CTSB

CTSB
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3PBH, 1CSB, 1GMY, 1HUC, 1PBH, 2IPP, 2PBH, 3AI8, 3CBJ, 3CBK, 3K9M
Ідентифікатори
Символи	CTSB, APPS, CPSB, cathepsin B, RECEUP
Зовнішні ІД	OMIM: 116810 MGI: 88561 HomoloGene: 37550 GeneCards: CTSB
Онтологія гена
Молекулярна функція	• cysteine-type peptidase activity; • collagen binding; • peptidase activity; • GO:0001948 protein binding; • cysteine-type endopeptidase activity; • hydrolase activity; • proteoglycan binding; • serine-type endopeptidase activity; • endopeptidase activity;
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинна мембранна органела; • Меланосома; • внутрішньоклітинний; • extracellular region; • endolysosome lumen; • Ядерце; • мітохондрія; • Лізосома; • Екзосома; • perinuclear region of cytoplasm; • extracellular space; • ficolin-1-rich granule lumen; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• regulation of apoptotic process; • epithelial cell differentiation; • Протеоліз; • toll-like receptor signaling pathway; • decidualization; • cellular response to thyroid hormone stimulus; • collagen catabolic process; • viral entry into host cell; • GO:0048552 regulation of catalytic activity; • proteolysis involved in cellular protein catabolic process; • neutrophil degranulation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	1508
	13030
	ENSG00000164733; ENSG00000285132
	ENSMUSG00000021939
	P07858
	P10605
NM_001908; NM_147780; NM_147781; NM_147782; NM_147783;
	NM_001317237
	NM_007798
NP_001304166; NP_001899; NP_680090; NP_680091; NP_680092;
	NP_680093
	NP_031824
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CTSB (англ. Cathepsin B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 339 амінокислот, а молекулярна маса — 37 822[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MWQLWASLCC	LLVLANARSR	PSFHPLSDEL	VNYVNKRNTT	WQAGHNFYNV
DMSYLKRLCG	TFLGGPKPPQ	RVMFTEDLKL	PASFDAREQW	PQCPTIKEIR
DQGSCGSCWA	FGAVEAISDR	ICIHTNAHVS	VEVSAEDLLT	CCGSMCGDGC
NGGYPAEAWN	FWTRKGLVSG	GLYESHVGCR	PYSIPPCEHH	VNGSRPPCTG
EGDTPKCSKI	CEPGYSPTYK	QDKHYGYNSY	SVSNSEKDIM	AEIYKNGPVE
GAFSVYSDFL	LYKSGVYQHV	TGEMMGGHAI	RILGWGVENG	TPYWLVANSW
NTDWGDNGFF	KILRGQDHCG	IESEVVAGIP	RTDQYWEKI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Локалізований у лізосомі. Також секретований назовні.

Література

Chan S.J., San Segundo B., McCormick M.B., Steiner D.F. (1986). Nucleotide and predicted amino acid sequences of cloned human and mouse preprocathepsin B cDNAs.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83: 7721 — 7725. PubMed DOI:10.1073/pnas.83.20.7721
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Ritonja A., Popovic T., Turk V., Wiedenmann K., Machleidt W. (1985). Amino acid sequence of human liver cathepsin B.. FEBS Lett. 181: 169 — 172. PubMed DOI:10.1016/0014-5793(85)81136-4
Fong D., Calhoun D.H., Hsieh W.-T., Lee B., Wells R.D. (1986). Isolation of a cDNA clone for the human lysosomal proteinase cathepsin B.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83: 2909 — 2913. PubMed DOI:10.1073/pnas.83.9.2909
Turk D., Podobnik M., Kuhelj R., Dolinar M., Turk V. (1996). Crystal structures of human procathepsin B at 3.2- and 3.3-A resolution reveal an interaction motif between a papain-like cysteine protease and its propeptide.. FEBS Lett. 384: 211 — 214. PubMed DOI:10.1016/0014-5793(96)00309-2
Podobnik M., Kuhelj R., Turk V., Turk D. (1997). Crystal structure of the wild-type human procathepsin B at 2.5-A resolution reveals the native active site of a papain-like cysteine protease zymogen.. J. Mol. Biol. 271: 774 — 788. PubMed DOI:10.1006/jmbi.1997.1218

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2527 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.
UniProt, P07858 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 8

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2527 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P07858 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.