DHH

DHH
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2WFQ, 2WFR, 2WG3, 3N1G, 3N1Q
Ідентифікатори
Символи	DHH, GDXYM, HHG-3, SRXY7, C78960, desert hedgehog, desert hedgehog signaling molecule, GDMN
Зовнішні ІД	OMIM: 605423 MGI: 94891 HomoloGene: 22431 GeneCards: DHH
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • zinc ion binding; • зв'язування з іоном металу; • patched binding; • peptidase activity; • GO:0001948 protein binding; • hydrolase activity;
Клітинна компонента	• мембрана; • клітинна мембрана; • extracellular region; • extracellular space;
Біологічний процес	• response to estradiol; • Leydig cell differentiation; • cell-cell signaling; • regulation of steroid biosynthetic process; • male sex determination; • Протеоліз; • response to estrogen; • multicellular organism development; • spermatid development; • myelination; • osteoblast differentiation; • smoothened signaling pathway; • cell fate specification; • Регуляція експресії генів;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	50846
	13363
	ENSG00000139549
	ENSMUSG00000023000
	O43323
	Q61488
	NM_021044
	NM_007857
	NP_066382
	NP_031883
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

DHH (англ. Desert hedgehog) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 396 амінокислот, а молекулярна маса — 43 577[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALLTNLLPL	CCLALLALPA	QSCGPGRGPV	GRRRYARKQL	VPLLYKQFVP
GVPERTLGAS	GPAEGRVARG	SERFRDLVPN	YNPDIIFKDE	ENSGADRLMT
ERCKERVNAL	AIAVMNMWPG	VRLRVTEGWD	EDGHHAQDSL	HYEGRALDIT
TSDRDRNKYG	LLARLAVEAG	FDWVYYESRN	HVHVSVKADN	SLAVRAGGCF
PGNATVRLWS	GERKGLRELH	RGDWVLAADA	SGRVVPTPVL	LFLDRDLQRR
ASFVAVETEW	PPRKLLLTPW	HLVFAARGPA	PAPGDFAPVF	ARRLRAGDSV
LAPGGDALRP	ARVARVAREE	AVGVFAPLTA	HGTLLVNDVL	ASCYAVLESH
QWAHRAFAPL	RLLHALGALL	PGGAVQPTGM	HWYSRLLYRL	AEELLG

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, білків розвитку. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Kavran J.M., Ward M.D., Oladosu O.O., Mulepati S., Leahy D.J. (2010). All mammalian Hedgehog proteins interact with cell adhesion molecule, down-regulated by oncogenes (CDO) and brother of CDO (BOC) in a conserved manner.. J. Biol. Chem. 285: 24584 — 24590. PubMed DOI:10.1074/jbc.M110.131680
Canto P., Soederlund D., Reyes E., Mendez J.P. (2004). Mutations in the desert hedgehog (DHH) gene in patients with 46,XY complete pure gonadal dysgenesis.. J. Clin. Endocrinol. Metab. 89: 4480 — 4483. PubMed DOI:10.1210/jc.2004-0863
Tate G., Kishimoto K., Mitsuya T. (2000). Expression of Sonic hedgehog and its receptor Patched/Smoothened in human cancer cell lines and embryonic organs.. J. Biochem. Mol. Biol. Biophys. 4: 27 — 34.
Canto P., Soederlund D., Reyes E., Mendez J.P. (2004). J. Clin. Endocrinol. Metab. 89: 5453 — 5453.

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2865 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, O43323 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2865 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O43323 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.