CX3CL1

CX3CL1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1B2T, 1F2L, 3ONA, 4XT1, 4XT3
Ідентифікатори
Символи	CX3CL1, ABCD-3, C3Xkine, CXC3, CXC3C, NTN, NTT, SCYD1, fractalkine, neurotactin, C-X3-C motif chemokine ligand 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601880 MGI: 1097153 HomoloGene: 2251 GeneCards: CX3CL1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• cytokine activity; • chemokine activity; • GO:0001948 protein binding; • CCR chemokine receptor binding; • signaling receptor binding; • integrin binding; • CX3C chemokine receptor binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • клітинна мембрана; • extracellular region; • cell surface; • extracellular space;
Біологічний процес	• G protein-coupled receptor signaling pathway; • defense response; • positive regulation of inflammatory response; • monocyte chemotaxis; • cytokine-mediated signaling pathway; • chemokine-mediated signaling pathway; • angiogenesis involved in wound healing; • cellular response to tumor necrosis factor; • Загоєння ран; • leukocyte chemotaxis; • neutrophil chemotaxis; • positive regulation of angiogenesis; • positive regulation of transforming growth factor beta1 production; • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity; • Адгезія клітин; • Імунна відповідь; • cellular response to interleukin-1; • leukocyte adhesive activation; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • cellular response to interferon-gamma; • cell chemotaxis; • lymphocyte chemotaxis; • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand; • positive regulation of calcium-independent cell-cell adhesion; • хемотаксис; • integrin activation; • negative regulation of cell migration; • leukocyte migration involved in inflammatory response; • macrophage chemotaxis; • regulation of signaling receptor activity;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	6376
	20312
	ENSG00000006210
	ENSMUSG00000031778
	P78423
	O35188
	NM_002996; NM_001304392
	NM_009142
	NP_001291321; NP_002987
	NP_033168
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CX3CL1 (англ. C-X3-C motif chemokine ligand 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 397 амінокислот, а молекулярна маса — 42 203[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAPISLSWLL	RLATFCHLTV	LLAGQHHGVT	KCNITCSKMT	SKIPVALLIH
YQQNQASCGK	RAIILETRQH	RLFCADPKEQ	WVKDAMQHLD	RQAAALTRNG
GTFEKQIGEV	KPRTTPAAGG	MDESVVLEPE	ATGESSSLEP	TPSSQEAQRA
LGTSPELPTG	VTGSSGTRLP	PTPKAQDGGP	VGTELFRVPP	VSTAATWQSS
APHQPGPSLW	AEAKTSEAPS	TQDPSTQAST	ASSPAPEENA	PSEGQRVWGQ
GQSPRPENSL	EREEMGPVPA	HTDAFQDWGP	GSMAHVSVVP	VSSEGTPSRE
PVASGSWTPK	AEEPIHATMD	PQRLGVLITP	VPDAQAATRR	QAVGLLAFLG
LLFCLGVAMF	TYQSLQGCPR	KMAGEMAEGL	RYIPRSCGSN	SYVLVPV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, хемотаксис. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Halim A., Nilsson J., Ruetschi U., Hesse C., Larson G. (2011). Human urinary glycoproteomics; attachment site specific analysis of N-and O-linked glycosylations by CID and ECD.. Mol. Cell. Proteomics: —. PubMed DOI:10.1074/mcp.M111.013649
Fujita M., Takada Y.K., Takada Y. (2012). Integrins alphavbeta3 and alpha4beta1 act as coreceptors for fractalkine, and the integrin-binding defective mutant of fractalkine is an antagonist of CX3CR1.. J. Immunol. 189: 5809 — 5819. PubMed DOI:10.4049/jimmunol.1200889
Fujita M., Takada Y.K., Takada Y. (2014). The chemokine fractalkine can activate integrins without CX3CR1 through direct binding to a ligand-binding site distinct from the classical RGD-binding site.. PLoS ONE 9: E96372 — E96372. PubMed DOI:10.1371/journal.pone.0096372
Mizoue L.S., Bazan J.F., Johnson E.C., Handel T.M. (1999). Solution structure and dynamics of the CX3C chemokine domain of fractalkine and its interaction with an N-terminal fragment of CX3CR1.. Biochemistry 38: 1402 — 1414. PubMed DOI:10.1021/bi9820614
Hoover D.M., Mizoue L.S., Handel T.M., Lubkowski J. (2000). The crystal structure of the chemokine domain of fractalkine shows a novel quaternary arrangement.. J. Biol. Chem. 275: 23187 — 23193. PubMed DOI:10.1074/jbc.M002584200

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10647 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, P78423 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10647 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P78423 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.