DCN

DCN
Ідентифікатори
Символи	DCN, Dcn, DC, DSPG2, PG40, PGII, PGS2, SLRR1B, mDcn, CSCD, decorin
Зовнішні ІД	OMIM: 125255 MGI: 94872 HomoloGene: 22430 GeneCards: DCN
Пов'язані генетичні захворювання
	congenital stromal corneal dystrophy[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• collagen binding; • protein N-terminus binding; • protein kinase inhibitor activity; • glycosaminoglycan binding; • extracellular matrix binding; • GO:0001948 protein binding; • RNA binding; • extracellular matrix structural constituent conferring compression resistance;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • lysosomal lumen; • Golgi lumen; • collagen type VI trimer; • extracellular space; • extracellular region; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• glycosaminoglycan metabolic process; • positive regulation of mitochondrial fission; • negative regulation of protein kinase activity; • positive regulation of autophagy; • kidney development; • cytokine-mediated signaling pathway; • placenta development; • chondroitin sulfate biosynthetic process; • response to mechanical stimulus; • старіння людини; • extracellular matrix disassembly; • extracellular matrix organization; • Загоєння ран; • negative regulation of endothelial cell migration; • positive regulation of macroautophagy; • response to lipopolysaccharide; • positive regulation of mitochondrial depolarization; • animal organ morphogenesis; • chondroitin sulfate catabolic process; • negative regulation of angiogenesis; • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling; • peptide cross-linking via chondroitin 4-sulfate glycosaminoglycan; • negative regulation of vascular endothelial growth factor signaling pathway; • dermatan sulfate biosynthetic process; • skeletal muscle tissue development; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	1634
	13179
	ENSG00000011465
	ENSMUSG00000019929
	P07585
	P28654
NM_001920; NM_133503; NM_133504; NM_133505; NM_133506;
	NM_133507
	NM_001190451; NM_007833
NP_001911; NP_598010; NP_598011; NP_598012; NP_598013;
	NP_598014
	NP_001177380; NP_031859
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

DCN (англ. Decorin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 359 амінокислот, а молекулярна маса — 39 747[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKATIILLLL	AQVSWAGPFQ	QRGLFDFMLE	DEASGIGPEV	PDDRDFEPSL
GPVCPFRCQC	HLRVVQCSDL	GLDKVPKDLP	PDTTLLDLQN	NKITEIKDGD
FKNLKNLHAL	ILVNNKISKV	SPGAFTPLVK	LERLYLSKNQ	LKELPEKMPK
TLQELRAHEN	EITKVRKVTF	NGLNQMIVIE	LGTNPLKSSG	IENGAFQGMK
KLSYIRIADT	NITSIPQGLP	PSLTELHLDG	NKISRVDAAS	LKGLNNLAKL
GLSFNSISAV	DNGSLANTPH	LRELHLDNNK	LTRVPGGLAE	HKYIQVVYLH
NNNISVVGSS	DFCPPGHNTK	KASYSGVSLF	SNPVQYWEIQ	PSTFRCVYVR
SAIQLGNYK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

Krusius T., Ruoslahti E. (1986). Primary structure of an extracellular matrix proteoglycan core protein deduced from cloned cDNA.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83: 7683 — 7687. PubMed DOI:10.1073/pnas.83.20.7683
Vetter U., Vogel W., Just W., Young M.F., Fisher L.W. (1993). Human decorin gene: intron-exon junctions and chromosomal localization.. Genomics 15: 161 — 168. PubMed DOI:10.1006/geno.1993.1023
Danielson K.G., Fazzio A., Cohen I.R., Cannizzaro L., Iozzo R.V. (1993). The human decorin gene: intron-exon organization, discovery of two alternatively spliced exons in the 5' untranslated region, and mapping of the gene to chromosome 12q23.. Genomics 15: 146 — 160. PubMed DOI:10.1006/geno.1993.1022
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Roughley P.J., White R.J. (1989). Dermatan sulphate proteoglycans of human articular cartilage. The properties of dermatan sulphate proteoglycans I and II.. Biochem. J. 262: 823 — 827. PubMed DOI:10.1042/bj2620823
Bredrup C., Knappskog P.M., Majewski J., Rodahl E., Boman H. (2005). Congenital stromal dystrophy of the cornea caused by a mutation in the decorin gene.. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 46: 420 — 426. PubMed DOI:10.1167/iovs.04-0804

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з DCN переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2705 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, P07585 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з DCN переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2705 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P07585 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.