CSF2RA

CSF2RA
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4NKQ, 4RS1
Ідентифікатори
Символи	CSF2RA, CD116, CDw116, CSF2R, CSF2RAX, CSF2RAY, CSF2RX, CSF2RY, GM-CSF-R-alpha, GMCSFR, GMR, SMDP4, colony stimulating factor 2 receptor alpha subunit, alphaGMR, colony stimulating factor 2 receptor subunit alpha, GMR-alpha, GMCSFR-alpha, granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor
Зовнішні ІД	OMIM: 425000, 306250 MGI: 1339754 HomoloGene: 48406 GeneCards: CSF2RA
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948 protein binding; • cytokine receptor activity; • protein tyrosine kinase activity; • signaling receptor activity; • cytokine binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • extracellular region; • внутрішньоклітинний; • external side of plasma membrane; • receptor complex;
Біологічний процес	• cellular protein metabolic process; • MAPK cascade; • peptidyl-tyrosine phosphorylation; • cytokine-mediated signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	1438
	12982
	ENSG00000198223
	ENSMUSG00000059326
	P15509
	Q00941
NM_001161529; NM_001161530; NM_001161531; NM_001161532; NM_006140;
	NM_172245; NM_172246; NM_172247; NM_172248; NM_172249; NM_001379153; NM_001379154; NM_001379155; NM_001379156; NM_001379158; NM_001379159; NM_001379160; NM_001379161; NM_001379162; NM_001379163; NM_001379164; NM_001379165; NM_001379166; NM_001379167; NM_001379168; NM_001379169
	NM_009970
NP_001155001; NP_001155002; NP_001155003; NP_001155004; NP_006131;
	NP_758448; NP_758449; NP_758450; NP_758452; NP_001366082; NP_001366083; NP_001366084; NP_001366085; NP_001366087; NP_001366088; NP_001366089; NP_001366090; NP_001366091; NP_001366092; NP_001366093; NP_001366094; NP_001366095; NP_001366096; NP_001366097; NP_001366098
	NP_034100
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CSF2RA (англ. Colony stimulating factor 2 receptor alpha subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 400 амінокислот, а молекулярна маса — 46 207[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLLLVTSLLL	CELPHPAFLL	IPEKSDLRTV	APASSLNVRF	DSRTMNLSWD
CQENTTFSKC	FLTDKKNRVV	EPRLSNNECS	CTFREICLHE	GVTFEVHVNT
SQRGFQQKLL	YPNSGREGTA	AQNFSCFIYN	ADLMNCTWAR	GPTAPRDVQY
FLYIRNSKRR	REIRCPYYIQ	DSGTHVGCHL	DNLSGLTSRN	YFLVNGTSRE
IGIQFFDSLL	DTKKIERFNP	PSNVTVRCNT	THCLVRWKQP	RTYQKLSYLD
FQYQLDVHRK	NTQPGTENLL	INVSGDLENR	YNFPSSEPRA	KHSVKIRAAD
VRILNWSSWS	EAIEFGSDDG	NLGSVYIYVL	LIVGTLVCGI	VLGFLFKRFL
RIQRLFPPVP	QIKDKLNDNH	EVEDEIIWEE	FTPEEGKGYR	EEVLTVKEIT

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

Crosier K.E., Wong G.G., Mathey-Prevot B., Nathan D.G., Sieff C.A. (1991). A functional isoform of the human granulocyte/macrophage colony-stimulating factor receptor has an unusual cytoplasmic domain.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 7744 — 7748. PubMed DOI:10.1073/pnas.88.17.7744
Ashworth A., Kraft A. (1990). Cloning of a potentially soluble receptor for human GM-CSF.. Nucleic Acids Res. 18: 7178 — 7178. PubMed DOI:10.1093/nar/18.23.7178
Hu X., Emanuel P.D., Zuckerman K.S. (1994). Cloning and sequencing of the cDNAs encoding two alternative splicing-derived variants of the alpha subunit of the granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor.. Biochim. Biophys. Acta 1223: 306 — 308. PubMed DOI:10.1016/0167-4889(94)90241-0
Pelley J.L., Nicholls C.D., Beattie T.L., Brown C.B. (2007). Discovery and characterization of a novel splice variant of the GM-CSF receptor alpha subunit.. Exp. Hematol. 35: 1483 — 1494. PubMed DOI:10.1016/j.exphem.2007.06.008
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Rappold G., Willson T.A., Henke A., Gough N.M. (1992). Arrangement and localization of the human GM-CSF receptor alpha chain gene CSF2RA within the X-Y pseudoautosomal region.. Genomics 14: 455 — 461. PubMed DOI:10.1016/S0888-7543(05)80241-1

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2435 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, P15509 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома X

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2435 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P15509 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.