CITED2

CITED2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1P4Q, 1R8U
Ідентифікатори
Символи	CITED2, ASD8, MRG-1, MRG1, P35SRJ, VSD2, Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2
Зовнішні ІД	OMIM: 602937 MGI: 1306784 HomoloGene: 4433 GeneCards: CITED2
Пов'язані генетичні захворювання
	atrial heart septal defect 8[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001105 transcription coactivator activity; • GO:0001106 transcription corepressor activity; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • chromatin binding; • LBD domain binding; • GO:0001948 protein binding; • histone acetyltransferase binding; • protein domain specific binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • клітинне ядро; • Нуклеоплазма; • protein-containing complex;
Біологічний процес	• nodal signaling pathway involved in determination of lateral mesoderm left/right asymmetry; • adrenal cortex formation; • positive regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway; • Диференціація клітин; • response to hypoxia; • regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of cell-cell adhesion; • embryonic heart tube left/right pattern formation; • ventricular septum morphogenesis; • outflow tract morphogenesis; • negative regulation of apoptotic process; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • spleen development; • negative regulation of gene expression; • transcription, DNA-templated; • response to fluid shear stress; • response to estrogen; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • multicellular organism development; • heart development; • determination of left/right symmetry; • positive regulation of gene expression; • negative regulation of cell migration; • positive regulation of cell cycle; • regulation of animal organ formation; • sex determination; • positive regulation of peroxisome proliferator activated receptor signaling pathway; • liver development; • left/right pattern formation; • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia; • проліферація; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • left/right axis specification; • positive regulation of male gonad development; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of nucleic acid-templated transcription; • regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	10370
	17684
	ENSG00000164442
	ENSMUSG00000039910
	Q99967
	O35740
	NM_006079; NM_001168388; NM_001168389
	NM_010828
	NP_001161860; NP_001161861; NP_006070
	NP_034958
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CITED2 (англ. Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 270 амінокислот, а молекулярна маса — 28 497[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MADHMMAMNH	GRFPDGTNGL	HHHPAHRMGM	GQFPSPHHHQ	QQQPQHAFNA
LMGEHIHYGA	GNMNATSGIR	HAMGPGTVNG	GHPPSALAPA	ARFNNSQFMG
PPVASQGGSL	PASMQLQKLN	NQYFNHHPYP	HNHYMPDLHP	AAGHQMNGTN
QHFRDCNPKH	SGGSSTPGGS	GGSSTPGGSG	SSSGGGAGSS	NSGGGSGSGN
MPASVAHVPA	AMLPPNVIDT	DFIDEEVLMS	LVIEMGLDRI	KELPELWLGQ
NEFDFMTDFV	CKQQPSRVSC

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як відповідь на стрес, транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

Shioda T., Fenner M.H., Isselbacher K.J. (1996). msg1, a novel melanocyte-specific gene, encodes a nuclear protein and is associated with pigmentation.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 12298 — 12303. PubMed DOI:10.1073/pnas.93.22.12298
Leung M.K., Jones T., Michels C.L., Livingston D.M., Bhattacharya S. (1999). Molecular cloning and chromosomal localization of the human CITED2 gene encoding p35srj/Mrg1.. Genomics 61: 307 — 313. PubMed DOI:10.1006/geno.1999.5970
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Tien E.S., Davis J.W., Vanden Heuvel J.P. (2004). Identification of the CREB-binding protein/p300-interacting protein CITED2 as a peroxisome proliferator-activated receptor alpha coregulator.. J. Biol. Chem. 279: 24053 — 24063. PubMed DOI:10.1074/jbc.M401489200
De Guzman R.N., Martinez-Yamout M.A., Dyson H.J., Wright P.E. (2004). Interaction of the TAZ1 domain of the CREB-binding protein with the activation domain of CITED2: regulation by competition between intrinsically unstructured ligands for non-identical binding sites.. J. Biol. Chem. 279: 3042 — 3049. PubMed DOI:10.1074/jbc.M310348200

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з CITED2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1987 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
UniProt, Q99967 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з CITED2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1987 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q99967 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.