLGTRL	TPPDAHVLGK
ALEAAGQDFS	LDLRSTGICP	SGLGSLVGLS	CVTRFRAALS	DTVALWESLQ
QHGETKLLQA	AEEKFTIEPF	KAKSLKDVED	LGKLVQTQRT	RSSSEDTAGE
LPAVRDLKKL	EFALGPVSGP	QAFPKLVRIL	TAFSSLQHLD	LDALSENKIG
DEGVSQLSAT	FPQLKSLETL	NLSQNNITDL	GAYKLAEALP	SLAASLLRLS
LYNNCICDVG	AESLARVLPD	MVSLRVMDVQ	YNKFTAAGAQ	QLAASLRRCP
HVETLAMWTP	TIPFSVQEHL	QQQDSRISLR

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, активаторів, ацилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у ядрі.

Література

Steimle V., Otten L.A., Zufferey M., Mach B. (1993). Complementation cloning of an MHC class II transactivator mutated in hereditary MHC class II deficiency (or bare lymphocyte syndrome).. Cell 75: 135 — 146. PubMed DOI:10.1016/S0092-8674(05)80090-X
Riley J.L., Westerheide S.D., Price J.A., Brown J.A., Boss J.M. (1995). Activation of class II MHC genes requires both the X box region and the class II transactivator (CIITA).. Immunity 2: 533 — 543. PubMed DOI:10.1016/1074-7613(95)90033-0
Day N.E., Ugai H., Yokoyama K.K., Ichiki A.T. (2003). K-562 cells lack MHC class II expression due to an alternatively spliced CIITA transcript with a truncated coding region.. Leuk. Res. 27: 1027 — 1038. PubMed DOI:10.1016/S0145-2126(03)00072-9
Harton J.A., Cressman D.E., Chin K.C., Der C.J., Ting J.P. (1999). GTP binding by class II transactivator: role in nuclear import.. Science 285: 1402 — 1405. PubMed DOI:10.1126/science.285.5432.1402
Soe K.C., Devaiah B.N., Singer D.S. (2013). Transcriptional coactivator CIITA, a functional homolog of TAF1, has kinase activity.. Biochim. Biophys. Acta 1829: 1184 — 1190. PubMed DOI:10.1016/j.bbagrm.2013.09.001
Quan V., Towey M., Sacks S., Kelly A.P. (1999). Absence of MHC class II gene expression in a patient with a single amino acid substitution in the class II transactivator protein CIITA.. Immunogenetics 49: 957 — 963. PubMed DOI:10.1007/s002510050579

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з CIITA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7067 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, P33076 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з CIITA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7067 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P33076 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.