DDR1

DDR1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3ZOS, 4AG4, 4BKJ, 4CKR, 5BVK, 5BVN, 5BVO, 5BVW, 5FDP
Ідентифікатори
Символи	DDR1, CAK, CD167, DDR, EHGK2, MCK10, NEP, NTRK4, PTK3, PTK3A, RTK6, TRKE, discoidin domain receptor tyrosine kinase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600408 MGI: 99216 HomoloGene: 68212 GeneCards: DDR1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • nucleotide binding; • protein kinase activity; • collagen binding; • зв'язування з іоном металу; • kinase activity; • GO:0001948 protein binding; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity; • protein tyrosine kinase collagen receptor activity; • protein tyrosine kinase activity; • ATP binding; • receptor tyrosine kinase;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • receptor complex; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • extracellular region; • Екзосома; • extracellular space;
Біологічний процес	• collagen-activated tyrosine kinase receptor signaling pathway; • branching involved in mammary gland duct morphogenesis; • фосфорилювання; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway; • female pregnancy; • extracellular matrix organization; • ear development; • mammary gland alveolus development; • regulation of extracellular matrix disassembly; • smooth muscle cell migration; • smooth muscle cell-matrix adhesion; • regulation of cell-matrix adhesion; • protein phosphorylation; • Адгезія клітин; • regulation of cell growth; • peptidyl-tyrosine phosphorylation; • Лактація; • wound healing, spreading of cells; • embryo implantation; • negative regulation of cell population proliferation; • peptidyl-tyrosine autophosphorylation; • protein autophosphorylation; • axon development; • neuron projection extension; • cell-matrix adhesion; • positive regulation of cell population proliferation; • Диференціація клітин; • regulation of extracellular matrix organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	780
	12305
ENSG00000215522; ENSG00000137332; ENSG00000229767; ENSG00000230456; ENSG00000234078;
	ENSG00000204580; ENSG00000223680
	ENSMUSG00000003534
	Q08345
	Q03146
NM_001202521; NM_001202522; NM_001202523; NM_001297652; NM_001297653;
	NM_001297654; NM_001954; NM_013993; NM_013994
	NM_001198831; NM_001198833; NM_007584; NM_172962
NP_001189450; NP_001189451; NP_001189452; NP_001284581; NP_001284582;
	NP_001284583; NP_001945; NP_054699; NP_054700; NP_001284583.1; NP_054699.2
	NP_001185760; NP_001185762; NP_031610; NP_766550
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

DDR1 (англ. Discoidin domain receptor tyrosine kinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 913 амінокислот, а молекулярна маса — 101 128[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGPEALSSLL	LLLLVASGDA	DMKGHFDPAK	CRYALGMQDR	TIPDSDISAS
SSWSDSTAAR	HSRLESSDGD	GAWCPAGSVF	PKEEEYLQVD	LQRLHLVALV
GTQGRHAGGL	GKEFSRSYRL	RYSRDGRRWM	GWKDRWGQEV	ISGNEDPEGV
VLKDLGPPMV	ARLVRFYPRA	DRVMSVCLRV	ELYGCLWRDG	LLSYTAPVGQ
TMYLSEAVYL	NDSTYDGHTV	GGLQYGGLGQ	LADGVVGLDD	FRKSQELRVW
PGYDYVGWSN	HSFSSGYVEM	EFEFDRLRAF	QAMQVHCNNM	HTLGARLPGG
VECRFRRGPA	MAWEGEPMRH	NLGGNLGDPR	ARAVSVPLGG	RVARFLQCRF
LFAGPWLLFS	EISFISDVVN	NSSPALGGTF	PPAPWWPPGP	PPTNFSSLEL
EPRGQQPVAK	AEGSPTAILI	GCLVAIILLL	LLIIALMLWR	LHWRRLLSKA
ERRVLEEELT	VHLSVPGDTI	LINNRPGPRE	PPPYQEPRPR	GNPPHSAPCV
PNGSALLLSN	PAYRLLLATY	ARPPRGPGPP	TPAWAKPTNT	QAYSGDYMEP
EKPGAPLLPP	PPQNSVPHYA	EADIVTLQGV	TGGNTYAVPA	LPPGAVGDGP
PRVDFPRSRL	RFKEKLGEGQ	FGEVHLCEVD	SPQDLVSLDF	PLNVRKGHPL
LVAVKILRPD	ATKNARNDFL	KEVKIMSRLK	DPNIIRLLGV	CVQDDPLCMI
TDYMENGDLN	QFLSAHQLED	KAAEGAPGDG	QAAQGPTISY	PMLLHVAAQI
ASGMRYLATL	NFVHRDLATR	NCLVGENFTI	KIADFGMSRN	LYAGDYYRVQ
GRAVLPIRWM	AWECILMGKF	TTASDVWAFG	VTLWEVLMLC	RAQPFGQLTD
EQVIENAGEF	FRDQGRQVYL	SRPPACPQGL	YELMLRCWSR	ESEQRPPFSQ
LHRFLAEDAL	NTV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

Johnson J.D., Edman J.C., Rutter W.J. (1993). A receptor tyrosine kinase found in breast carcinoma cells has an extracellular discoidin I-like domain.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 5677 — 5681. PubMed DOI:10.1073/pnas.90.12.5677
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Weiner T.M., Liu E.T., Craven R.J., Cance W.G. (1994). Expression of growth factor receptors, the focal adhesion kinase, and other tyrosine kinases in human soft tissue tumors.. Ann. Surg. Oncol. 1: 18 — 27. PubMed DOI:10.1007/BF02303537
Vogel W., Gish G.D., Alves F., Pawson T. (1997). The discoidin domain receptor tyrosine kinases are activated by collagen.. Mol. Cell 1: 13 — 23. PubMed DOI:10.1016/S1097-2765(00)80003-9
Hou G., Vogel W.F., Bendeck M.P. (2002). Tyrosine kinase activity of discoidin domain receptor 1 is necessary for smooth muscle cell migration and matrix metalloproteinase expression.. Circ. Res. 90: 1147 — 1149. PubMed DOI:10.1161/01.RES.0000022166.74073.F8
Huang Y., Arora P., McCulloch C.A., Vogel W.F. (2009). The collagen receptor DDR1 regulates cell spreading and motility by associating with myosin IIA.. J. Cell Sci. 122: 1637 — 1646. PubMed DOI:10.1242/jcs.046219

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2730 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
UniProt, Q08345 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2730 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q08345 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.